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就在川民惶惶不可终日的时候，古老中华大地终于迎来了一缕新曙光。
公元1912年1月1日，即清宣统三年，农历辛亥年冬月十三，孙中山在南京宣誓就任中华民国临时大总统，宣告中华民国成立，通电全国。
从这一天起，中华民国采用公元纪年，宣布独立的各行省同时废止了清宣统纪年，也废止了由湖北军政府率先使用的黄帝纪年。
纪元翻新，国事也翻新。
锦城大汉川省军政府和渝州蜀军政府都收到了通电，为了响应孙中山和平建国的号召，成、渝两个军政府的首脑都放弃了武力统一的打算。
川省两军政府合并的谈判也开始了。
大汉军政府通过胡景伊摸到了大蜀的底牌，在谈判中占了先机，在满足自己的愿望的同时，也尽量让大蜀觉得满意，又经各方调解协商，双方派代表会商，于腊月十五（公元1912年2 月2日）签署协定：以锦城为政治中心，设川省军政府，以成、渝两处都督分任正副都督；渝州为重镇，设镇抚府。
川南、川东北两军政府支持成、渝合并，自动取消了这两个川省成立最早的军政府，所属军队也按川省军政府的通令整编成了地方治安军，并裁减数量，缩编成一个协。
这样，川省宣告统一，尹昌衡出任川省军政府都督，张培爵任副都督，渝州镇抚府以夏之时为镇抚总长。原锦城大汉军政府副都督罗纶则出任川省参议院议长，不久后，罗纶就出川担任中华民国参议院的川省议员总代表去了。
之后，都督尹昌衡发布通令，整编全川军队，镇、协、标、营、队、排、目的建制，改成了师、旅、团、营、连、排、班。
川省军政府掌握的军队整编为五个陆军师：
原大汉川省军政府所辖第一镇为川省陆军第一师，师长周骏。
原大汉川省军政府所辖第二镇为川省陆军第二师，师长彭光烈。
原大汉川省军政府所辖第三镇为川省陆军第三师，师长孙兆鸾。
原大蜀军政府所辖“中华革命军”第一镇为川省陆军第四师，师长刘存厚。
原大蜀军政府所辖“中华革命军”第二镇为川省陆军第五师，师长熊克武。
川南、川东北分设地方治安督办署，两地原有的一协地方治安军改协为旅。王天杰任川南地方治安督办；李绍伊任川东北地方治安督办。
政府合并了，军队整编了，川省地方整肃、重建也就提上日程了。
随着中华民国的成立，全国宣布清政府独立的省份都致电中华民国临时政府，纷纷表示拥护共和，清政府也把应对革命的全权交给了内阁总理大臣袁世凯，袁世凯见清王朝大势已去，就命令北洋军停止了对武昌的进攻，南北开始和谈。
川省周边省份都已宣布独立，湖北战事已停，川省的两军政府实现了合并，统一整编了原属两军政府的军队，也无需派兵出川，表面看川省也算是大局已定，但这并不意味着川省的太平日子就此开始了。
自从辛亥年七月十六，保路军在锦城与赵尔丰统帅的驻川清军开战后，全川是各种小股武装蜂起，势力强的，就攻击县城，驱逐或杀死清朝的知县，占据县城，自封名号；势力弱的，就占据村、寨、小镇，自立山头，独霸一方。而今，中华民国川省军政府成立了，这些地方势力虽然表面支持，但实际上并不遵从军政府的号令，俨然成了一个个的独立王国。这种局面若不解决，爆发新的战乱就是在所难免；军政府要统一政令、军令，要想使政令通行，要开始全川乱后的重建，就根本不可能。因此，军政府把整肃地方提上了日程。
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为此，军政府都督尹昌衡专门召集了军政府会议，商讨地方整肃、重建事宜。
