白天，国防部中心的实验所。研究小组在竭尽修复空间传送器，但不知能否顺利运行。
显示屏上的国防部长不断地要求研究小组道：“把空间传送器快点修好，这是他们唯一回家的路！”他心里焦虑的想着：“要是不能解决这个问题，我也会因为丢失本国公民的事被弹劾，这该怎么办才好......”
天堂岛，万里无云，山崖覆盖的大雪渐渐散去。某地的山洞中，众人在里面煎熬的生活。
孙悟空发闷气，说：“早知如此，我们在上海不该去理会那个灰太狼，要不然怎么会困在天堂岛这个鸟不生蛋的地方。”
绿川直却说：“如果不理会灰太狼，他说不定早就把全上海给毁灭掉了。”
多纳泰罗也说：“现在我最担心的就是斯普林顿老师了。倘若斯普林顿老师在这，我们也不会落到这般田地。”
米开朗基罗表示：“这山那个地方都没吃的没水，我都快饿死了。”
青木丽华认为：“再忍忍吧，柯南和小樱已经去找吃的了。”
这时，红秀丽询问喜羊羊和阿尔托莉雅：“在山洞待了这么多天，不知道我的企业怎么样了？”
喜羊羊表示：“我不敢保证，你背叛梦原希那件事被传了出去，你的企业就算保得住也惨了。”
阿尔托莉雅认为：“现在最紧要的办法就是想好对策。梦原希做事从不手软，她一定会派更多的黑翼军团把整座岛翻个底朝天，非得把我们找出来。”
喜羊羊赞同阿尔托莉雅的话，也说：“这里不是久留之地，不马上离开恐怕我们几个都吃不了兜着走。”
乌贼娘问喜羊羊：“要是被发现了怎么办？”
喜羊羊表示：“那就只能祈祷我们很幸运。”
柯南和小樱出去找吃的，然在荒郊野外的大山上，什么吃的都没有。柯南差点把蛇给招来了。
这时，小樱很快找到了几个长在树木下的蘑菇，两人拔完了所有的蘑菇，然后就回去了。
两人回到山洞，众人都等着吃饭呢。于是，青木丽华、小樱、法音三人准备做饭。但柯南却在这个时候看见这个蘑菇越来越感到不气味......
几个分钟后，蘑菇汤很快做好了，众人准备开吃。黄濑弥生抱怨乌贼娘抢她的蘑菇，米开朗基罗和孙悟空狂吃蘑菇，只有喜羊羊、阿尔托莉雅、柯南、小樱、茵蒂克丝、美美野来未等人没有吃蘑菇而只是都在谈论对付黑翼军团。
突然，乌贼娘和米开朗基罗都感到肚疼。紧接着，达芬奇、星空美幸、孙悟空、日野茜、绿川直、拉斐尔、多纳泰罗、法音、黄濑弥生、青木丽华等人刚吃完蘑菇也相继感到肚疼，倒在地上痛苦万分。喜羊羊等人见状，连忙扶起众人，红秀丽回来也看见了这一情形后一赶过去帮忙。这时，柯南怀疑这些蘑菇有些古怪......
喜羊羊等人无奈将痛苦的众人分别躺在垫子上。茵蒂克丝担心乌贼娘会不会出事，她想陪陪乌贼娘。
喜羊羊不解道：“这其中究竟发生了什么？”
这时，柯南看着手中的蘑菇，顿时明白的告诉众人：“我太糊涂了！这其实是苦菇，一种生长在天堂岛内陆的毒蘑菇。只要吃下了这个，立刻让人痛苦难忍，无可自拔，最后直致死亡。”
听了这句话，小樱后悔的说：“我当时不该采那个蘑菇。”
阿尔托莉雅认为：“事已至此说这些还有什么用，得赶紧想个解毒的办法。”
喜羊羊提出：“我在青青草原钻研过医学，解除蘑菇的毒素的办法就是得找个药材。”
于是，为了除掉众人身上的毒素，阿尔托莉雅等人按照喜羊羊的建言，分别在这座山上找到解毒的药材......
