1月：
1日，吴振械以病免，命张亮基为云贵总督，以徐之铭接任云南巡抚。
2日，咸丰诏予阵亡提督邓绍良优恤，并为之建祠。
9日，以宋朝不屈殉国之丞相陆秀夫（陆背南宋幼主投海殉国）从祀文庙。
18日，以郑魁士为浙江提督，督办宁国军务。
21日，咸丰以安徽帮办军务李续宾于三河战役阵亡，追赠总督，并为之建祠，给予谥号。
上年到本年1月，清廷免直隶、安徽、福建、湖北等省之厅、州、县灾区额赋。朝鲜、琉球入贡。
29日，以何桂清为钦差大臣，办理通商事宜，以徐有壬为江苏巡抚。
何桂清（？—1862年），云南昆明人。进士出身。历任侍郎、巡抚、总督。1857年升任两江总督。次年兼任钦差大臣，办理通商事宜。1860年以江南大营被太平军攻破而逃跑，被清廷逮问，次年处死。
2月：
1日，命瑞麟为大学士。调肃顺为户部尚书；麟魁为礼部尚书；瑞常为刑部尚书。肃顺任户部尚书后，清查户部宝钞处官号欠款，与官钱总局所立存案不符，系将官款化为私欠，肃顺大怒，奏请将该处司员夺职查办，一时司员及商户被抄没者数十家。又查抄官票所官吏数十家。
3日，桂良等奏：英人借口广东有“夷民互斗”事发生，声言罢议回粤。税则谈判中止。前英军攻陷广州时，三元里和佛山民众起而反英。继之在香港等处为英人服役者，亦全部回乡，并枪杀英人之贴告示者，英军又攻陷新安。适清廷大员到沪谈判，英方提出先将两广总督黄宗汉免职，并解散乡团后，方可谈判。桂良立即奏请答应英人条件，以便谈判。咸丰允之，继续谈判。
6日，清廷召袁甲三回京，派傅振邦“督剿”三省捻军，伊兴阿副之；免贵州都匀等厅州县被扰地方额赋。
18日，清廷令湖南采买马匹，训练马队。
21日，闽省起事民众周红燧等投降清廷，清军收复连城。
3月：
1日，桂良等奏：英国公使坚决要求进北京。咸丰令僧格林沁严防海口。
4日，荆州将军都兴阿请假，清廷以多隆阿接统其军。咸丰令海运漕船探避外国轮船。
8日，太平军陈玉成攻克皖北六安。
12日，李秀成率军反攻浦口、江浦。欲解天京之围。上月28日，太平军将领蒋之元叛投清军，致浦口失陷。
天京北面被围。清将张国梁李世忠二人亦是叛投者，进逼天京。
14日，李秀成失利，即飞檄陈玉成来援。
17日，咸丰诏示廷臣：上年科场舞弊罪，依载垣、端华所拟论处：主考官大学士柏君，坐家人调换中卷批条，处斩；同考官浦安，坐听从李鹤龄介绍罗鸿绎行贿得中，均处斩。此后，考场之风，为之肃然。
18日，太平军陈玉成破清军副将邓清与知县李孟荃两营，击毙参将潘罗成、知县高堃卫、县丞李纶田、守备马锡禄、朱清珍等。次日，破李孟群大营，生擒李孟群，击毙州同知张湘甲、县丞沈麟图等。李孟群被俘后，陈玉成劝其降服，李拒之。陈复与之共饭，李以碗击陈玉成，陈遂杀之。
26日，陈玉成自庐州梁园挥师北进。
29日，太平军击败清军胜保部，半月后，再败胜保，击毙知府颜怀忠等，攻克护城，遂引军东援浦口，陈、李二军会合，同攻二浦。战约十日，太平军败于张国梁部李若珠、冯子材。九袱洲被攻破，陈玉成东攻六合，不克。再引兵扬州，以分六合清军兵力。待六合清将张玉良、马德昭来援，陈玉成复引军自扬州进占皖北天长，击毙湖北提督德安，再败清副将成兴于天长，进攻旧铺胜保大营。但天长又危。至五月底，陈玉成又自天长南下。屯军于六合东北之灵严山、八埠桥地区，谋攻六合。后与清提督鞠殿华战于仪征东沟。陈军又败。陈玉成遂与右军主将韦俊复率军自苏北返回天长，转攻盱眙，击败胜保军，攻克盱眙城。陈玉成晋封英王禄千岁，吴如孝补任前军主将。胜保复率军攻破盱眙，陈玉成转攻来安城，并分军进攻滁州。叛将李世忠驰攻来安，败陈玉成军。陈玉成亲自督攻滁州，仍被阻。至8月时，陈玉成以久攻不克，又撤围南趋。
