在任何国家，对政府内部的改革都是困难重重，普京发誓一定啃下这块硬骨头，政府做为职能部门，如果自己都无法完全控制，国家又怎么可能按照自己的思路发展呢？
普京的上任总理叶利钦在执政过程中，总要面临强大的反对派，他的想法很难彻底实现的原因，也在于杜马中强有力的抵制。普京接手之后，她知道自己要想真正领导俄罗斯，就要首先从反对党那里得到认可，而最有效的办法，就是消弱反对党在杜马中的影响力。
鉴于反对党在群众中的影响，普京在执政初期对其采取了怀柔政策，设法改善关系，找到共识，尽管两者“相安无事”，但这种平衡关系正在普京的谋划中被打破。
简单说来，普京的策略是光明正大的通过合法手段培养反对党的竞争对手——比如“团结”党，鼓励“团结”党成为将来的执政党；然后，普京推动新的政党法诞生，根据新的政党法，很多长期盘据俄政坛、势单力薄的政治组织被清理出杜马。
培植起来的新党在杜马中拥有132个席位，再加上一些议员团，杜马中的中派议员的总数达到235人；而两大反动团体的议员总数分别为128人和61人，普京获得了杜马大多数的支持。
但这个结果还不够令人安心，随后，反动党在议会中失去了一系列重要阵地，自身内部也发生了分化。这个时候，普京挽留了被“抛弃”的反动党核心成员谢列兹尼奥夫，内部斗争让反对党在人民心目中的地位大大降低。
通过这一系列的“整党”活动，国家杜马的组成已大大有利于普京，反对党团再也难以阻止克里姆林宫提出的法案在杜马中获得通过了。过去曾同各党派领导人会晤并征求他们的意见的普京，现在只用会见中派政党领导人，基本上不再听取别的党的看法，杜马终于成为了普京的掌中之物。
但这并不意味着普京大功告成。叶利钦时代的恶果不仅政府机构效率低下，向心力也严重不足，很多优秀的专家和人才都流失到国外，大财阀的巨额财产也转移到国外。苏联解体后，公务员制度迟迟没有出台，苏联时期的过时体制还在运行，贪污腐败十分普遍。“警察”几乎等于“黑社会”，莫斯科大学宿舍发生火灾的时候，消防员救火的同时竟然对学生宿舍进行了洗劫，黑手党渗透到杜马的现象也很普遍。如果政府本省成为国家发展的制约，那么就要从政府入手进行改革，哪怕这相当于“自裁”，肯定会得罪既得利益者。
叶利钦时代的政权被一些公司和家族瓜分是众所周知的事情，他们也不好对付，由于深入到经济的主要领域，整顿这些人很可能引起国内动荡。由于预见到了可能的阻力，普京决定悄悄地分步进行改革。
普京提名政治色彩淡薄的卡西亚诺夫做总理，随后政府组阁很快完成。原内阁的大部分成员基本留任。卡西亚诺夫是典型的务实派官僚，适合执行普京的决议。
不同于“政治型”的普京总理政府，总理卡西亚诺夫总理时代的政府明显有“技术型”倾向。叶利钦执政时期，普京总理在国家政治生活中的地位十分突出。而普京执政时期，总理的主要任务是要将普京总统的治国蓝图逐步变为现实——总统及总统办公厅制定大的方针策略，总理政府负责落实到位。
值得注意的是，总理卡西亚诺夫被任命的时候只有43岁，普京也才48岁，在政界算是年轻的力量。普京和卡西亚诺夫后来任命的官员中，还有三十多岁的优秀人才，俄罗斯媒体把这些人称为“血气方刚的内行人”。这一代人的青年时代正好处于苏联探索宇宙、繁荣电影、创造纪录的时代，“为祖国而自豪”的气氛影响着这些人，他们雄心勃勃，又不会对过去的陈规陋习惟命是从，敢于冒险，支持创新而有益的政策，不害怕得罪权贵。这些新人会成为普京得力的助手，也会成为将来俄罗斯的中坚力量。
一年之后，普京通过很多的渠道吹出风，要对政府进行大动作改革。“官员们不熟悉管理体制，因此，必须实行与时代要求和目标相符合的行政改革。国家机关应该成为国家政策小巧的执行工具。”
执政以来第一次国家权力机构的大规模人事调整在2001年的春天开始了，普京更换了联邦安全会议秘书、国防部长、内务部长、税警局等四个强力部门和原子能源部等部门的重要官员——同只有在发生未遂政变时，才可能时对四个强力部门负责人进行调整，而普京在上任的头一年就做出了这个改革。
不过，被调整的官员们虽然忠于普京，彼此之间却并不是高度一致的。比如对于俄国的军事改革，有人主张扩大预算，加强军队武器战斗力，而有人则主张正常化。普京手下的文职人员去军事部门任职，还是历史上的头一次，但他并不担心大家的质疑，他相信自己选中的人。普京总统做出的人事变动决定得到了国内各主要党派的赞同和支持，他带领“俄社会生活向非军事化迈出的重要一步”。
卡西亚诺夫总理的提议，也得到普京的大力支持。比如解除克列巴诺夫的副总理职务，普京就鼎力协助，此前列克巴诺夫主管的交通部、核能部、通讯与信息部改由总理直接负责。这一抉择让民众更加相信俄罗斯政府正在迈向高效的道路。
具有过渡性质的国家公务员公务行为准则也终于开始实施，苏联遗留下来的种种不合理制度被替代，公务员系统变得更加透明和公开。
杜马：
“杜马”一词，是俄文（дума）音译，意为“议会”。沙皇俄国原是封建专制国家，1905年爆发革命运动后，沙皇尼古拉二世为缓和政治危机，赐予一定权力给“国家杜马”，即议会。1917年十月革命胜利后，苏联采用的是“议行合一”的苏维埃制度。1993年10月，俄罗斯发生“炮打白宫”事件后，首届总统叶利钦宣布废除苏维埃制度，建立新的联邦议会，其上院称“联邦委员会”，其下院即“国家杜马”。
普京法则：
很多人对现状不满意，但是极少有人真正去改变这种不理想的现实。要么是得过且过，要么就是不停地抱怨、找借口。治理国家和管理自我的道理是相通的：如果你满意，就要及时作出调整。每一届任期只有四年，没有时间拿来犹豫不决。
