己卯，（「己卯」，原作「乙卯」。按是月干支無乙卯，據明實錄穆宗實錄卷四七隆慶四年七月己卯條改。）先是以內供不足，數下戶部取之太倉，又令買金雲南。尚書劉體乾多執奏，不即奉詔。至是雲南年例金過期不至，有中旨詰責，體乾引罪。上以體乾數抗旨，手詔勘問，勒令閑住。戶科給事中光懋等、御史淩琯等文章留之，不聽。
丁亥，吏部覆賈三近本：「近年州縣長吏率重甲科而輕鄉舉。同一寬也，在進士則為撫字，在舉人則為姑息；同一嚴也，在進士則為精明，在舉人則為暴戾。低昂之間，殿最攸異。若使因是途而激揚振飭之，猶可得人以效用。又今州縣正官有缺，率委佐貳，大都年力衰耗，資格卑微，漁獵貪饕，何所不至。雖亟為褫黜，而斯民已重狼狽不堪矣。宜下吏部，凡州縣長吏毋得偏重進士，署印毋得濫授雜流。」吏部是議，詔允行之。
戊子，大學士陳以勤四疏乞致仕。上察其誠懇，優詔許之，加兼太子太師，復賜敕獎，令子翰林編修于陛送父還鄉。
八月己未，刑科給事中舒化等，請釋戶科給事中李己、內犯張恩等，分別情罪，輕重行罰。得旨：「己釋為民，恩等繫獄如故。」始法司意恩等有內援，欲借以脫己。及己獨釋，眾始翕然，謂上仁明獨斷，左右不得與也。
九月辛未，大學士高拱言：「大禮大獄及建言得罪諸臣，不宜一概褒顯，讎視先帝。」上然之，詔自後重論不宥。
按：大禮大獄、建言諸臣，不過議之不合耳，未有可死之罪也。徐階卹忠讜而出累繫，所以蓋世宗之愆滯而彰穆宗之孝誠，風勵海內之良法也。高拱創為此說以激朝廷，欲以中傷徐階，敗乃善類，此心為何心哉？
壬申，（「壬申」，原無，據明實錄穆宗實錄卷四九隆慶四年九月壬申條補。）御史張守約追論「故錦依都督陸炳，結納嚴世蕃，竊弄威權，播惡流毒。宜追戮炳屍，逮治其子繹、姪緒、家人佐，籍其家。」
得旨：「姑削其官，追奪誥命，子姪俱革職為民，家產贓物如數籍入。」
丙戌，南京兵部尚書吳嶽卒。
嶽，汶上人。居官清介，而質直簡易，有古風，士論重之。
丁亥，詔祀故禮部尚書歐陽德于鄉。江西撫按言：「德文章行業，為世所重。」上特允之。
戊子，虜酋黃台吉等犯遼東大勝堡，總兵王治道及參將郎得功死之。（「總兵王治道及參將郎得功死之」，「道」原作「王」，據明實錄穆宗實錄卷四九隆慶四年九月戊子條改。）
辛卯，大學土高拱言：「方士王金等，自有當誅之罪，不當以先帝殞于非命不得正其終者罪之。」上命多官訊實以聞。刑部會多官鞫于承天門外，盡反金等獄詞。
吏科給事中趙奮，以「法司為天下持平，昔則一主于入而不思為先帝之地，今則一主于出而不恤乎後世之譏，陛下何賴哉？更將金等重擬，若以金等為從，又孰為首？必以陶仲文為首，今以死矣。」疏入，報聞。
十月戊申，令南京禮部尚書吳山、刑部尚書黃光昇致仕。
時以人望起用，方屢辭之未即之官。吏科都給事中韓楫劾其遷延不敬。楫承望風旨，以擊搏立威，不復知朝廷進退大臣之體矣。
丙辰，御史葉夢熊言：「把漢那吉之降，邊臣不宜遽納，朝廷不宜授以官爵，將致結讎激禍。」上怒其妄言撓亂，命降二級調外任。
己未，都察院掌院事大學士趙貞吉言：「頃因御史葉夢熊奏論邊事，上干聖怒，薄示降罰，足以懲戒矣。今因此一人波及諸臣，遂令科道考察，則將來言路壅塞，士氣銷阻矣。願收回成命。」疏入，上報有旨。
十一月乙酉，考察科道，趙貞吉與拱意不同。吏科都給事韓楫，乃拱門生，劾奏貞吉。貞吉疏辯。上手詔令致仕。
己丑，令禮部尚書殷士儋入閣辦事。
金星晝見三日。
十二月丁酉，虜執我叛人趙全等來獻，總督王崇古受獻，遣使送歸那吉。上命奏告郊廟，獻俘正法，諸臣加以恩賚。
隆慶五年辛未春正月甲子朔。
己丑，大風，揚塵四塞。
庚寅，大學士李春芳言：「東宮未出閣時，閣臣以朔望次日行謁見禮，不惟臣等獲遂瞻仰之私，而東宮亦可閑習禮儀，養成儲德。」上許之。
二月甲午，文武羣臣及天下朝覲官謁見皇太子于文華左門。
