金顺起始仍把失利的主要原因归罪于冯桂增身上，后见刘锦棠拿出了罗长佑的证词，口气这才软下来，但仍不承认攻取玛纳斯南城是他的军命，强调是前锋统领额尔庆额、冯桂增与徐学功三人贪功轻进造成的。
金顺最后把刘锦棠请进秘室，改容说道：“毅斋老弟，攻取玛纳斯南城失利，亦非老哥所愿，也出老哥意外。如今恭王十万火急追究原因，左爵相也在肃州让老哥从速据实禀报，老弟又受老爵相委派赶到这里查问此事，现在想来，动静是让老哥闹大了。这件事，如果老弟据实向爵相禀告，老哥头上的乌纱不保倒在其次，进规南路的师期恐怕就要延后。”
刘锦棠小声问道：“都护大人，额尔庆额、冯桂增、徐学功要攻取玛纳斯南城这件事，事先您老究竟知不知道呢？”
金顺抚须说道：“毅斋老弟，老哥可以指天发誓，这三个混蛋要围攻玛纳斯南城，事先并没有禀告于我。老弟试想，额尔庆额只有两营一起马队，冯桂增所部虽有两营步队两营骑队，但两营步队和骑营并没有跟上，而徐学功也只有两营骑队尚欠一起，三个人加起来才这些人马，老哥怎么敢同意让他们去取南城呢？”
刘锦棠笑一笑没有言语，却顺手从袖管里摸出一张兹文道：“本官已见过徐学功军门，这是徐军门交给本官的一道行营兹文，上面有您老的命令。您老命令徐军门，逼近玛纳斯城垣，相机攻取。下面盖有您老的帮办新疆军务的紫花大印。”
金顺接过兹文，只看一眼，便道：“这是什么时候的事呢？老哥怎么想不起来呢？——徐军门还说过什么？”
刘锦棠长叹一口气道：“都护大人，官军孤悬塞外，加之地形不熟，敌众我寡，最忌轻举冒进。我各路人马合成一路，能战者也不过五万余人。稍一不慎，就将出现不测。此次攻取玛纳斯南城失利，固属额尔庆额、徐学功、冯桂增等人贪功所致，但都护本人也非毫无责任。都护赶到南城城垣后，见官军失利，也不问情由，先责怪徐学功救护不力，又将他头上的顶翎摘去，这件事做得就有欠妥当。”
金顺被说得满面通红，低头连连说道：“老弟所言极是！老哥也是一时气极。
这件事，还望老弟在向爵相禀报的时候周全一二。”
刘锦棠很快将访查的情况具实函告左宗棠，同时也捎带了几句替金顺开脱的话。
病中的左宗棠接到刘锦棠信函的当日，即把文案传到榻前，有气无力地口述了《查明袭攻玛纳斯城失利确情》一折。
左宗棠在折中这样写道：“兹据刘锦棠查复：……额尔庆额、冯桂增等与徐学功议攻玛纳斯城，原约二十九日会师进攻，并未明定时刻。嗣额尔庆额、冯桂增两营于先夕寅刻麾马队前进，徐学功先期未接函牍，无从悬揣。迨二十九日，徐学功率所部前进，行近玛纳斯城，见官军已败出城外，救援不及，收队回防。冯桂增因护救额尔庆额，身带重伤数处，不能行动，旋被贼拥入城中，极口骂贼，致被戕害。两营阵亡员弁兵勇人数，查与额尔庆额及都司冯以和等前报相符。此次致挫之由，经刘锦棠逐加访察，参以舆论，实因额尔庆额等轻进贪功所致。”折子接着写道：“臣维额尔庆额、冯桂增袭攻玛纳斯城，事前未及咨商金顺详为布置，贪功轻进，以致偾事。既经查明确实，相应请旨，将凉州副都统额尔庆额交部议处，以为贪功轻进者戒。总兵冯桂增此次战败被戕，实由额尔庆额怂恿所致。该故员平日勇锐无前，迭着战绩；此次业已登城，因贼已警觉，嗾党死斗，众寡不敌致败；当额尔庆额受伤时，冯桂增奋力救护，以致迭受重伤，率被拥去，骂贼捐躯，既于大节无亏，而于额尔庆额尤称无负，可否赐恤之处，出自天恩。徐学功救护不力，业由金顺摘去顶翎，嗣带队随同金顺围攻玛纳斯城，尚属出力，应请免其再议。”
