嘉庆十一年（1806年），贵州开立“筑青山”，主其事者为林怀明。次年，林怀明在河南滑县起事，从狱中劫出会首李文成、当时曾有山东泰安的几个州县响应。其后又有林清在北京起事，他本来与河南的会众约期共同行动，但因约期有误，林清先期约集了200人从宣武门入城，分头进攻东华门、西华门，并有太监作内应，但被宫内护卫发觉，林清看形势不利，立即退走。事败。其后河南会众起事，亦告失利。会众不得己分散四方，河南各地的起义军始平息。道光二十八年（1848年），福建泰宁县的郭永泰从渔人手中获得郑成功开山时订立的“规律”。这是郑成功的孙子郑克爽被清军围困紧急时，把“规律”和重要文书装在铁箱里沉于海底的。此后，洪门中就把他称作“海底”，通用于各地的洪门团体。但因历时已久，原本遗失，流传的本子内容不尽相同。
洪秀全发动的太平天国运动，从道光三十年（1851年）十二月金田村起义至咸丰三年（1853年）二月定都南京，直至同治三年7月（1864年）清军攻陷天京为止，原有三合会参加在内，同时各地三合会会众看到洪秀全起义胜利，也纷纷发动。如广州方面：三合会众占领了肇庆、佛山、东莞等地，广东省城几被包围；福建方面：会众占领过厦门；上海方面：广东人刘丽川、福建人李咸池等起义，攻占上海县城，他们的组织名叫“小刀会”，属于“天地会”的一个支派，后来，刘丽川在战斗中壮烈牺牲，上海县城才复被清军占领。洪门的每一个团体，各有其山名、堂名、水名、香名、内外口
号，还有一首诗。由于在清代洪门是抗清秘密组织，所以采用许多暗号，以防破坏分子混入。上海有三十个红帮团体，其中影响较大的有五圣山、五行山、侠谊社等。五圣山是上海红帮规模较大的一个团体，有弟兄千余人，分设仁、义、礼、智、信五个堂口。五行山的前身是四川帮的民兴社，山主是江禹丞，此人在青帮中是大字辈（当时青、红两帮杂交，有些人先后参加两帮）。
那么，青帮又有何来历呢？青帮组织，实际上是在清朝雍正初年为了承运漕粮而形成的，但帮中人却把其历史渊源，推前到明朝，以明永乐朝有文渊阁大学士金幼孜为其第一代祖师。金幼孜号碧峰，祖籍应天府、（南京）麒麟门外三十里金家堡，生于元顺帝至正六年（1346年），明洪武进士。先在北京燕王府朱棣前任职，后随军南下，负责都督粮台。燕王在南京正位后，金任工部左侍郎，永乐间迁都北京，改任文渊阁大学士。及成祖亲征辽东，金奉命都督粮运，不久辽东平定，随成祖凯旋回朝。当时他看到仕途险恶，厌弃红尘，衷心仰慕达摩，因此上表辞官，隐居栖霞山紫云洞修炼。后又转至五台山求戒，拜佛门禅师临济派三十六传人鹅头禅师为师，取名清源，从此在紫云洞隐修，数年后去世。这就是青帮以达摩为始祖，把金幼孜尊为第一代祖师的来历。
第二代祖师是罗清，号净清，甘肃兰州府渭清县东乡罗家庄人。十七岁时，他考中明朝嘉靖恩科举人，后赐进士出身。擢任监察御史及户部侍郎。吐鲁番犯边时，嘉靖帝任为玉门关都督，领兵直抵番边。传说罗清年轻时为人仗义疏财，广交各地好汉，不管绿林响马，山寇大盗，只要义气相投，无不结为金兰。后来不知怎的，他笃信李聃一脉，就此皈依道教，到处寻访名山胜景，奇川异瀑。后来番边暴乱，无人敢往，罗清才揭了皇榜，接受嘉靖帝的任命。罗清带领2万精骑来到番边，与“蛮夷”部落进行了生死搏斗。血战后不幸被困于两狼山下，粮尽三天，杀马充饥，忽来一和尚相告，寺后石崖下有本朝清源禅师北征时所储藏的粮食，往取果如其言。全军饱餐后次日出击番营，飞剑斩杀了番将，一直追到漠北番都，番主见了大为震惊，视罗清为异人。在他的说服下，番主表示以后永不叛明，罗接受降书，大获全胜而回。归途中经过五台山，访求清源禅师遗迹，由北寺方丈恨修禅师指引，从佛龛中取出金幼孜的经典遗物，并悉嘉靖曾封金幼孜为护国禅师。罗清深受感动，即由恨修禅师领至金幼孜的塔下，拜金为师，后人在师父死后拜师，称为“灵前孝祖”，就是起源于此。后来，罗被严嵩父子暗害，入狱十二年，万历年间由于边疆需要，把他释放，但他立了功不愿受禄，乃至栖霞山紫云洞金幼孜修炼处修道，在那里终了一生。