辛丑，御史汪文輝疏論治體四事，以責言官：一觀望當戒，二紛更當戒，三苛刻當戒，四護短當戒。末言：「大臣宜鑒前事之失，勿用希旨生事之人。蓋希旨生事之人進，則忠貞直諒之士遠，而道古今譽盛德者日至于前。大臣任己獨斷，即有闕失，孰從聞之？臣謂宰相之職，不當以救時自足，當以格心為本。格心之要，在去讒遠佞，使賢者得行其志。願陛下慎避言官，申敕大臣，以消朋比之私，回淳厚之俗。」疏下所司，言雖不用，識者韙之。
按：高拱恣肆謀孽，徐階、陳以勤見幾去矣，高矣；趙貞吉議不合去矣，次矣。而吏科都給事中若韓楫者，甘心承望，不擇是非，則公論安在？汪文輝之疏，一以斥高拱，一以斥韓楫，然不十日而遽陞僉事，以箝人口。權臣之可畏類如此。
三月甲子，時都給事中章甫端、張國彥，給事中宋應昌、張思忠、紀大綱，（「時都給事中章甫端張國彥給事中宋應昌張思忠谷大綱」，原無，據明實錄穆宗實錄卷五五隆慶五年三月甲子條補。）各條上虜酋封貢互市事，（「各條上虜酋封貢互市事」，原脫「事」，據明實錄穆宗實錄卷五五隆慶五年三月甲子條補。）與王崇古議互有異同。上以為未當，令部臣更議。
丁卯，（「丁卯」，原作「丁巳」。按是月干支無丁巳，據明實錄穆宗實錄卷五五隆慶五年三月丁卯條改。）初嘉靖中，山東副使王獻議：「請循元人海運遺跡，于膠、萊間開河渠一道，繇淮安、清河、清江浦，歷新閘、海倉口，以達天津，道理甚近，徑度不過千六百里，又可以避海洋之險。」業已從其議，開鑿將畢，會獻去官，遂罷其役。至是戶科李貴和言：「比歲河決，轉餉艱難，請修獻遺策，開膠萊新河，復海運以濟餉運。」（「復海運以濟餉運」，「海」原作「河」，據明實錄穆宗實錄卷五五隆慶五年二月丁卯條改。）上以事體重大，遣工科胡價往視之。
己巳，上御文華殿。日講畢，大學士李春芳面奏北虜封貢事宜，（「大學士李春芳面奏北虜封貢事宜」，據文意「李春芳」下似脫「等」字。）具言「外示羈縻，內修守備」之意。上曰：「卿等既議允當，其即行之。」于是內竪知事由宸斷，（「于是內竪知事由宸斷」，明實錄穆宗實錄卷五五隆慶五年三月己巳條作「于是廷臣知事由宸斷」，存異。）異議稍息矣。
庚午，（「庚午」，原作「庚子」，按是月干支無庚子，據明實錄穆宗實錄卷五五隆慶五年三月庚午條改。）兵部議北虜封貢事宜，請如王崇古議。
己卯，賜貢士張元忭等三百九十六人進士及第、出身有差。
辛巳，日暈，有珥，白虹亘天，左右戟氣俱蒼白色。
乙酉，禮科給事中張國彥奏：「召對一節，先朝大學士李時所記召對錄始于嘉靖九年，終于十五年，政事因革，人材進退，罔不召問臣寮，面決可否，與家人無異。乃今日所當繼述者，謹以前錄撮其大要，總二十九條，繕寫上進，伏望遵行先朝盛事。」詔留覽。起吏部尚書楊博、禮部尚書高儀，從高拱薦也。
己丑，（「己丑」，原作「乙丑」。按是月乙酉條後不應有乙丑，據明實錄穆宗實錄卷五五隆慶五年三月己丑條改。）封虜酋俺答為順義王。
四月戊午，京師大雨電。
庚申，（「庚申」，原無，據明實錄穆宗實錄卷五六隆慶五年四月庚申條補。）左都御史葛守禮疏陳官箴、士節六事，請曉諭今歲進士，使知遵守。一曰端趨向，二曰崇節儉，三曰正心術，四曰勤職業，五曰敦禮讓，六曰弘器度。上然之。
五月戊寅，大學士李春芳五上乞休疏，上許之。
己卯，漢陽府知府孫克弘，大學士徐階同邑人也。遣家人孫伍至京師，或妄傳為階所使。吏科都給事韓楫計欲中階，至伍臥內大索裝資，止有所與親故書，他無所獲，乃更引他事，奏克弘夤緣陞遷，極言詆階。于是干進之徒以綜跡階事為奇貨矣。
六月辛卯朔，京師地震者三。
庚申，工科給事中胡價勘視膠、萊諸河，以為不便。上乃罷之。
七月庚午，陞蘇州知府蔡國熙整飭蘇松兵備。
丙戌，掌吏部大學士高拱言：「國家用人，不得官于本土。此惟有民社之責者則然耳。若夫學、倉、驛遞等官，非有民社之責也，而其官甚卑，其家甚貧，一授遠官，或棄官而不能赴，或去任而不能歸，零丁萬狀，其情可憐。近例，教官得授本省地方，甚以為便，乞視此為例。」從之。