从折中看出，左宗棠听从了刘锦棠的建议，为保全金顺，把玛纳斯失利的责任全部推给了凉州副都统额尔庆额。
表面看来，额尔庆额的这个黑锅替金顺背得有些冤枉，但从全局考虑，为了能使金顺尽职尽责地镇守北路，又不得不如此。
左宗棠在肃州拜折的同时，伊犁将军荣全也在自己的大营背着金顺、刘锦棠等人秘密拜发了一折。该折一为自己邀功，请朝廷赏戴其双眼花翎，一为麾下出力员弁请赏。
荣全私下以为，无论攻取玛纳斯南城失利的责任在谁，他助攻总是没错。左宗棠不为他请功，金顺亦不为他邀赏，他只能自己为自己向朝廷表表功劳。
此次收复玛纳斯南城，荣全决定好好地露一下脸。
左宗棠拜折不久，又接到刘锦棠密函一封。
刘锦棠在函中称：“奉委到金顺大营后，访查玛纳斯失利原因的同时，亦发现金顺所率各营缺额太甚，疲弱过多，名为四十营，实不足二十三营，若再裁去疲弱，实不过二十营。”
刘锦棠接着写道：“金顺所部冒称四十余营，每年应得正饷二百六十余万两，全赖关内筹措，一旦军饷不继，该军此后情形，实有不堪设想者！若及时裁汰疲弱，将能战之员归并成二十营，所余饷额，不仅能解老湘、嵩武各军断饷之忧，于开屯、采粮、枪弹、火药、马干、驼干等项，亦有补充。如此办理，于关内、关外均有裨益。”
刘锦棠最后建议：“为全疆长远计，北路官军各营裁汰下来的冗员可就地安置，给地给种并代购农具等物，大行屯垦。”
左宗棠对刘锦棠的来信会同幕僚讨论了五天，一致认为可行，于是又着文案紧急跟发一折曰：《请裁汰北路征军折》。
折曰：“窃维玛纳斯南城既克，北路一律肃清，官军方图下兵南路，扫荡而前，北路所宜筹者防，南路所宜筹者剿，大致判然。”
折子接着谈了剿军与防军的区别之后，又写道：“总计南路征军，刘锦棠由乌鲁木齐南进，马步约二十九营；张曜自哈密西进，马步共十五营有奇，为一支；徐占彪自巴、古之间西南进，马步五营有奇，为一支。统计不过四十余营。”
折子至此，笔锋随后一转：“北路金顺所部二十余营及接统景廉所统十九营，按照步队每营五百人、马队每营二百五十骑核算，人马之数较南路征军约略相等。
除伊犁尚未收回不计，以驿站程途计之，则北路较南路缩二千里有奇。兵之可议减汰，一也。北路景廉所部先本三十余营，金顺接统挑存十九营，合之金顺旧部及新增马步二十余营，为四十余营，不为不多矣。月饷多至二十二万两，较之刘锦棠现统各军饷银多至十二万两有奇。而势力未能一律。如非分别汰减，任其虚糜，弱者与壮者、勇者与怯者同一缺饷，何以鼓舞群情，收战胜攻取之效？饷项以积欠而愈薄，兵气以缺饷而愈疲，将何以战？何以守？且恐因循日久，患有不可胜言者！兵之急宜减汰，二也。金顺所部四十余营，步队照五百人一营、马队照二百五十骑核算，现存实数缺额太多，难以复按。若就现在实数裁汰疲弱，归并成营，勇丁得有的饷，自期翕服。其娶有妻室，愿留口外者，准其酌借牛力、籽种，拨荒绝无主地亩，令其承垦，秋后以粮抵还，仿古徙民实边之意，而无其劳费。近时古城、巴里坤屯垦办法，多用汰遣客军，适值岁稔价平，屯丁获利，此薪粮倍蓰，人情乐趋，即其明验。其空缺之营哨各官及汰遣之勇丁愿留口外者，亦准一律安插，非徒节饷，亦可实边。此时行之，事尤易举。兵之应及时减汰者，三也。”
