索亚图山脉的矮人王城陷落，精灵的故乡阿兰迪尔惨遭焚毁，接二连三的噩耗冲击着联盟各族勇士的内心。古老的萨拉图恩平原，远古众神创造龙族的奇迹之地，如今哀鸿遍野，精灵勇士为失去家园而悲痛欲绝，人类因失去矮人的强援而士气低落，亚萨众神为前景的悲观感到沮丧。
然而森林之神抛洒的热血仍未冷却，从血染的土地中诞生了圣洁的独角兽，他们从晨曦中走来，为联盟军队带来一丝温暖和希望，从赛提斯的血肉中诞生的半人马勇士挥舞着橡木制成的长矛站在了人类和精灵的阵前，甘愿用他们的热血来平息死去神灵的愤怒。浴火重生的凤凰用眼泪治疗伤痛的士兵，人类的盟友红龙一族也展翅飞翔在萨拉图恩的天空，就连丰饶女神亚梭尔也回到众神的阵营，带着她唯一的儿子——这一切罪恶的始作俑者，传递神王意志并蛊惑精灵王的信使——混乱之神卡洛斯来到神裁者的面前，甘愿接受死亡的惩罚。
失去了强大的矮人步兵，人类为了抵抗神王所创造的兽人军团，一部分勇士自愿放弃了原来的信仰和荣誉，他们饮下混乱之神卡洛斯的鲜血，并得到神灵的强大力量。这些勇士成为狂暴的野蛮人，拥有可与兽人匹敌的强壮体格。但这些盛怒之中不分敌我的狂暴勇士虽然是对抗魔族军队的利器，却无法得到人类和精灵联盟的尊重，只有光明之神拉古纳对他们关怀备至。
邪恶的神王终于厌倦了等待和戏耍他的对手，魔族的军队带着腐烂的气息出现在萨拉图恩平原的边界，无数联盟勇士拿起刀斧箭戟，为了深爱的土地不被恶魔污染，为了家人不遭魔族的凌虐，奋勇抵抗。然而失败的命运还是不可避免的降临在了联盟军队的面前。失去西部索亚图山脉和东南部阿兰迪尔的拱卫，已然无险可守的萨拉图恩平原最终在三个方向的夹击下陷落，逃离家园的人类与被击溃的亚萨神族撤退到北方亚特玛山脉的深处，并以崇山峻岭作为阵地继续对抗魔族。
精灵族的勇士则被击溃，一部分精灵受到神王操纵的傀儡——精灵王瑟伊普兰的鬼魂所蛊惑，加入了魔族阵营。另一部分则追随英雄嘉兰希尔逃离战区，潜入亚特玛山脉，寻找众神的踪迹。在亚特玛山脉的深处，已经得到自由的泰坦巨人再次响应了神裁者的召唤，加入了对抗魔族的军队。
在萨拉图恩平原的东北，遥远的塞瑞克高原上，矮人新建的城市银鬃城的国王索拉森得到铸造神厄丰的帮助，沿着高原耸起的边界建造起巨大的城墙，以抵御魔族军队。然而缺少精灵射手和侏儒法师的保卫，矮人和远古之神并未守住这最后的长城，铸造神厄丰奋勇战死，索拉森的军队只有少数得以幸免逃回要塞。神王却并不追赶，为了避免森林之神的覆辙，毁灭之王法尔泽拉布用兽人的肮脏血肉亵渎和腐化了铸造神巨大的身躯，将其变成巨大的怪兽比蒙，成为魔族对抗泰坦巨人的利器——泰坦巨人那无法被龙族火焰撼动的躯体，却在他们的创造者变成的怪兽面前被撕的粉碎。为了对抗这头巨兽，神裁者议会改造了亚特玛山脉的雄鹰，这些被众神称为席兹的巨鹰围绕比蒙的身躯不停盘旋，并伺机而下，攻击比蒙的硕大双眼，并最终杀死了它。