会议开始后，尹昌衡首先说道：“各位，现在南京中央临时政府正与北方和议，天下大部分行省宣布独立，支持南京中央临时政府，共和是大势所趋，想必不久就能实现国家统一，天下共和，而且鄂省战事已停，我省已不须出兵增援了。是不是我们川省就可以开始乱后重建了呢？事实上，乱后重建还无法进行，因为军政府的政令还不能通达全川，说得实在点，军政府的政令，也就仅能在锦城、渝州和少数几个州、府施行。问题出在啥子地方呢？就出在，大部分府、州、县还是独立王国，各种势力在这些地方割据称王，这些草头王，有些在口头上承认我们这个军政府，但实际上是各自为政，各行其是；更严重的是，有些草头王连口头上都不承认我们的军政府，所以，要完成全川的真正统一，要让军政府的政令、军令在全川通行，要开始乱后的重建，要全川的百姓尽早过上太平日子，军政府必须立即着手全川的地方整肃！今天，请各位来会议，就是议这个地方整肃，要拿出整肃的措施来！下面就请各位直抒己见，我们集思广益，拿出一个行之有效的整肃方案来！”
尹昌衡的话一停，副都督张培爵就接着说道：“培爵完全赞同尹都督整肃地方的提议。我们川省，这动乱已经大半年了，现在是百业凋敝，百废待兴，所以当务之急是尽早开始乱后的重建。要重建，就必须实现政令的顺利实施，但现在大部府、州、县，不遵从军政府的号令，这必然阻碍重建大计，所以，培爵提议，以武力完成地方整肃！我们现在有五个师的陆军，除留下部分人马镇守锦城和渝州外，其余就向各府、州、县开进，接管各府、州、县的政权，遣散各种地方武装，凡是拒绝遣散的地方武装，就以匪论，军队应将其就地剿灭！”
参议院议长罗纶就问道：“张副都督，按你的意思，这地方整肃，就是在全川实行军管啰？”
张培爵道：“罗议长，先贤有云，治乱以重典！眼下川省就是个大乱局，要结束它，就必须武力整肃，必须实行军管！”
罗纶道：“就全川眼下这个乱局来说，罗某也不是反对武力整肃！各府、州、县不听政府号令，就是因为他们手里有武装，解决这些武装是应该的。但是，张副都督，完全实行军管，罗某觉得，这就有些不妥！”
“有啥子不妥？”
“近而言之，我们的军官大多不晓民政，他们能带兵，能打仗，但料理民事，料理税赋，他们绝对就是外行，叫他们做这些，就只能是越理越乱！远而言之，这军管就会成为武人干政之始，久必成祸！张副都督，想必你也通晓国史，武人乱政，史不绝书啊！”
张培爵道：“罗议长，你说的没错！培爵也是读书人，也晓得要以史为鉴，但眼下，这军政府本身也是军人执政，就是对全省实行军管，在地方实行军管又有何不可呢？”
张、罗二人如此争论，尹昌衡就有些着急，但他有言在先，要这些官员直抒己见，也就不好直接干预。他只好盼望这场争论早点结束，不要耽误了正事。
罗纶正要接话，民政厅长已说话了。他说：“罗议长，这料理民政，跟我这民政厅关系最大，我也希望全是懂民事、会料理税赋的人去管理地方，但眼下肯定不可能！再说，眼下各省成立的都是军政府，都是以军管民，鄙人以为这是大势所趋。这新政权刚成立，以军管民，这是必然选择，必须有这么一个过渡。鄙人想，等中央政府完全控制了大局，肯定就会制定各种章程，就会照章办事，那么，这个过渡时期的管理形式就会结束，军政府会撤销，军管也就结束了，武人干政是断不会发生的，其实，历朝历代也都是这么做的！所以鄙人赞成武力整肃，对地方实行军管！”
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民政厅长的话一停，军团长胡景伊就说道：“武力定乱，文治兴邦，这是古今不易之理！景伊是军人，但也晓得这个道理。景伊以为，眼下要用军人定乱，就应该给军人相应的权力，他们才能便宜行事；等整肃做得差不多了，地方也就平静了，到那个时候，再派通晓民事、税赋的人去做地方官，也就能施行文治，以文治兴邦了！再说，这实行军管，也只是让军人暂时兼任地方官，一旦时机成熟，省府一道命令就解除了他们的兼职，要真有想做地方官的军人，他又确实能胜任，那就解除他的军职，他手里没了军队，也就不可能武人干政了嘛！所以武力整肃，暂行军管，是眼下最好的选择！”