左宗棠提出三点金军必须裁汰的理由：一为裁汰之后“人马之数较南路征军约略相等”，二为“如非分别汰减，任其虚糜，弱者与壮者、勇者与怯者同一缺饷，何以鼓舞群情”，三为“其空缺之营哨各官及汰遣之勇丁愿留口外者，亦准一律安插，非徒节饷，亦可实边”。
折子最后恳请朝廷拨部款四十万两白银作为金顺所部裁汰之费。
两月后，圣旨陆续递进肃州与关外金顺大营。
一旨曰：“左宗棠奏查明官军袭攻玛纳斯城轻进失利情形一折……凉州副都统额尔庆额、总兵冯桂增与统领徐学功议攻玛纳斯城，原约二十九日会师进攻，并未明定时刻，额尔庆额、冯桂增两营先进失利；迨徐学功率所部前进，官军已败出城外，救援不及。额尔庆额并未咨商金顺详筹布置，贪功轻进，咎有应得，着交部议处；冯桂增身受重伤，骂贼捐躯，着交部议恤。余着照所议办理。”
朝廷总算给了左宗棠一个面子，同意将“贪功轻进”的额尔庆额“交部议处”，同意将战死的冯桂增“交部议恤”。
接旨的当日，金顺将所摘之徐学功顶翎发还给徐学功。
徐学功嘴上不说什么，内心却对金顺十分看轻，人后骂金顺是狗娘养的。
当日回营，徐学功给左宗棠和刘锦棠各发了一封致谢信，信里流露出改隶老湘的愿望。左宗棠、刘锦棠分别去信好言抚慰之。
接旨的当日，凉州副都统额尔庆额在自己的中军大帐大骂金顺道：“金和甫个老王八！本官要同你到太后面前去打官司！”
额尔庆额一连气愤了几天，气尚未平，第二道圣旨又到了。
肃州的左宗棠抱病接旨，关外的金顺会同荣全听宣。
旨曰：“前据左宗棠、金顺奏官军攻克玛纳斯南城大概情形，兹据奏详陈战状，请将出力阵亡各员弁分别奖恤一折。官军于本年六月间攻克玛纳斯北城后，南城贼党负隅抗拒。金顺亲率所部兵勇进剿。”
圣旨随后描述攻城经过及刘锦棠派兵助攻等事，最后才道：“……左宗棠运筹决胜，调度有方，深堪嘉尚。金顺督率各军，奋勇剿贼，懋着勤劳，着加恩赏戴双眼花翎，并赏给云骑尉世职，以示优异。其余出力阵亡各员，均着照所请奖恤。钦此。”
金顺无过有功，不仅被赏戴了双眼花翎，而且还赏了个云骑尉世职，内心自是欢喜异常。
接旨毕，荣全一边向金顺道喜，一边却暗自想道：“本将军的双眼花翎，大概也在这几日来到。若同时再赏个云骑尉世职，那可真是好上加好了！”
当日，金顺留荣全在营，大排酒宴，上下同庆。
额尔庆额气上加气，只坐在自己的大帐里，坚辞不出。
金顺与额尔庆额之间的隔阂越来越深。
越十日，第三道圣旨分下到肃州与关外。
