3.保税区的运作方式
基于海关和外汇的特殊管理机制，保税区形成了特殊的围绕四大基本功能的基本运作方式。
（1）保税仓储等保税物流运作方式
保税区内实行“境内关外”的政策，这样一来在保税区内形成相当宽松优惠的保税政策，即货物从海外进入保税区不视同进口，只有从保税区再进入国内其他区域时才视同进口，货物从国内到保税区视同出口，这样就形成了以保税仓储为核心内容的保税物流运作形式。
“三资”加工贸易企业可以利用保税区的物流功能，从保税区进口原村料，将半成品或成品出口保税区，完成加工贸易的核销工作，将各种转厂手续变成进出口手续，从而大大提高物流效率，节省物流成本，此外还可以将出口的产品进行内销而没有内销比例等审批限制。
在中国采购的国际企业可以将采购出口货物的配送中心设在保税区，直接对国外市场进行货物配送，从而解决销售地的高成本配送问题。
销售中国市场的进口货物可以先存储在保税区内，再根据实际的销售数量和形式进行货物清关工作，一方面可以减少供应链维系的资金积压成本（海关税金占用流动资金），另一方面可以适应中国企业的不同销售形式（免税销售和完税销售）。
（2）出口加工等加工运作方式
保税区的加工贸易企业不实行银行保证金台账，不实行外汇核销制度，非常有利于企业开展出口加工工作。
保税区内加工贸易企业使用的进口设备全部免税，不受项目内容限制和投资总额的限制。
（3）国际贸易等贸易运作形式
中国国内目前还不允许外资独资成立单纯贸易性企业，但在保税区可以成立，并可以取得一般纳税人的权利，拥有人民币账户、可开增值税发票，实际上已经拥有在国内从事纯贸易活动的权利，这是保税区的国内贸易功能。
目前国内的贸易性公司无法从事转口贸易，但保税区内企业有外币的现汇账号，可以从事外币结算货物的贸易活动，实际上是拥有了国际转口贸易的功能。
保税区内的贸易性企业同时拥有国内贸易和转口贸易双重身份的权利，这就使得保税区的贸易功能多样化。
（4）商品保税展示等展示运作方式
由于保税区实行的是国际自由贸易区的模式，因此国际商品的保税展示成为一项重要的保税区功能运作形式。
从国外运往中国的货物可以在保税区内进行商品展示，可以设立相应的展览馆，安装模拟使用各种国际产品，这样非常有利于国际产品销售到中国，一方面大大降低了展览成本，简化了展览产品的通关手续，另一方面缩短了考察的时间，相应减低了国内企业的采购成本。
目前在全国的保税区内主力展示的商品为保税汽车和大型工程机械成套设备，由于这些产品在国内展示的成本非常高，保税区展示优势就非常突出。
4.保税物流与保税区物流
目前，对保税物流还没有正式的、统一的定义。保税是滞后纳税或滞后核销，是海关对特定区域、特定范围的应税进口货物暂缓征税，当货物离开该特定区域、特定范围时，根据货物的真实流向决定征税与否的一种制度。对货物的保税可减少经营者的流动资金占用，加速资金周转。
根据《中华人民共和国海关法》，保税货物是指经海关批准未办理纳税手续进境，在境内储存、加工、装配后复运出境的货物。从这个意义上来看，保税物流是指保税货物的流动过程，它是伴随保税区的各项功能活动的展开而产生的物流活动。保税物流形式是由保税区功能活动所决定的，保税物流发生在保税区之内。
保税区物流是发生在保税区的物流活动。“保税”是保税区政策功能的基本特征，却不是唯一的特征，保税区除了“保税”特征之外还包括“免税”特征。所以，发生在保税区的物流活动不仅仅是保税物流，还包括免税物流（国际中转物流、较大型保税区的区内自用免税物流）和已税物流。
从以上的分析来看，保税区物流的范畴比保税物流更广些。联系保税区的四种基本运作形式，可以看出这些运作形式中所涉及的货物都是保税货物，所以我们这里主要介绍保税物流。
5.保税物流的发展
保税物流的发展是随着保税区的改革和发展而发展的，中国的保税区发展主要经历了两个阶段：一是从1990年上海外高桥保税区设立开始到2003年国务院正式批复同意“上海外高桥保税区区港联动试点”为止，这是传统的保税区阶段；二是从2003年至今，保税区进入了一个新的发展阶段，即保税区区港联动阶段。相应地，保税物流也经历了两个阶段，即传统保税物流阶段和区港联动后的保税物流阶段。
