鲁王很是为难，若是下旨斩马士英，只怕于方国安面子上不好看；若用此人，朝中文武、绍兴百姓如何肯依？便将目光投向负责处理政务的熊汝霖。熊汝霖见到鲁王正望着自己，心知要自己替他解围，便硬着头皮道：“臣细细一想，弘光覆灭，罪责不在一人，而在于党争也！人非圣贤，孰能无过？马士英虽有误国之嫌，但却拒不降清，还是……还是有些忠义的。以臣愚见，莫如让他以待罪之身，将功折罪……”
熊汝霖一番违心之言，立马遭到群臣的一片怒骂！熊汝霖见所有矛头皆对着自己，大汗淋漓，赶紧退下，不敢再发一言。
鲁王也是浑身冒汗。马士英为谋复出，除走方国安这一条路之外，还另辟蹊径，投太后所好，送上奇珍异宝无数。老太太很是高兴，便在自己面前替马士英说情。在朝堂之上，提马士英复出的，自己是始作俑者，却不料引起轩然大波。无奈只好施缓兵之计，挥手道：“你们这一闹腾，孤让你们弄得头晕得很。你们暂且退下，容孤休息片刻，再做答复！”
百官退出殿外，却仍聚集着不肯散去。半响之后，宫内传话，要张岱入宫见驾。百官们纷纷议论道：“张岱乃陛下从山东带过来的心腹旧臣，此刻陛下要他入宫，定有要事令他去办！”
未到一柱香工夫，张岱面露喜色，一路小跑着出来。百官立刻围上前来，七嘴八舌地询问。张岱本欲不言，可是百官哪会放他离去？！便气喘吁吁地道：“陛下确实是让我等给闹晕了头！我进宫之后，被带到御塌前，只见陛下瞑目想了许久，方才下诏，要我速带禁卫军前去杀了马士英！你等不要再围着我了，若让那厮跑了，我可吃罪不起！”
众臣大喜，慌忙散开，让张岱过去。张岱从御林军中选出一部，前去杀马士英。
且说马士英先天晚上托人进宫，给太后呈上重礼之后，使者回到会馆，带回口信说，太后已经应允，替自己在鲁王面前说情，但心中还是惴惴不安，夜不能眠。天亮之后，便派人去宫外守着，打探消息。
正在此时，马士英听到会馆外一片嘈杂之声，无数人高喊道：“杀马士英以谢天下！”马士英大惊，慌忙派人去会馆外打探。家人出去片刻，慌慌张张地奔回来道：“禀大人，街道上数万百姓聚集请愿，朝鲁王行宫走去，一路上还喊着口号，说……”
马士英挥手道：“你不必说了！速速收拾行李出城！”
等张岱到了会馆，马士英一行人早已泛舟逃出城去。待到天黑下来，马士英等人来到方国安营中。马士英垂泪，对方国安长拜道：“士英知鲁监国要杀我，便冒死来到军中，欲将功劳送与荆国公！”
方国安怒道：“马公将我视为何等人也！我与马公相交数十载，如今马公落难之际，我岂是落井下石，卖友求荣之辈？！”
马士英抹泪道：“知我者，荆国公也！人生得一知己，虽死何憾！”
方国安也垂泪道：“马公且放宽心，暂且栖身在我军中！钱肃乐、黄宗羲、张煌言、王思任、张岱等宵小手再长，也不敢把手伸到我军中来！”
恰在此时，帐外一阵喧哗，亲兵入帐禀报道：“张岱奉鲁监国口谕，前来军中捉拿马大人。守营将士阻挡不住，已经让他闯进来了！”
方国安大怒，道：“击鼓升帐，我看他张岱如何拿人！”
营中击鼓升帐，三通鼓未歇，各部将军便纷纷赶到，分列在帐内两侧。马士英暂避在帐后。
张岱带着两名禁卫军将领也入帐来。方国安道：“张大人深夜到我大营，有何要事？”
张岱拜道：“禀荆国公，下官奉鲁监国口谕，前来捉拿马士英问罪，还要请荆国公行个方便！”
方国安冷笑道：“鲁监国口谕？今日你我皆在朝堂之上，怎么本帅未曾听到？”
张岱道：“陛下退朝之后，便唤下官入宫见驾面授机宜，是以众人不知罢了！倘若荆国公有甚疑问，明日早朝，一问便知！”
方国安道：“明日辰时，我大军要沿江北上，攻打杭州，没空前去早朝！你这口谕，是否真假，姑且不论。你又如何敢说马士英在我军中？无真凭实据，就敢前来我军中拿人？莫非我军营之内，便如市集一般，你想来便来，想走便走？”
张岱道：“荆国公，下官若非有真凭实据，哪有此胆敢夜闯军营？马士英此人，祸国殃民，若究其罪，当千刀万剐！下官知荆国公与马士英素来交好，盼荆国公能舍个人小义，取天下大义！”
方国安冷笑道：“如此说来，张大人已经认定马士英在我军中了！如此甚好，便请张大人将我军营内外搜上一搜！”
张岱抱拳道：“下官不敢!只是下官奉旨行事，望荆国公勿要为难！”
方国安怒道：“莫说马士英不在我军中，即便在我军中，你便要强拿人怎地？！你等文臣，只需管好份内之事，军旅大事，不是你等想插手就能插手的！话无需多说，我与众将要商议明日进军一事，恕不远送！”