过了许久，阿尔托莉雅、美美野来未、茵蒂克丝、柯南、小樱等人各自在山崖各处采到了药材。黄昏，喜羊羊在山崖上的树丛中也采到了药材。不料，他竟然看见沃夫伦在带领黑翼军团在这全面搜捕。情急之下，喜羊羊赶紧下山警告众人。
阿尔托莉雅等人事先回到山洞将药材制成药汤给众人服用。过了许久，众人慢慢变好了，星空美幸问道：“我知道我自己到底怎么了？”
这时，喜羊羊跑回来提醒大家道：“黑翼军团正在全面搜捕我们。”
众人大惊！美美野来未觉得：“这山洞也无法隐藏多久，建议大家马上离开。”
众人全都赞同美美野来未的意见。
于是，众人赶紧收拾东西，离开山洞往南逃去。而在之后不久，沃夫伦知晓喜羊羊等人就躲在这座山里面，带人进入山洞发现一个都没有，只留下几个旅游用的物件。
沃夫伦见那帮人已经在自己来之前逃了，只好命一些部队分成几个小队各自搜捕喜羊羊等人！
喜羊羊等人逃到山下丛林，不料却再次被黑翼军团发现并全面攻击，无奈与黑翼军团交战。之后黑翼军团被打败，喜羊羊等人继续前进，逃出丛林却被沃夫伦带领的黑翼军团包围。
沃夫伦得意的说：“到最后你还是败给了我，美美野来未。在这世上反抗尼罗帝国的活动无奇不有，但个个都是知难而退。当然就连你，也不可能。”
美美野来未反驳他说：“我不会让你们的阴谋得逞！”
之后，喜羊羊和阿尔托莉雅再也无路可退，为了和大家一起活下去最终向黑翼军团发起挑战。
喜羊羊和阿尔托莉雅与黑翼军团数次交战，不敌沃夫伦落败。沃夫伦嘲笑美美野来未：“这就是你找来的外来者？”
这时，红秀丽穿着高级战甲再次赶到击退了沃夫伦。红秀丽不想让黑翼军团带走众人，先行带众人消失了。
丛林内一栋破败的房屋内，红秀丽带众人现身在这。喜羊羊感激红秀丽的出手相救，说：“我想知道关于梦原希的一切信息。”
红秀丽很无奈的告诉他：“梦原希把彩云国企业纳为己有，所有的东西都被黑翼军团使用。好在我事先把别墅炸毁，里面的资金也已经不翼而飞了。”
乌贼娘说：“这样一来，黑翼军团没钱制造更加强大的武器了？”
达芬奇插话：“我想搞清楚这里是哪？”
红秀丽告诉众人：“这里其实就是一家遗弃的旅馆。看起来没什么特别的，但实际是我和美美野来未方便联络的地点。”
美美野来未也说：“上次那件事之后，很少有人去看见这反抗者的秘密接触场所。”
红秀丽又说：“不关是这样，由于黑翼军团的疯狂扫荡，反抗者如今已是越来越少，并且牵连了无辜......”
拉斐尔听了，大怒，说：“黑翼军团实在是太不人道了，镇压反抗关那些平民有什么事？”
日野茜也表示怒道：“那帮人就是一群刽子手！”
茵蒂克丝想问红秀丽：“不知道世界各国领导有什么看法，他们为什么不对梦原希加以制裁？！”
红秀丽却说：“还是和往常一样。因为他们担心一旦与尼罗帝国发生摩擦，他们就会出动极为恐怖的“超级武器”对它们来一次毁灭性打击。恕我直言，他们真的无能为力了。”
孙悟空惊恐的说：“那怎么办？难道眼巴巴看着黑翼军团为所欲为吗？”
美美野来未说：“很遗憾，他们怕黑翼军团的行动会伤害己的利益，他们想祸水东引，把矛头指向弱小的国家。这种行为不仅让黑翼军团的气焰嚣张，也严重削弱了反抗者的志气。”
阿尔托莉雅认为：“这种事还得由我们自己去办吧。不管他们做了什么，都已经完全破坏了岛上的自由。”
喜羊羊也表示：“我们现在唯一的办法就是抓紧时间，搞乱他们的计划。”
星空美幸赞同喜羊羊的意见，说：“我们不能再失利了。”
柯南说：“无论他们掩盖了多少罪恶的真相，总会有被揭开的一天。”
小樱也说：“为了塞巴斯蒂安。”，莲音也说：“为了法音。”，达芬奇同样也说：“还有为了成千上万勇于反抗独裁而死的反抗者。”
乌贼娘说：“我们要齐心协力。”阿尔托莉雅说：“让我们放手去干吧！”之后，喜羊羊激昂地说：“刻不容缓、我们绝不放弃！打败梦原希！”
然后醒悟的众人们在房间内群起激昂！