（1）传统保税物流阶段
传统的保税区，是在当时中国国情与外向型经济战略的特殊背景下，作为自由贸易区的替代模式提出的。一方面，保税区既在一个相对封闭的区域里实现了无关税的自由贸易，又能避免对国内经济的过分冲击。因此，保税区本身就是一种符合中国改革开放思路的平衡机制。另一方面，20世纪90年代初，世界经济正处于一个低谷期，中国的政治经济环境也相当严峻，客观上并不具备建立完全意义上的自由贸易区的条件，政治上也不允许有这样超前的提法。而在保税区的概念下，中国尽可以加入更多的中国特色，渐进式地推进全方位开放，维护国家利益。
保税区从1990年设立到2003年，从发展历程来看，按其功能开发又可以细分为三个阶段，相应的保税物流在这个时期也可以分为三个阶段。
第一阶段：从1990年上海外高桥保税区设立到1994年。
1990年4月，国务院正式批准设立上海外高桥保税区。按照1990年《上海市外高桥保税区管理办法》，“保税区主要发展对外贸易和转口贸易、港口、仓储、出口加工以及金融服务等业务”。但在实际发展中，各保税区的主要功能还只是局限在保税仓储和国际贸易。所以这个时候的保税物流形式主要是：以国际贸易、保税仓储为主要贸易方式的贸易、仓储类物流。这类货物一般在保税区进行仓储后经保税区进／出境，货物本身不发生性质、形态、用途等的变化。
这类形式的保税物流主要有以下六种模式。
第一种为直通进口：货物从境外发运，经保税区直接进口（不仓储）。
第二种为仓储进口：货物从境外发运，经保税区仓储一段时间后，正式进口。
第三种为仓储出口：货物从国内发运，经保税区仓储一段时间后，正式出口。
第四种为仓储转口：货物从境外发运，经保税区过境或仓储后转口至消费国。
第五种为出口复进口：货物从国内发运至保税区，仓储或不经仓储复进口国内。
第六种为直通出口：货物从国内发运，经保税区直接出口。
第二阶段：1994年“天津会议”至1998年。
1994年6月，我国在天津召开了全国保税区工作座谈会（简称“天津会议”），提出了我国建设和发展保税区的根本目标：改善我国的投资、建设软环境，特别是利用海关保税的独特条件，最大限度地利用国外资金、技术，发展外向型经济，使保税区真正成为新的经济增长点，带动区域经济的发展。在此基础上，还明确提出了保税区的四大功能——出口加工、国际贸易、保税仓库和商品展示，要求各个保税区围绕这四大功能来开发，并旗帜鲜明地提出保税区要首先发挥其出口加工功能，以推动外向型经济发展。
这一时期，保税区功能的开发，各地区各有侧重，但以出口加工和商品展示为主流。
保税物流主要是：以加工贸易为主要贸易方式的加工贸易类物流，这类货物（主要指原材料和制成品）一般是由保税区内的生产加工企业输出／入；以保税区内政府机关、企业引进用于展示或为办公生产所需，从国内／外采购的机器设备、办公物资的展示、采购类物流，这类货物进入保税区后，暂时不再流动。
加工贸易类保税物流，以制成品的流向为导向，有四种常见模式。
第一种，加工出境：100％原材料来自境外，制成成品后出境；100％原材料来自国内，制成成品后出境；原材料分别来自境外和国内，制成成品后出境。
第二种，加工进口：100％原材料来自境外，制成成品后进入国内；100％原材料来自国内，制成成品后进入国内；100％原材料分别来自境外和国内，制成成品后进入国内。
第三种，部分进口，部分出境：100％原材料来自境外，制成成品后既出境又进入国内；100％原材料来自国内，制成成品后既出境又进入国内；原材料分别来自境外和国内，制成成品后既出境又进入国内。
第四种，委托加工：区内企业委托外加工（原材料来自境外，制成品返回境外）；区外企业委托区内加工（原材料来自国内，制成品返回国内）；区内企业委托境外加工（出料加工，原材料来自国内，制成品返销国内）。
展示、采购类保税物流有三种常见模式。
