初平四年初春,董卓携新婚夫人巡游河南尹,与一县承枣祗相谈甚欢,并亲自选种于田头,后调拨仓储新谷与该吏,进户部典农都尉,主司州春耕事宜。后选中牟令任峻屯田都尉掌管河内军民屯田事宜。二月董卓巡于弘农遇到长安故人荀衍、荀谌,二令治理有方被分别提为弘农太守与洛阳长史,太守张辽专事兵马。后经过荀彧、荀攸叔侄恳请,转调安定太守。二公为避嫌而远亲友,董卓深厚其家,荀家子弟入太守,县令、长之位者达三十余人,被人戏称半朝。卫仲道死后,董卓举卫家旁系卫觊、与雍州杜畿分守河东、平阳二郡,皆为一时才俊,司州大定。农事初兴。司隶区五控其四,都有能吏掌控,外加南阳宛城徐晃,河内刘备所占部分县城,司州初兴。董卓欢愉不下新婚。一日偶游到黄河岸边,发现有木质怪物从河中引水浇灌。卓甚奇之,寻乡里求问,引见一老年寺人,其人恐惧万分。后经过董夫人劝慰,得知其人为十常侍之毕岚,自幼好匠活,其物为水车,是他根据鲁墨典籍启发制作而成。水车制作很是粗糙,因毕岚身体残疾并且老迈,不利取水灌溉,请邻里农夫制作,随多有不足,可构思奇巧,功用非凡,董卓很是敬佩,当下赦免毕岚前罪,让其领将作大匠入工部。受毕岚启发,董卓亲自带领工部官吏走访河渠。其年经过大幅改装的水车分布主要河渠,原有堤防工程经过改变,已经变的灌溉与防洪相结合。自此后司州每年拨出大量费用,修建灌渠建造水车,五年后,司州,雍州的大半耕地已经能够得到有效灌溉,并且在凉州部分地区也有推广。三州粮食产量已经倍增。初平四年秋,董卓因毕岚等乱世遗存的功绩,请旨大赦当年遗民,近万受十常侍与何进、袁家株连人员得到释放与还乡。当年司州大熟,司隶区自给有余,雍州负担锐减,为凉州之战的最后胜利做出了必要准备。经过三年的恢复,司州的田亩已经超过了黄巾之乱前的水平,人口也有从前的七成上下。董卓把精兵简政平赋宽民的政策逐步推广实施。在以后的时间里得到了下层世商与官吏的的广泛认同。董卓所属三州三种治理方法,司州到现在已经基本上用了董卓式的治理方式,虽然具体方式上还很不全面,但是其中的生命力还是很强大的。雍州经过荀彧三年的的努力,治理更像是汉初的修养生息,简直是世家管理与汉制的完美结合。由于没有后期的腐朽,兴旺程度远胜司州。凉州现在大半是军事管制,只有东边的郡县才相对平和,由于董卓的不断嘱托,和与董卓相处日久也渐渐接受了董卓的思想的钟繇与贾诩的努力,凉州并没有对被征服的羌族、氐两族进行屠戮,而是相对友善的把他们划分相对小的的部落,分给他们适宜游牧与耕作的区域,也许是出于统治的需要,部分氐族人口被动员到了雍州屯田。羌族的青壮男子多被动员到了吕布的兵马之中。使吕布十五万的兵士之中到有三分之一时羌族的猛士,由于前期的铁血征伐与后期的怀柔分化的结合,两族民众已经对董卓代表的大汉朝廷十分的认同。劫后余生的很多贵族主动的加入了董卓的官吏之中,由于董卓部队喜欢杀官宦及贵族的习惯,残余的贵族是远远不够去统治这么多的族民。经过半年多的稳定及准备,董卓所部进攻的方向之争已经到了最后时刻。董卓在犹豫,东归,北上与继续西行的利弊都摆放到了董卓的案头,董卓一时也很难取舍。
在董卓的难于取舍中,半年的时间很快过去了,中平四年秋董卓终于艰难的做出了分兵出击的决定,因为董卓已经不能够再等待了,如果再等下去,严冬即将到来,吕布所面对的不再人敌人而是恶劣的气候。吕布军团、军师贾诩,华雄为先锋,李傕,郭汜、樊稠、王方、董璜、段煨等部十万余人奉命西征,命年内收复敦煌,其后以敦煌为依托,收复西域都护所辖。牛辅所部,先锋关羽,军师西凉刺史钟繇兼任,所部张济、胡轸、杨定、年内迅速东归,主要扫荡羯族东部及匈奴南侵的左贤王所部、并牵制鲜卑及并州叛军变相支援韩遂及刘备所部。其部主力约三万余人,连同驻防部队将近五万,其实让他们去收复并州打击鲜卑,董卓也深深的知道不够。他只是不敢全力西进而选择的名东实北的折中方案。在人员的配置上,董卓对西征的以战养战格局已经定下,因为他现在根本就没有足够的粮食供应西征大军,派出三五万兵士北上恐怕已经是他供应的极限了。随后在雍州荀彧的支援下,鲁肃选派了足够的郡县上层官员,由于董卓军队文职人员的匮乏,董卓不得不向刘表、刘焉等相对友好的势力借调了些下层官吏。作为回报,董卓让出了半个南阳。刘焉的小儿子璋被任命为CD太守、左中郎将。随后董卓及李儒等又紧张的投入到了第二次武科举的举办当中。