组织秩序的形成是伴随着组织结构的产生而逐步由低级向高级发展的，它是组织在结构化过程的有序性表现。组织结构与组织秩序几乎同时产生，它们是同一事物（组织）的两种表现形式。结构是有形组织的有序性表现，而秩序则是组织中无形的部分的有序性表现，结构是秩序的基础。对于复杂组织，同样的结构由于结构敏感性的作用未必会产生同样的组织秩序。因此在管理实践中，人们总是试图通过组织结构的调整来建立或重构复杂组织的秩序，以实现组织目的。组织的秩序使组织管理者在配置资源的时候更加便捷和有效。
组织在存续过程中始终伴随着某种秩序，秩序会直接影响到组织的有效性和效能。因而我们就可以将“管理的目的视为基于组织目标的人们为了追求更高的秩序”，管理中的各种研究派系从某种程度上说都是试图建立起组织的某种秩序，让组织从整体上具备一定的有序性，使组织的功能得到进一步分化和强化。组织系统的互动秩序可以解释为有条理地、有组织地安排组织的各构成部分以求达到组织正常运转或保持良好的外观状态。因此，组织秩序的建立过程实际上就是对组织系统内外部关系配置的过程，以达到对组织结构的调整，影响组织行为，在本质上也是一个互动过程。
对于复杂高危组织系统，秩序决定其安全性。与简单系统不同的是，高危复杂组织系统的构成要素具有一定的适应性和自学习能力，并且要素间存在着紧耦合互动作用，这些互动作用会随着时间的推移出现更加不确定性的变化和波动，促使系统的构成要素行为出现难以准确预见的偏差。当这些偏差经过合成作用达到一个临界值时，就会破坏组织系统原有的互动秩序，在这种情境下，如果不能及时纠正这些偏差，就很有可能会发生系统失效，甚至演变为事故。因此，复杂组织系统的安全管理实际上是周期性地重构组织系统的互动秩序，或者是将组织系统提升到更高级别的可控秩序，从而使组织自身具有更强的抵御因为内外部扰动所形成偏差的能力。
在写《交互式安全管理》一书时，我们提出了针对复杂高危系统安全管理的基本思路就是通过配置系统内外部的交互关系来重构或提升组织秩序，从而达到对系统的有效管理，降低事故的发生率。因此，对于高危复杂系统，秩序性基本等同于安全性，秩序的层次越高，系统自身由于具有更强的适应能力，就使得系统可靠性及安全性越高。
在一般意义下，对于复杂组织，组织秩序导致了组织构成要素及要素间的交互关系规范化，并逐步演化出组织在宏观层面上的有序状态，这种有序状态使组织能够以更高的效率配置组织资源，具有更高的决策效率，克服内部构成要素间的负交互作用产生的负效应。因此，秩序层次越高，组织在配置和组织内外部资源的效率也将越高，实现组织目的的效率也越高。