第一种，100％来自境外，在保税区内展示、使用。
第二种，100％来自国内，在保税区展示、使用。
第三种，部分来自境外，部分来自国内，在保税区内展示、使用。
第三阶段：1998至2003年。
这个阶段，物流分拨成为保税区的主要功能，并且取得了长足的发展。自20世纪后期以来，国际直接投资真正成为世界经济的推动者，跨国公司根据其全球化经营的需要，在世界范围内整合资源进行国际化生产和销售。而我国保税区特殊的保税免税功能为跨国公司提供了介入中国市场的最佳平台，伴随着跨国公司的抢滩，国际物流公司、跨国公司内部的分拨物流部分以及专业物流公司纷纷入驻保税区，成为这几年保税区新的增长点。
（2）区港联动后的保税物流阶段
保税区是在20世纪90年代这样一个特定的背景下诞生的，这使保税区在政策设计、法规建设和管理措施上，总体而言还是比较保守的，并且具有许多不合理的因素，严重制约了保税区的发展。特别是在我国加入世界贸易组织以后，实现保税区的进一步改革和发展是我国经济发展的必然要求。
针对这种形式，2003年7月17日海关总署论证通过了“上海外高桥保税区区港联动试点方案”，当年12月8日国务院正式批复同意试点，2004年4月物流园区通过国家验收。区港联动试点，即保税物流园区正式出现。区港联动的主要功能是：国际配送、国际采购、国际转口贸易和国际中转。根据区港联动的功能，区港联动后的保税物流主要运作模式包括以下四种。
1）基于国外大宗进口商品向国内市场分销的物流业务运作
国外大宗进口商品利用保税物流园区作为物流分拨基地，面向国内市场开展分销活动，是目前一些跨国公司和具有较强专业性国际企业的一种主要运作方式。
利用保税物流园区作为物流分拨基地，其物流运作特点：一是进口环节大批量、小批次，而进入国内市场则采用“多批次、小批量”；二是物流运作的主体比较多元化，既可由跨国公司和专业国际企业在保税物流园区设立的分支机构，又可以由其中国的代理商负责，或委托保税物流园区物流企业进行物流运作。利用保税物流园区作为物流分拨基地，可以从整体上降低进口商品销售成本，提高服务质量。
2）基于国内出口商品在保税物流园区集结和处理的物流业务运作模式随着全球经济一体化进程的加快和商品国际竞争能力的提高，跨国采购活动已日益频繁地出现在中国市场，许多生产性跨国公司、国际大型零售企业和专业化国际采购公司的国际采购网络正在向中国延伸。在保税物流园区建立国际采购中心，利用保税物流园区低成本的物流及相关服务设施，降低集配活动物流成本，将中国市场采购的商品输往世界各地，带动了我国出口的活跃和发展。
国内企业在开拓市场、整合出口渠道方面，要重视利用保税物流园区的集配作用，根据国际市场生产和销售需求，提供配套商品和服务。出口企业能够在商品离境之前享受出口退税、结汇等政策，加快资金周转，降低出口企业的市场风险，缩短理赔、补货以及调换商品时间。
国内出口商品在保税物流园区集结和处理的物流业务的主要特点：一是国内出口商品进入保税物流园区的是少品种、大批量的物流，而离境的物流则是经过集配和优化运输选择的多品种、大批量、多方向的物流；二是物流运作主体也比较多样化。
3）基于转口贸易的物流运作模式
转口贸易的物流运作是以区内第三方物流企业为主体，其物流业务的主要内容是为转口过境商品提供仓储、多式联运、向不同区域市场分拨以及物流信息服务等。保税物流园区通过提供商品展示功能和交易服务功能，可以促进保税物流园区贸易活动的开展，增加保税物流园区物流流量。
4）国际中转
国际中转即对国际、国内货物及进出口集装箱货物进入保税物流园区进行分拆、集拼、转运至境内关外其他目的港。涉及国际中转功能是为了更好地结合港口地缘优势和保税区优惠的政策优势，充分利用保税区所具有的“两头在外”的功能和港区航运资源为货物快速集并、集散等方面提供的便利条件，开展货物进口、出口、中转的集运、多国多地区的快速集并和国际联合快运等业务，加快货物在境内外的快速流动。国际中转模式主要分为整箱货转口和拼箱货转口。
