5月7日，日本国内阁总理兼法务大臣藤田正晴带领的法务代表团一行10人来敦煌参观访问。
25日，全国组织人事工作研讨会在敦煌举行。55人参加了会议。
7月5日，17时19分至26分，敦煌市出现历史上罕见的冰雹，直径达8至20毫米，13．7万亩粮食和经济作物受灾，损失达1433万元。
12日，国务院兼国家经济体制改革委员会主任李铁映、文化部副部长陈昌本、国家文物局局长张德勤一行20人来敦煌视察参观。
22日，敦煌市东街小学部分教师坐汽车去九寨沟旅游，中途不幸车翻，11名教师遇难身亡，酿成特大交通事故。
25日，全国人大常委会副委员长、民建中央主席孙起孟来敦煌检查参观。
9月29日，中共中央政治局常委、国务院副总理朱镕基来敦煌视察。
10月3日至8日，敦煌研究院、美国盖蒂保护所、中国文物研究所在敦煌举办丝绸之路古遗址保护国际学术会议，以纪念敦煌研究院成立50周年。
12日至13日，甘肃省敦煌学学会在兰州举行敦煌文化普及与开发研讨会。
投资1324：万元的南湖店电站、沙枣墩电站修建完工并投入使用。
11月，全国妇联主席赵地与国家教委、科委、司法部领导一行7人来敦煌检查参观。
1994年
4月5日至7日，敦煌市出现沙尘暴天气，东西交替的大风，持续3小时多，沙尘持续10小时28分，天地一片灰暗，全市70％小麦、1000多座温棚受灾，70％以上杏树、梨树花粉受灾。
常书鸿《九十春秋——敦煌五十年》出版。
5月30日，
根据上级精神决定创办《敦煌报》，成立敦煌报社。2003年底停刊。
6月，《敦煌市志》出版。
23日，敦煌研究院的创始人、缔造者、敦煌文物保护事业的奠基人、开拓者常书鸿先生在北京逝世，享年90岁。
7月，中共中央政治局委员、国务委员李铁映再次来敦煌视察。在参观鸣沙山月牙泉风景名胜区时，即兴疾书“沙岭晴鸣”、“山得水趣”志念。
8月1日，由国务院秘书长李世忠一行25人组成的反腐败调查组来敦煌检查参观。
8月2日至5日。国家档案局、甘肃省档案局在敦煌联合举办“敦煌遗书档案国际研讨会”。来自中国、美国、日本及澳门、台湾等专家学者78人参加了研讨会。
3日，经甘肃省政府批准，建立南湖湿地及候鸟自然保护区，总面积1106．67公顷。
9-14日，敦煌学国际学术研讨会在敦煌研究院召开，来自中国、美国、日本、印度、韩国、加拿大等13个国家、地区的专家、学者200余人参加了会议。
10日，国务委员兼国家计划生育委员会主任彭佩云来敦煌检查参观。
8日至14日，敦煌研究院在敦煌莫高窟举办“1994年敦煌学国际学术研讨会”，16个国家和地区的180名专家学者参会。
15日，“第二届中印石窟艺术讨论会”在莫高窟举行。
21日，敦煌石窟文物保护研究陈列中心在莫高窟举行竣工典礼仪式。中央政治局委员、国务委员李铁映，日本国前首相竹下登、甘肃省省长张吾乐、日本国驻华大使国广道彦、中日友好协会会长孙平化、日本东京艺术大学校长、日本国际协会会长平山郁夫、日本国际力事业团本部理事青木盛久，文化部部长陈昌本、国家文物局局长张德勤、国家经贸委主任助理龙永图、外交部部长助理王英凡、甘肃省对外友好协会副会长杨振杰、敦煌研究院院长段文杰、日本外交省官员及日中友好协会访华团等共100余人出席了竣工典礼。
同日，为表彰日本着名画家平山郁夫先生向敦煌研究院捐赠学术基金2亿日元，敦煌研究院在莫高窟九层楼前建立“平山郁夫先生纪念幢”，并举行揭幢仪式。