在陈玉成攻滁州之时，太平军前军主将吴如孝，会同龚得树围攻定远，击败清总兵吉顺、扎隆武、惠成等部。皖抚翁同书退守炉镇桥。吴如孝、龚得树、苏天福攻克定远城。吉、惠等部败溃，损兵折将。翁同书又退走寿州，依附练总知府苗沛霖。后吴、龚联军攻占明光镇、盱眙，旋退出，复攻盱眙，失利。至十月，陈玉成令龚得树自盱眙、天长再攻扬州，击败总兵马德昭等。清江南提督李若珠、副将朱承先急自六合进援扬州。陈玉成突然率军攻袭六合红山窑李若珠大营，并大败来援之清军冯子材、张威邦等部，解六合之围，破李若珠大营，歼清军五千人。后陈玉成与李秀成合攻浦口，大败代理湖北提督周天培、总兵张玉良、冯子材军于江浦，摧毁其营盘五十余座，占领浦口。周天培被击毙。天京与江北复又开通。天京之围解除。
陈玉成立即引军回救安庆。李秀成则留守江北，与清军李世忠连战失利，而天王又不许李秀成回京，以其老母妻子为人质，李内无军饷，外无援兵，处境艰难。至年末，降清叛将李昭寿。乘此致书李秀成劝其降清。此时天王恐李秀成生变，即晋封其为忠王荣千岁，并亲书“万古忠义”四字以褒奖之。
陈玉成（1837～1862），广西藤县人。贫苦农民之子。14岁参加金田起义。
李秀成（1823-1864），广西藤县人。出身雇农。1851年参加太平军。
20日，庆祺卒，清廷以恒福为直隶总督；英棨为河南巡抚。
28日，咸丰命编修李鸿章听候伊兴阿差委。
4月：
洪仁玕到达天京，向天王上奏《资政新篇》，被封干王主持国政。该篇四个部分为：用人、风风、法法、刑刑，而以法法篇为主要部分。该部分强调以法制治国，并主张学习西方科学技术，建立资本主义近代企业，发展商品经济，主张对外开放，引进西方科学技术。同时主张开办报馆，发表民意，监督政府，宣传法律，各省亦办报馆，新闻官员不受众官节制，独立行事，申公议抨秕政。
3日，前布政使李孟群，兵溃官亭阵亡，咸丰诏复其官位，并予抚恤。
6日，奕山、景淳奏：俄国人径至乌苏里江、绥芬河择地建屋，并请中国方面会勘。咸丰拒绝之。
9日，桂良等奏：英国公使不同意于上海换约，决定派兵舰北上，阻之不听。
13日，四川头人作乱，清廷命恩庆讨平之，杀其头目邓珠。
23日，清廷派黄赞汤为东河河道总督。
27日，咸丰命；俄国人在黑龙江通商，允许免税，但不许闯入乌苏里江、绥芬河。
5月：
3日，伊兴阿解帮办职，命关保帮办傅振邦军务。
4日，调王庆云为两广总督。命黄宗汉为四川总督。
5日，胜保奏：捻军张元龙部投降清军。
10日，浙江余姚民众起事，旋被镇压之。
21日，以袁甲三代理漕运总督。劳崇光出任广东巡抚，兼代总督。
23日，奕山奏：俄国船由黑龙江入松花江，东驶入海。咸丰命：不许入绥芬河，令特普钦派员阻止之。
24日，闽浙总督王懿德负职，清廷委庆瑞为闽浙总督；遵殿为福建巡抚。
25日，赐孙家鼐等一百八十人进士及第、进士出身、同进士出身。
6月：
7日，咸丰下诏给骆秉章，仍令田兴恕回援贵州，兆琛一军自贵州撤回。
9日，英法军六艘军舰自沪启碇北上，英军指挥官为普鲁斯，法军为布尔布隆。
17日，英舰四只抵天津海口，声言随后尚有军舰二十余只，要求入京换约。清廷答以待桂良自沪归来再谈换约之事。对方不听。
6月25日，英法十三艘军舰闯至大沽口，开炮挑衅，清守军立即回击，击沉英舰四艘，英军死伤四百六十四人。清军兵弁阵亡三十二名；直隶提督史荣椿、大沽协副将龙汝元、海口左中营都司奇车布、正白旗护军校塔克慎、干总王世敭，把总张文炳，当场奋战殉国。清廷照例优恤。此役，天津民团亦大力支持清军，为咸丰所称赞。英法联军于7月11日（六月十二日）败回上海。败讯传至英国，虽然有的报纸大肆叫嚣要对中国进行报复，但国会多责备外务大臣与公使布鲁士（代额尔金者）。惟英国首相巴麦尊抱定侵略政策，胁迫国会通过对华出兵案。巴于本年冬，即命额尔金复任全权公使，与法使葛罗率兵二万五千，由印度到中国海岸集结，决心再战。中国大沽胜仗之后兵部尚书全广主张取消天津和约。但咸丰仍坚持和约有效，并向英法说明英法带兵换约，闯我大沽，衅由彼开，如有意修好，则可轻装简从，在北塘换约。
10日，咸丰命奕山更正俄人条约。后又命庆云密查张家口白城居住之俄国人状况。
15日，俄国要求赴三姓地区经商。咸丰诏责奕山办理软弱。革副都统古拉明阿职，并枷号乌苏里地方。
