3月18日，敦煌市召开“三讲”（讲学习讲政治讲正气）动员大会。这次“三讲”历时3个月，征求意见2200条，制定了整改方案和具体措施。
4月19日。奥地利联邦议会议长哈赛尔巴赫一行24人，来敦煌参观访问。
5月10日，香港汉荣书局有限责任公司董事长石景宜先生给敦煌市图书馆捐赠《敦煌宝藏》、《敦煌掇琐》等173册图书，总价值36．6万元。
6月9日，原国家计划生育委员会副主任、中国人口学会常务副会长李宏规率国家人口学会专家组来敦煌检查参观。
15日，国家林业局副局长马福来敦煌检查参观。
20日，建设部副部长赵宝江来敦煌检查参观。
25日，全国人大常委会委员、教科文卫副主任、民盟中央副主席张怀西一行19人来敦煌检查参观。
7月1日，柳园火车站更名为敦煌火车站。
7月4日至8月31日，甘肃省人民政府、国家文物局主办，敦煌研究院、中国历史博物馆承办的“敦煌艺术大展”在北京历史博物馆举行。胡锦涛、尉建行、李岚清等领导同志观看了展览。此展共接待国内外观众20万人次。
6日，文化部主办的“敦煌藏经洞发现暨敦煌学百年纪念座谈会”在北京人民大会堂举行。
8日，司法部副部长刘杨来敦煌检查参观。
12日，以全国人大常委会副委员长、农工民主党中央主席蒋正华为团长，中央统战部副部长胡德平为副团长的全国党外人士西部大开发考察团来敦煌参观。蒋正华副委员长在鸣沙山挥题“鸣沙仙音信天成，月牙神泉赖地灵”。
16日，三危山旅游景区开放仪式在新落成的36．6米高的露天大佛下举行。
甘肃省博物馆在兰州举行“敦煌藏经洞发现百年特别展”。
20日，中共中央政治局委员、国务院副总理钱其琛来敦煌视察工作。在视察月牙泉风景区时，钱副总理题词：“保护环境，发展旅游。”中央党建工作领导小组副组长、“三讲”教育联系会议负责人张全景一行13人来敦煌检查参观。
29日至8月3日，研究院主办的“2000年敦煌学国际学术讨论会”在莫高窟举行。来自10多个国家的310多名学者出席学术会，提交论文205篇。文化部部长孙家正、国家文物局局长张文斌、省委副书记仲兆隆、副省长李重庵等参加了这次学术会。
29日，佛爷庙砖墓陈列馆对外开放。
香港孔教学院院长汤恩佳赠送的孔子铜像在沙州乐园举行揭幕仪式。
藏经洞陈列馆举行揭幕仪式。
8月1日，着名物理学家、诺贝尔奖得者、美籍华人李政道博士再次来敦煌参观访问。在游览鸣沙山时题“旋风卷成鸣沙山，夕阳遥映月牙泉”志念。
3日，浙江省委书记张德江率领浙江党政代表团一行34人，来敦煌参观。
15日，甘肃省人大常委会主任卢克俭来敦煌参观。
18日，教育部副部长周远靖及教育部高级专家考察团一行42人来敦煌检查参观
22日，以仙场素男为团长的日本镰仓市民友好访问团一行43人来敦煌市进行友好访问。
26日，由广东省省长卢瑞华率领的省政府“东西合作，共同发展”赴甘肃考察团来敦煌参观。
30日，中美合资2．8亿元，规模为50MW的敦煌燃气机电站建成。
9月2日，外交部组织的40多个国家和国际组织的59位驻华大使来敦煌市参观访问。
5日，甘肃省委书记孙英带领省纪委、财政、旅游等部门负责人。来敦煌参观。
8日，国家环保局局长宋瑞祥来敦煌检查参观。
9日，国土资源部副部长寿嘉华来敦煌检查参观。
15日，全国政协委员“保护母亲河行动”考察团一行45人，在全国政协副主席万国权带领下来敦煌参观。
29日。全国妇联副主席、书记处书记沈淑济带领全国各省区妇联主席来敦煌参观检查参观。
10月。中国书法协会主席沈鹏来敦煌参观，题“敦古昔之灵气兮，煌来日而放光华”。在月牙泉又题“水静印月”志念。
10月，国务院勘界办公室在新疆乌鲁木齐专门召开甘、新两省区划界会，划定敦煌和哈密界线为：红柳河车站、大水泉、北山、乱山子（雅丹地貌西北3公里处）、塔拉塔格。雅丹地貌属敦煌管辖。至此，敦煌和新疆若羌及哈密之间有几年争议的边界划定。
1996年至2000年，敦煌市三期防护林工程共投入资金1001万元，完成人工造林3．4万亩，封滩育林0．5万亩，全市森林覆盖率达3．3％。
敦煌研究院拍摄制作的VCD《敦煌莫高窟》由江苏省出版总社出版。
配合国务院新闻办公室组织的“2000年中国文化美国行”活动，莫高窟第275窟模型赴美国参加了展出。
2001年
1月1日至2月28日，敦煌研究院和上海市徐汇区政府旅游局在上海联合举办了“敦煌艺术展”。
3日，中共敦煌市委、市政府召开“三个代表”（中国共产党始终代表中国先进生产力的发展要求、中国先进文化的前进方向、中国最广大人民的根本利益）学习动员大会。这次活动6月底结束，解决农民的各种难题1248件。
2月19日，香港着名实业家李嘉诚先生一行参观考察莫高窟，并为榆林窟文物保护捐资100万元人民币。
4月1日至6月3日，敦煌研究院和广东美术馆在广州举办“敦煌2001——广东特展”。
17日，中国国民党革命委员会敦煌市委员会成立，民革中央副主席朱培康、民革甘肃省主委俞正等前来祝贺。