9月，北京园林设计师赵光华、教授王浞华、林邦钧等一行7人，应敦煌市人民政府的邀请来月牙泉风景区考察风景区的设计建设情况。
2日，敦煌公园竣工开园。
18日，国务院副总理邹家华、国家计委副主任叶青、西北民航局副局长许日孝等一行来敦煌视察参观。邹家华在鸣沙山题“神州胜景”志念。
27日，敦煌市与日本臼杵市缔结友好城市签字仪式在日本臼杵举行。敦煌市市长肖洪才出席。
10月6日，国家计委正式批准立项扩建敦煌民航机场，工程总投资估计3．33亿元，由国家、省地市共同承担。
23日，印度副总统科杰黑尔·拉曼·纳拉亚南和夫人一行11人来敦煌参观访问，并在莫高窟题“让中印两国人民的友谊万古长青”志念。
12月，敦七公路拓宽改建及月牙泉道路改造工程完工，总投资808万元。
1995年
3月29日至31日，敦煌市刮起大东风，持续13个小时26分，沙尘暴持续14小时5分，最大风速26．9米/秒，能见度0．1千米。边缘村组3000亩小麦受灾，850座塑料大棚吹坏，损坏电线16280米，直接经济损失263万元。
4月12日，莫高窟程控交换及数字微波传输通信工程建成并投入使用。
5月9日，国务院副总理吴邦国来敦煌视察参观。在鸣沙山题“水映流沙别有天”志念。
5月18日，“中国国民党革命委员会敦煌支部”成立。
6月，兰州大学敦煌学研究所成立。
7月7日，建设部李光逵教授来鸣沙山月牙泉风景区考察时即兴赋诗一首：“鸣沙世界少，月牙天下稀。大漠多远客，美乐共此景。”
7月12日，宕泉河上游暴雨成灾，形成1949年以来未有过的大洪水，莫高窟防洪、工作、生活设施遭破坏，直接经济损失100多万元。
为庆祝1997年香港回归。敦煌研究院在香港举办“敦煌艺术展”。
25日，《敦煌党史资料选编（一）》出版。
29日，原中央军委总后勤部副政委、当代“将军书法家”李真将军参观鸣沙山月牙泉。
8月4日，韩国航空公司董事长赵重勋一行24人，乘飞机来敦煌考察旅游航线、旅游景点，这是首架外航机抵达敦煌机场。
7日，全国人大常委会副委员长布赫、林业部副部长李育才、甘肃省人大副主任王金堂等一行50人来敦煌检查参观。
8日，邮电部部长杨贤定一行6人来敦煌检查参观。
19日，香港小度集团董事长王敏刚投资兴建的三星级宾馆敦煌山庄开业。
24日，水利部常务副部长张春园带领验收组来敦煌检查参观。
9月，日本国众议院议长土井多贺子一行数人，来敦煌参观访问。在游览月牙泉时，土井多贺子现场挥毫题：“啐啄同时”，寓意中日友好的机遇降临，要互相配合，以获取新生命的喜果。
10月15日，日本大分县臼杵市民访问团216人来敦煌市庆祝缔结友好城市一周年活动，并在月牙泉风景区竖立纪念碑。
11月，国防科委政委李继耐将军来敦煌鸣沙山月牙泉风景区参观，并题词：“天池伏首，歧山仰鸣。”
同年，原国务院副总理谷牧、中顾委委员铁瑛来敦煌参观。
从1986年至1995年，敦煌市“三北”（东北、华北、西北）防护林共投资969万元，完成造林面积5万亩，封滩育林61．6万亩，全市森林覆盖率达2％。
敦煌市自来水厂扩建工程完工，日供水能力由1700吨增加至9000吨。
1996年
1月19日，在全省农村工作会议上，对1995年率先实现小康市（区）的敦煌市、兰州市城关区、安宁区进行了表彰。
2月1日至4日，敦煌研究院和日本东京国立文化财研究所合作主办的“敦煌莫高窟保护国际研讨会”在日本奈良举行。十多个国家的100多名文物保护专家出席了会议。