第三代祖师陆逵，号道元，江苏镇江府丹徒人，自幼学武，练有童子功、踏雪无痕等高来高去绝妙功夫，精于剑道，当过江右总兵。明亡后隐居茅山。后慕罗清征番之功及其能通满、汉、蒙、回、藏语言文字之能，又为佛教禅宗嫡系，因此到五台山求道。清初，陆逵云游新疆、甘肃一带，看到回民与汉人由于宗教不同而争执械斗，就向清廷条陈用宗教感化之策，为康熙嘉纳，授以西北宣化法师名号，赴西北宣化订立回汉约法，规定回汉人民互相尊重风俗习惯，各守其制，两不相犯。回京复命后，康熙大喜，议按授以官，他却乞归学道，就封他为清国尊上人，并加封其师罗清为一清佛祖。晚年，陆逵在杭州宝华山刘氏庵内讲经说法，听者甚众同，殁于雍正七年（1729年）以上金、罗、陆三人，帮中人奉为“前三祖”，都与佛教禅宗有渊源，所以后来的青帮组织带有一定的宗教色彩。
青帮的真正祖师，起自陆逵的徒弟翁岩、钱坚、潘清三人，即所谓“后三祖”。翁岩字福亭，江苏常熟人，祖居山东东昌府聊城县，其后迁居河南南阳府。出身秀才，后弃文向河南嵩山少林寺僧习武，习练至阳至刚的罗汉十八式及蛤蟆功；喜与绿林好汉交往，并入天地会，为会务奔走四方，到处为家，性情刚毅，心胸开朗，不善词令。钱坚字福斋，号德正，江苏武进人，迁居安徽徽州府。为人精明勇敢，幼从父经商，移居开封。十六岁父母双亡，无心继承父业，改习拳术，曾凭一双铁掌打遍天下无敌手，后入天地会，与翁岩同隶张岳部下，张是天地会的首领。
潘清字清宇，号德林，浙江杭州人，先移住安庆，后又迁居河南开封。承父母余荫，富有财产，幼年读书，颇以诗词歌赋自豪，会十八般武艺，人如玉树临风，号“圣手书生”。潘清为人勇义，好交游，地方上即以“小孟尝”称之。翁岩、钱坚二人奉张岳之命，到安徽访潘，三人都是天地会道友，一见如故，结拜为异姓兄弟。三人结拜后，一起出门访求志同道合的人，乃至杭州陆逵处听讲，对陆非常敬服，要求投拜门下。陆逵一开始不愿收受他们，就遁身避到江南杭州武陵门外一座大山前（一说是灵隐飞来峰前），那三人也追到那里，眼见得陆逵侧身进入山洞，说也奇怪，那三人都无法进入这山洞。因求师心切，就日夜跪守在洞外。那翁岩、钱坚、潘清三人跪在洞外，一连三日三夜，也不进饮食，直跪得血染足踝。陆逵被这三人精诚之心所感动，便收了他们做徒弟。这样，师徒四人在山中修行了几年后，一天，陆逵叫三人入内，面嘱他们进京求取功名。那三个兄弟向陆师父苦苦哀求，情愿终身事师，不原进京求名。三人倒身下拜的时候，抬起头来忽然不见了陆逵师父，弄得三人面面相觑，非常吃惊。既然陆师有嘱，三人怎敢违背师父？三人便迤逦来到了杭州。雍正三年，清政府悬榜招贤，加强漕运。三兄弟意图以粮帮为基础，组织一个大团体，便到河南抚署揭榜承运。当时，河南抚署抚召田文镜也是杭州人，三人便向其备陈了漕运办法。田文镜与漕督同上奏本，经雍正批准，指定当漕运总督张在有节制，并听命于勘视河工的钦差大臣何国宗指挥，准许开帮收徒，以定统一粮务。他们接受任务后，先在开封府潘清家中召集各地天地会头目磋商，得到了一部分人的赞助，并联络旧有粮帮，统一了粮帮组织，推翁、钱、潘三人为首领，组成了一个“道友会”，供奉达摩为始祖，金幼孜为第一代祖师，罗清为第二代祖师，陆逵为第三代祖师。他们开办粮运，首先设厂造船，统一尺寸，绘成图样，亲自监工造船。传说共造了9999只半（所谓“无半不成帮”，半只是脚划子）。第二步是协助清廷开办浚河工程，动员山东民夫十六万五千人，用银一百一十万两，开浚河道，打通了南北水运。