4月9日，水利部副部长翟浩辉来敦煌检查参观。
15日，国务院体改办副主任李剑阁来敦煌检查参观。
水电部部长汪怒诚来敦煌检查参观。
6月10日，由敦煌研究院樊锦诗院长和日本文化学园理事长大沼淳主编的《敦煌石窟》（全10卷）由日本文化学园文化出版局开始陆续出版。
同日，司法部部长段正坤来敦煌检查参观。
20日，甘肃省委书记宋照肃、省人大常委会主任卢克俭、省委副书记仲兆隆、省委常委、宣传部长马西林来敦煌检查参观。
7月3日，全国政协副主席王文元带领的全国政协文化资源保护和利用情况视察团一行来敦煌市检查参观。
18日，悬泉置遗址被国务院确定为第五批全国重点文物保护单位，至此，我市已有3处（莫高窟、玉门关、悬泉置）文物景点列为全国重点文物保护单位。
8月7日，总投资1168万元的敦煌市第三中学竣工，正式交付使用。
28日至30日，“中国，敦煌国际文化旅游节”在我市举行。国家贸促会副会长马跃、国际友人陈香梅、省政法委书记陈学亨等领导和1000多名中外宾客参加。
8月2日，日本国自民党前干事长野中广务先生一行来敦煌参观访问。
9月2日，敦煌机场扩建工程竣工验收通过，正式投入营运。
同日，原中央军委副主席刘华清来敦煌检查参观。
3日，原中纪委副书记、国务院纠风办主任徐青一行来敦煌参观。
5日，日本国连合茨城第七次中国访问团一行15人来敦煌市访问。
23日，第六届全国葡萄科学讨论会在敦煌市召开，全国各省市自治区的130多名专家参会。
29日，以中央文明办副主任胡振明为组长的中央文明办“河西精神文明模范走廊”检查组来敦煌检查参观。
9月8日至2002年3月12日，敦煌研究院和日本国山阳新闻社在日本歧阜、冈山、佐鹤、横滨等地举办“敦煌美术展”。
敦煌市确立“旅游立市”战略。
10月，中央电视台《焦点访谈》曝光敦煌市部分中小学长时间组织中小学生拾棉花问题，市委、市政府按有关规定对责任人进行了处理。
16日，国土资源部副部长李元来敦煌检查参观。
11月27日，敦煌雅丹地貌风景区被国家国土资源部评定为“国家级地质公园”。
12月26日，敦煌旅游网站正式开通。
2002年
1月3日，由中国科学院紫金山天文台1978年10月29日发现的国际编号为4273号的小行星，经国际小行星中心和国际小行星命名委员会批准，正式命名为“敦煌星”。
2月2日。司法部部长张福森来敦煌检查参观。
3月12日至5月2日，应美国李正懿女士的丝路基金会邀请，敦煌研究院吴健在美国加州旧金山、华盛顿州、芝加哥西北大学等地举办“丝绸之路石窟和古遗址”摄影作品展。
4月14日，中日友好绿化事业“世界青少年”植树团一行32人来敦煌市义务植树。
17日。全市农村税费改革工作全面铺开。改革后，农民人均负担109元，亩均46．8元，比改革前人均减负66元，亩均减负28元，减负幅度达37．6％。
5月23日，全国政协副主席杨汝岱带领全国政协经济委员会退耕还林调研组一行来敦煌检查参观。
6月16日，中共中央政治局委员、中央军委副主席兼国防部长迟浩田带领中央军委西部调研组一行24人来敦煌视察参观
17日，甘肃省委副书记、省长陆浩带领省政府调研组一行9人来敦煌检查参观。
18日，全国政协副主席钱正瑛率全国政协考察团来敦煌检查参观。
7月9日，由国家环保局副局长王玉庆带领的国家环保总局检查组来敦煌参观。
22日，由中纪委常务副书记曹庆泽带领的中纪委视察调研组一行5人来敦煌检查参观。
23日，全国人大常委会副委员长铁木尔·达瓦买提一行来敦煌参观。
同日，青海石油管理局公安分局整体移交我市公安局。
8月，南湖乡注册“阳关牌”葡萄商标，建立了葡萄产业协会。
11日，国家外经贸部部长石广生来敦煌检查参观。
18日。最高人民法院院长肖杨来敦煌检查参观。
9月1日，全国政协副主席张思卿带领的全国政协联合调查组来敦煌检查参观。
22日，美国友好人士科尼·罗斯夫人一行参观考察莫高窟，为保护莫高窟，表示连续5年每年捐款1万美元。
23日，国家计委副主任于广州来敦煌检查参观。
26日，敦煌电视台中心大楼落成。
10月12日，纳米比亚国民议会副议长、执政党斯瓦普议员威廉·康尧利带领的纳米比亚国民议会人力资源与促进男女平等委员会访华团一行，来敦煌参观访问。
13日，以法国前总理雷蒙·巴尔为首的国家开发银行国家顾问一行11人来敦煌参观访问。
24日，由中国建筑学会理事长、建设部原副部长宋春华带领的建设部城乡规划联合检查组来敦煌检查参观。
12月7日，甘肃省人大常委会通过了《甘肃敦煌莫高窟保护条例》。
2003年
3月31日，中共敦煌市委、市政府决定成立市铁路建设协调领导小组，领导小组由19人组成。办公室设在市计划局。
敦煌市“村村通”油路工程全面启动。到9月底，建成乡村道路22条、100．9公里，总投资1260万元。经甘肃省公路局检查验收，敦煌市“村村通”油路工程达到验收标准，成为全省第一个实现“村村通”油路的县市。