5月，“百日严打”斗争全面展开。全市共破获各类刑事案件173起，抓获各类作案人员144人。
28日，敦煌市移动电话开通并投入使用。
29日至30日，刮起大西风，伴有强沙尘暴。大风持续10小时40分，沙尘暴持续7小时40分，最大风速26米/秒，能见度小于0．1千米，一段时间能见度几乎等于零。致使黄渠乡5名小学生落入水渠身亡。农业上造成经济损失2273万元。
6月7日，日本文物振兴财团、茶道里千家代表团、法隆寺代表团100余人到我市参观访问。
13日。国务院委员兼国家民委主任司马义·艾买提一行4人来敦煌检查参观。
7月1日，全国着名书法家尹瘦石来敦煌参观游览。在参观月牙泉后题“泉映片月，山环鸣沙”，“一曲甘泉，百仞鸣沙”。
8月5日，卫生部副部长孙隆椿一行6人来敦煌检查参观。
8日，共青团中央书记处书记袁纯青和巴音朝鲁率领全国政协调查组来敦煌检查参观。
16日，“段文杰先生敦煌研究50年纪念会”在北京饭店举行。
8月16日至9月15日，国家文物局、甘肃省文化厅、甘肃省文物局主办，敦煌研究院、中国历史博物馆联合承办的“敦煌艺术展”在中国历史博物馆举办。此展共接待国内外观众10余万人。
19日，全国人大常委会委员长乔石来敦煌市视察参观。
20日，国家体改委副主任邵秉仁一行3人来敦煌检查参观。
23日，外交部组织的我国部分驻外使节34人来敦煌参观。
9月5日，水利部常务副部长张春园来敦煌检查参观。
9日，国家民航总局局长陈光毅来敦煌检查参观。在参观月牙泉时题“泉映鸣沙别有天”志念。
14日，原国家主席杨尚昆来敦煌参观。
9月27日至10月26日，由上海桂花节组委会、《解放日报》、敦煌研究院共同举办的“96上海桂花节敦煌艺术展”在刘海粟美术馆举行。
10月20日，中国民主同盟敦煌支部成立。
26日，应臼杵市市长芝歧敏先生邀请，副市长徐寿、政协主席谌国德率我市访问团一行37人，对日本进行为期10天的友好访问。
26日至12月23日，敦煌研究院、日本东京都美术馆、朝日新闻社、朝日电视台联合举办的“沙漠中的美术馆——永远的敦煌”敦煌艺术展在日本东京都美术馆举行。1997年1月至2月。该展又在福冈县美术馆、神户市立博物馆举行。
11月5日，由常嘉煌和日本国黄河株式会社投资的中国敦煌石窟艺术工程举行奠基仪式（该工程在敦煌城西30公里处的党河河床石壁上）。
全县主要经济指标完成情况：工业总产值51022万元，农业总产值20016万元，粮食总产80843吨，棉花总产9849吨，社会消费品零售总额36757万元，旅游总收入12991万元，财政收入4886万元。
1997年
5月12日，欧盟15国大使一行20人来敦煌参观访问。
14日，全国人大常委会副委员长田纪云来敦煌检查参观。并在月牙泉题“鸣沙胜境，天下一绝”志念。
6月，各国驻华使馆武官一行150人来敦煌参观。
6日，国务委员陈俊生来敦煌检查参观。
7月9日，中央中共政治局委员、国务院副总理姜春云来敦煌视察参观。
8月，香港着名人士邵逸夫、安子文及其他香港各界人士代表一行百余人，来敦煌参观访问，并在鸣沙山参观了东街小学百余名学生的滑沙表演。
8日，国务院副秘书长杨景宇、卫生部副部长殷大奎来敦煌检查参观。
卫生部副部长彭玉来敦煌检查参观。
12日，日本国驻华大使及夫人一行8人，来敦煌参观访问。