然而这场战争的结果却令人唏嘘，人类部族中的一些少年，因为在战争中无法得到食物，饥饿的孩童偷取联盟的军粮果腹，他们的行为最终导致了联军因断粮而崩溃。只有勇敢的野蛮人顽强的留守在亚特玛群山的顶峰，用热血和生命掩护联盟军队的撤离。孩童们的恶作剧被发现之后，神裁者宽宥了这些无知孩子的罪恶，但惩罚他们终生不得长大，他们被称作半身人，光明之神拉古纳亲自引导这个新的种族以其瘦小敏捷的天赋成为联军中的盗贼和刺客，以对抗神王制造的哥布林哨兵，并沿途袭扰魔族的军队。
战火终于再次燃烧到阿卡迪亚，这片远离灾祸的乐土。神王利用那些投奔黑暗的精灵和森林之神的子嗣作为内应，侵入了阿卡迪亚，并将曾经美丽的乐土焚烧成一片瓦砾。那些追随神王的精灵看到圣地被毁，终于决定背叛神王。他们在精灵游侠罗丝的带领下，逃离了已成废墟的阿卡迪亚，来到索亚图山脉矮人被毁灭的家园，并在那里繁衍生息。这些精灵族的背叛者受到塞纳图斯众神和神王的双重诅咒，皮肤变成死一样的铅灰色，原来的金发也变成干枯的银白，他们的首领罗丝更是被神王诅咒变成了半人半蜘蛛的疯狂半神。这些黑暗精灵从此陷入争斗不休、残杀不止的悲惨命运。
亚萨神与魔族的战争持续了很久，各个种族分化成为新的族群，然而光明之神拉古纳最终找到了结束战争的办法，虽然那看起来并不名誉。亚萨神民的军队在火焰之神塔伦的带领下，与精灵游侠嘉兰希尔、矮人王索拉森以及人类首领法瑞克的联军在阿卡迪亚前线与魔族交战时，一些半身人刺客在光明之神的庇佑下通过未被损毁的地下水道潜入魔族控制的神殿，并用侏儒打造的噬魂匕首，杀死了酒醉的神王，并击碎了他的灵魂。与此同时，幸存的神裁者们分别在远离阿卡迪亚的六个地点共同制造了巨大的魔法阵，以一位古神的强大生命力为代价发动封印将整个联军和魔族一起送到大地深处曾封印魔族的地狱。曾经的乐土化为一片死亡海域，再无半点生机在内。
为了防止法尔泽拉布再次复活，神裁者将杀死他的匕首制成魂器，困住神王破碎的灵魂，并投入阿卡迪亚被毁形成的迷雾之海深处。然而法尔泽拉布的灵魂却并没有消失，他那残存的邪恶力量化为巨大的海蛇利维坦，潜伏在海底吞噬一切他所能看到的生灵，并耐心等待再一次的降临。
战争以最惨烈的方式结束，新生却并未如愿而来。亚萨众神消失在历史的尘埃之中，只有少数几位神灵还会聆听信仰者的祈祷。幸存下来的精灵分化成萨拉图恩平原各处丛林里的游侠和德鲁伊，以及迷雾山岭辛姆拉德的法师和骑士。矮人在萨拉图恩平原的东方，塞瑞克高原上的奥格利特山脉重建了要塞城市银鬃城，并修复了被魔族破坏的索拉森之墙。半身人与人类混居回到萨拉图恩平原西部，并在少数矮人探索者的帮助下建立起统一的人类王国诺曼。侏儒则大部分回到他们独居生活的地方，有些则加入了人类的阵营，以他们的睿智和魔法天赋提供服务。一些兽人、哥布林和巨魔以及魔族远征途中留下的其他邪恶种族，则依然在潘古里亚大陆的各个地方出没，像传说中的巨龙那样，不时出现在人类记载的历史之中。
精灵、矮人和人类分别用各自的方式纪念自己的英雄：精灵游侠葛兰希尔、矮人王索拉森和诺曼国王法瑞克以及他们的军队，然而火焰之神塔伦和他所率领的神裔众民却无人供奉，也许这正是高贵的火神最终变为邪恶的破坏之神“谴责者”的原因。