22日，咸丰召桂良等，火速回京；以贾桢接翁心存，为大学士；以许乃普为吏部尚书，张祥河为工部尚书，沈兆霖为左都御史。
23日，上海发生英国船只掠卖“华工”事件，有四十余人被掠至船中。被虐待之华人投水淹死。上海民众为此示威英国等国领事馆。两江总督何桂清迫于舆论压力，将掠卖华人之罪犯林成才等四人处死。
27日，为大沽胜仗，咸丰赏将士银五千两。
29日，又命恒福专办对英人和议事宜，僧格林沁仍防务备战。僧格林沁（？—1865），蒙古族姓博尔济吉特。科尔沁（昌图）人。1853年率蒙古军防堵太平军北伐军，被封为亲王。此次大沽之战，僧为清军统帅。1860年又败于英法联军。1864年与太平军余部赖文光、张宗禹部作战，屡战屡败，次年5月，于曹州吴家店战死。
7月：
3日，特普钦奏：俄人在三姓者，不肯回国，态度强硬。咸丰命景淳前往查办。
5日，云贵总督张亮基奏：回众起事首领马凌汉伏诛。
7日，恒福奏；美国使臣要求进京换约。咸丰许之。
13日，英法兵舰全数开走，陆续返回上海。
20日，李若珠出任福建陆军提督。
8月：
9日，美国公使华若翰呈递国书、和约。咸丰加盖御玺，命于北塘交换。
13日，御史赵元模奏：黄河北流现出滨河田亩三四千顷，请办屯田，以寓兵于农，远较团练为上。朝廷许之，并命袁甲三、庚长议奏。
15日，咸丰诏曰：诸王大臣，继续陈奏审明科场案。随后有奏：程庭桂、程炳采父子入闱后，接受关节，令家人转递场内，程庭桂并不举发。程炳采处斩，程庭桂免死，遣戍军台；谢森墀、潘祖同、潘敦俨等免死，发遣新疆。
23日，命李若珠帮办江南军务。
28日，原山东巡抚崇恩罢职，命文煜为山东巡抚。
9月：
4日，咸丰命恒祺留办广东通商事宜。
9日，咸丰命曾国藩驻军湖口，都兴阿任江宁将军，由多隆阿接统所部，总理前敌事务。多隆阿（？—1864），满洲正白旗人，姓守尔拉特，1853年，提升协领。1856年，于湖北黄州随德兴阿对太平军作战。1859年因打败太平军陈玉成部，升任副都统。
13日，景淳奏：俄国船在三姓者，现令折回；在乌苏里者。未肯听命。咸丰诏令体察舆情，妥为办理。
18日，美国使臣请求先行开市，咸丰以与英、法之条约未定，拒绝之。
21日，御史陈庆松奏，科场案内，大员子弟陈景彦等赎罪太骤，请仍发遣，遭咸丰斥责。
26日，为胜保母丧，咸丰特命：胜保留营视军，不准回籍。
10月：
3日，胡兴仁代理浙抚职，调罗遵殿为浙江巡抚。
7日，王庆云病免，派劳崇光为两广总督。
26日，骆秉章奏：贼中投出难民，给予免死护照，资遣回籍，愿效力者，准其留营。咸丰下旨：均可照办。
27日，云南清军挫败义军，反清首领孙汉鼎被捕杀。
29日，清廷命曾望颜代理四川总督，谭廷襄代理陕西巡抚。
30日，命袁甲三为钦差大臣，督办安徽军务；命侍郎匡源、内阁学士文祥为军机大臣。
11月：
6日，命总兵田在田帮办军务。
13日，授袁甲三漕运总督。
16日，美国公使请求开设潮州、台湾为通商口岸。
20日，清廷命明谊为乌里雅苏台将军；命景廉为伊犁参赞大臣，崇实为驻藏大臣。
23日，咸丰命官文、曾国藩、胡林翼筹划四路进军皖省军事。
26日，以皂升为四川提督。
29日，何桂清与英人商定税则10款，进口十四类，177种；出口十二类，174种。正税值百抽五。何桂清奏：探闻英、法军明春赴京换约，必来寻衅。恒祺奏：英军舰续驶广东。咸丰命僧格林沁加强天津防务。
12月：
11日，特普钦奏：俄国人在黑龙江左岸（北岸），占据五十余个屯子。请调西丹墨尔根布特哈兵交与那尔胡善训练，联络旗民、参夫（拔人参者），作抵御之用。朝廷同意。
14日，命张芾督办皖南军务。
17日，曾国藩奏：太平军韦俊献池州降清。同日“滇匪”攻占叙州、酋阳、秀山。
本年冬：天王洪秀全召开殿前会议商定干王提议之救皖军略：待占领苏、常，即由江南北分别进兵，合取湖北，以解安庆之围。次年秋，由李秀成、陈玉成具体执行。