14日，国务委员孙健一行10多人来敦煌检查参观。
21日，国家计生委党组书记、常务副主任张维庆来敦煌检查参观。
24日，国家教委副主任张宝庆一行来敦煌检查参观。
30日，卫生部部长陈敏章来敦煌检查参观。并参观了月牙泉后即兴题词：“登沙山，览月泉，心旷神怡。”
9月，投资720万元的110千伏变电所增容改造工程完成并投入使用。
西千佛洞对游人开放。
10月，日本友人青山庆示先生将其收藏的莫高窟藏经洞敦煌文书8件捐赠给敦煌研究院，并举办了捐赠仪式。
10月，陕西省省长程安东来敦煌参观访问，在游览鸣沙山时题“鸣沙泉波美如画，山川秀美大西北”志念。
1998年
4月，段文杰任敦煌研究院名誉院长，樊锦诗继任院长。
7日，全国政协副主席、中央统战部部长王兆国及港澳知名人士一行60多人来敦煌视察参观。
8日，中共甘肃省委书记、省长孙英来敦煌视察月牙泉水位下降情况后，对采访的电视台记者郑重说：“要不惜一切代价，千方百计抢救月牙泉。”
6月28日，第二届中国酒泉·敦煌招商会在敦煌市体育场开幕。中共甘肃省委副书记赵志宏、副省长崔正华、原省委书记李子奇、地委书记陈学亨等领导和群众1．5万人参加了开幕式。
29日，更新后的街心花坛反弹琵琶雕像完工（该雕像由孙纪元先生承作）。
7月，澳门总督韦奇立携夫人一行8人来敦煌市参观访问。
7月，当代着名长城学家罗哲文教授来敦煌参观，在鸣沙山题“鸣沙胜景，天下奇观”志念。
18日，澳门总督韦奇立携夫人一行8人来敦煌参观访问。
28日，中纪委副书记刘丽英、中纪委常委祁培文等一行来敦煌视察参观。
8月，兰州大学与敦煌研究院联合申报国内首个敦煌学博士学位授权点批准建立。次年开始招收博士生。
9月，全国人大常务会副委员长王光英来敦煌检查参观。在鸣沙山题“神沙宝泉”志念。
1日，日本臼杵市市长后藤国十利率市民代表团一行84人来敦煌市访问。
28日，敦煌市与日本镰仓市缔结友好城市签订仪式在敦煌宾馆举行。
10月，中国书法协会秘书长谢云来敦煌参观，在鸣沙山题：“几生修得到神山，挥毫作书对月泉。语诉同游对此日，端阳佳节颂寅节。”
1日，青海石油管理局仙敦天然气输气管工程竣工，敦煌市居民用上了天然气。
香港高盛（亚洲）有限责任公司执行董事长徐子望先生捐赠人民币200万元，用于榆林窟文物维修、环境整治修路。
1999年
1月，敦煌市被国家旅游局命名为第一批“中国优秀旅游城市”。
4月23日，6至7级大风伴随中度沙尘暴袭击敦煌市。
29日至10月29日，敦煌研究院与台湾国立自然科学博物馆文教基金会合作在台湾台中国立自然科学博物馆举办“敦煌石窟特展”。
6月16日，中共中央政治局常委、中纪委书记、总工会主席尉建行来敦煌市考察参观。
8月4日，国家民航局副局长沈正康来敦煌检查参观。
9月14日，中共中央政治局常委、国家副主席、中央军委副主席胡锦涛来敦煌市视察参观。
28日，机场扩建工程举行奠基仪式。
莫高窟第275窟模型参加国务院新闻办公室在法国巴黎举行的“中国文化周活动”中的展览。
10月3日，沙州乐园举行开工奠基仪式，该工程至2000年9月竣工。
敦煌市农村电网改造工程全面启动。2002年完成，总投资8995．33万元。
12月，兰州大学与敦煌研究院联合共建的教育部人文社会科学重点研究基地兰州大学敦煌学研究所成立，郑炳林任所长，樊锦诗任名誉所长。
2000年
1月13日，道光《敦煌县志》重印首发式举行。