张岱还待多说，两侧武将数人大喝道：“还不快滚！”更有数将奔上前来，将张岱等人推推攘攘，驱逐了出去。
张岱等人被逐出大营，无奈只好回去复命。鲁王一听，心道如此更好，既不会得罪太后和方国安，又成功将马士英逐出绍兴！只要此人不得出仕，便可化解满朝文武和百姓的满腔怒火。于是也不追究张岱执行不力之罪，只吩咐他下去歇息。
第二日，方国安果然未上早朝，带领所部将士，继续钱塘江上一日游。群臣见方国安如此袒护马士英，心中虽是愤慨，但见鲁监国都不以为是，又能奈何！
退朝之后，黄宗羲长吁短叹，陈函辉、熊汝霖、钱肃乐、王思任等人随黄宗羲一同散去。黄宗羲摇头道：“方国安此人，还是颇有几分忠义的！先帝在时，曾将太子文托付给钱升、姜逢元、姚明恭，王铎、方逢年等人，武则托付给方国安。俗话说近朱者赤，近墨者黑，我却怕方国安被马士英误导，两人沆瀣一气，如此必酿成大祸！”
陈函辉摇头道：“********！只是方国安如此袒护马士英，我等即便心知马士英在他军中，又能如何？！”
好歹虽不能杀了马士英，却也成功将他逐出绍兴，众人无可奈何，也只能如此了。
方国安也知自己因偏袒马士英，引起众怒。虽是自己手握兵权，却也不敢太过放肆。马士英复出之议再不敢提，只得将他派往钱塘江畔，协守钱塘。
马士英遭绍兴军民一番驱逐，幸庆多亏自己逃得快，否则定死在绍兴无疑，再也不敢嚣张。于是尽心尽力，协守钱塘，以图戴罪立功，东山再起。
太平府刘孔昭弃城而逃之后，负责监军的阮大铖也逃到杭州。谁知刚到杭州，潞王监国仅仅六日，便开杭州城门向清军献降。阮大铖本欲与郑鸿逵一起逃往福建，谁知郑鸿逵冷言冷语地道：“阮公此去，欲献头颅于我兄长乎？！”阮大铖大惊，不敢南下，只得隐姓埋名，在浙江一带东躲西藏，如过街老鼠一般。
听闻马士英在浙东安定下来后，阮大铖心中甚喜，便遣使者携书信前去拜访。谁料马士英知道送信之人乃阮大铖亲信后，勃然大怒，将书信撕碎，怒道：“我能复出，全奈阮大铖从中斡旋。我复出之后，也曾将他从阉党逆案中顶着无数压力，替他翻案，并委以重任，官至兵部尚书一职！谁知他竟如此负我，让我背上千古骂名！你回去告诉阮大铖，他的恩惠，我已回报！至此与他恩断义绝，两不相欠！”
阮大铖听得回信，方知绍兴之行万万不可，便去投奔昔日好友朱大典。阮大铖虽曾因个人恩怨，背叛东林党，依附阉党魏忠贤，被定为阉党逆案中人，永世不得录用。却财大气粗，自诩为及时雨，有钱能使鬼推磨。崇祯年间，听说东林党人正四处活动，欲让周延儒复出，担任首辅一职，便动用自己和冯铨的关系，和东林党人达成默契，政治献金无数，保得周延儒成功复出。谁知终因自己是逆案中人，不得翻案复出，便推荐好友马士英，成功保他官运亨通。朱大典与他为同年进士，自然也得阮大铖不少恩惠。
阮大铖虽曾为一介布衣，赋闲在南京，却总能成功利用自己的各种关系，上下疏通，为朝中大臣做掮客，买官卖官，生意兴隆。又加之个人才华横溢，家中私蓄戏班，朝中重臣，特别是南京陪都重臣，皆为阮大铖府中座上佳客。此时阮大铖早已为谋复出做着各种努力，凡是东林党人，或是复社中人经济拮据，明里暗里，总要献金无数。无奈自己头上总被扣着阉党的帽子，再怎么努力也无济于事。好在马士英当权后，顶着压力举荐自己，更有刘孔昭等人替自己说话，才终得复出。复出之后，便买官卖官，以收回自己的十余年的投资，更是翻先帝崇祯早有定论的逆案，对反对自己复出的东林、复社人大肆打击报复。
朱大典在南京沦陷之前，也弃城而逃，至家乡金华，四处招兵买马，建立起自己的武装。鲁王监国后，因定策立功，又拥兵上万，被鲁王拜为东阁大学士，与张国维一起督师浙江。朱大典见阮大铖前来投靠自己，甚为高兴。阮大铖口才甚好，一来便高谈阔论，谏言应如何防守金华。朱大典被阮大铖忽悠得服服帖帖，便邀请阮大铖与自己共同治军。金华的士绅百姓哪里容得下阮大铖，皆称他为乱臣贼子，四处张贴檄文申讨阮大铖。朱大典无奈，又托不开私人情面，便将阮大铖远送至驻守钱塘江的另一支部队栖身。
鲁王虽在绍兴成功监国，政令却仅行于浙东一隅，时间上比福州唐王建立的隆武政权又慢了一天。因此当鲁王得知隆武政权建立之后，监国地位十分尴尬，由此引起政权之争。此乃后话，暂且不表。