胡景伊的话实际上帮尹昌衡定了调，尹昌衡就清了清嗓子，说道：“各位说的都有道理！昌衡以为，以史为鉴，确实应该避免武人乱政！但文治兴邦必须是在武力定乱之后。就说昌衡吧，也是个军人，现忝任都督，执一省之政，对诸多政务，实是外行，实难胜任，但国事初兴，凡事都有个从经从权，须得变通，不能胶柱鼓瑟嘛。待国事大定，可以行文治兴邦了，昌衡必辞此职，安心做一军人，一心带兵，以维持地方安定！但眼下，昌衡就不能辞职，就还要继续执这一省之政，因为定乱是当务之急，这正是我辈军人的使命！所以，现在，昌衡即以军政府都督之职，决定即日起，武力整肃地方，全川实行军管！”
都督做出了决定，各厅厅长们就纷纷表态了。
财政厅长道：“鄙人全力支持都督决定！现在全川百废待兴，处处需要银子，但我这财政厅实际上是个空架子，因为各府、州、县应缴的钱粮赋税都缴不上来，根本问题就出在政令不能通达，不能施行！一旦完成地方整肃，这些问题就解决了，这财政厅就能发挥作用，就能统筹管理全川的钱粮赋税，这用钱的事情也就好办了！”
盐政厅长也附和道：“鄙人也全力支持都督的决定！川南是我川省的财富重地，就是因为川南出盐，那盐业厘金，一直是川省重要的财源。若不尽快整肃地方，盐业厘金就白白地流走了，就用不到全川的重建上，实在是太可惜了！”
理财的都认识到了整肃地方的重要，那些用钱的当然就更认为整肃地方十分重要了，因为他们现在做什么事，都得去找理财的要钱，不然就没法做，但眼下却很难要到钱，因为理财的手里确实是没有钱。所以他们也接着表态，全力支持武力整肃地方。
做了决策，接着就商讨具体措施了。
尹昌衡道：“武力整肃，就得动用现有的这五个师，可这五个师现在还集中在锦城、渝州这两个地方，各位说说，这兵力咋个调动才好？”
张培爵道：“都督，如果集中兵力，一个府一个府地整肃，全川这么多个府，怕耗时就太长了呀！”
尹昌衡就问道：“张副都督，你有啥子好办法？”
张培爵道：“这川省，东到巫山，西至康边，北邻陕甘，南接滇黔，有两百来县，眼下肯定顾及不到康边，也顾及不了茂州以西羌藏杂处之地，不过，就这样也还有十一府七州三厅，所以培爵以为，应该把它们划成五个防区，一个师一个防区，每个师负责自己防区的整肃，这样就可能要快得多！”
尹昌衡还没说话，军政厅长就说道：“张副都督这个办法好！防区划定后，军政府就命令各师就开进自己的防区，限期完成防区的整肃，具体咋做，就由各师自己去想，自己去搞方案，军政府就可以不问方法，不问过程，只看结果了！能在期限内完成，而且做得好的，军政府就奖，反之则惩！”
军政厅长的话音一落，尹昌衡就赞道：“对，这是个好办法！”
张培爵就问道：“那这防区咋个划法呢？”
军政厅长道：“都督，副都督，还有各位厅长，在下以为，现在不管康边，把川省先划成五个防区，以重、忠、酉、夔四府、州、厅为川东防区，以顺、绥、保、太四府、州、厅为川东北防区，以资、泸、两叙四府、州、厅为川南防区，以嘉、宁二府为川西南防区，以成、绵、龙、茂四府、州为川西防区。”
参谋厅长道：“这茂州在大山那边，眼下怕也顾不上吧？”
军政厅长道：“那就以成、绵、龙三府、州为川西防区。”
胡景伊就说道：“分五个防区可以，但有的防区过大，这完成起来就费事了，是不是在调整一下，让各防区下边的县份在数量上差不多，后边考核也就可以合理了。”
民政厅长道：“这不把以前的府、州辖区都搞乱了吗？”
张培爵道：“搞乱了就搞乱了，现在是民国的天下了，为啥还要用清朝的规制呢？”
民政厅长道：“中央政府刚成立，啥子规制都没出台，用用原先的规制，管理起来要方便点嘛！”