旨曰：“前据左宗棠、金顺驰奏克复玛纳斯南城大概情形，兹复据奏陈详细战状；并左宗棠奏减汰北路征军，请拨部款及规画南路情形各折片，本日已明降谕旨宣示，特予金顺等优奖，出力阵亡各员照请奖恤矣。现在北路一律肃清，各城防守事宜自应妥筹布置。金顺一军为数不少，现值饷需缺乏，必须汰弱留强，庶军士不至饥疲，驱乘可资得力。左宗棠请拨部款四十万两作为金顺所部裁遣之费。惟部库需用浩繁，亦形支绌。本日已谕知户部拨给银二十万两，并将各省欠饷催令拨解矣。金顺俟拨款解到，即着将所部各营分别裁汰归并。其遣撤之兵，亦当妥筹按插，毋任滋事。刘锦棠、张曜等军规取南路，现值冬令严寒，大雪封山，未能进发，只可暂时休息。一俟春融冰泮，即着饬令各军，鼓勇前进，迅扫逆氛，廓清疆圉。前因荣全不候谕旨，遽赴玛纳斯城助剿，殊属冒昧，已谕令折回塔城。其所奏请将出力各员奖励，未免过优；双眼花翎，尤非臣下所得擅请。所有荣全原折单各一件、片三件，均着抄交左宗棠、金顺复核，另拟具奏，再降谕旨。”
圣旨先着令金顺所统各营“必须汰弱留强”，又同意刘锦棠“暂时休息”之议，但接下来，却对荣全大加申饬。圣旨先责备荣全“不候谕旨，遽赴玛纳斯城助剿”是“殊属冒昧”，又斥其“所奏请将出力各员奖励，未免过优，双眼花翎，尤非臣下所得擅请”，命左宗棠、金顺接旨后重新复核，另拟具奏。
旨未宣完，金顺脸色顿白，荣全更是气得浑身乱抖，脸色铁青。
传旨差官刚离开大营，荣全便冲金顺大叫道：“金都护，本爵助攻玛纳斯南城，难道不是您老发的函文吗？——如今怎么倒成了‘殊属冒昧’？不是本爵来得快，没有刘毅斋派过来的几营人马，南城能下吗？您的头上又怎么能戴上双眼花翎！不行！本爵是一定要把事情的原委同上头讲清楚！”
金顺见荣全气得胡子乱抖，忙陪出一张笑脸说道：“荣侯息怒，荣侯息怒。侯爷，您老适才所讲的话，都包在下官的身上，下官为侯爷的头上也保上一顶双眼花翎就是了！”
荣全气愤地说道：“本爵是我大清国堂堂的袭侯，在乎这两眼花翎毛吗？本爵气就气在，你身为军务的帮办，不该把功劳全揽在自己的头上！——好像关外各路人马当中，除了刘毅斋，就是你能！——你真能吗？你对上头口口声声报称四十营人马，你真有那么多吗？你以为本爵迟迟不回塔城在这里干什么？就是在替上头清点你的人马！”
金顺仍旧陪着笑脸说道：“侯爷言重了！言重了！下官的心里清清楚楚，有侯爷罩着，下官在这里才能吃碗安稳饭。”
荣全道：“你知道就好，我今儿就离开这里回塔城等圣旨，你看着办！”
荣全愤愤地走出大帐。
金顺一个人呆了半晌，忽然拿过随旨下发的荣全所上各折片，三把两把撕成碎片，往地上一丢，口里大骂道：“混帐王八蛋！你仗着祖宗的那点余荫在本官面前耍威风！——你想戴双眼花翎？下辈子吧！——呸！”
金顺当晚给醇王写了封密信，很是说了几句荣全的坏话，金顺希望醇王能在太后面前说上句话，把荣全调离新疆，省得他在自己面前乱发酒疯，影响稳定大局。
圣旨果然不久颁下：“荣全久历边关，劳苦功高，着进京任职；实授金顺伊犁将军；乌鲁木齐都统暂着成瑞署理。”
荣全接旨不久即同金顺办了交接，然后便带着眷属及部分随员，离开新疆进京。
荣全到京不多几日，即被实授护军统领，不久又改授右翼前锋统领，圣恩如旧。
金顺与成瑞交割后，即开始很不情愿地对麾下各营大行裁遣、归并等事，刘锦棠、张曜各军则全面进入筹粮、置办冬衣等休整时期；在肃州的左宗棠则利用这个时机，抓紧向关外转运军饷、粮食、军火等物，为来年开春规取南路做着准备。
此时此刻，居住在南疆阿克苏王城豪华宫殿里的阿古柏在干什么呢？
