七月，毓英自负昔日威名，大意欺敌。一见芝龙船仅数只，即挥军冲击。芝豹率二船接敌，未几合即退。龙鼓全〈舟宗〉齐进，互相攻打，来往冲突。奈风稍逆，龙亦退下。英见其连败，乘势追赶。芝虎得芝鹏报，尾其后顺风而来，大叫：『勿赶！有吾在此』。龙见虎船已到，即挥诸船转战。英闻后有贼船，遂同先春御之。芝鹗等见龙师退至港口，亦合出齐冲，毓英船〈舟宗〉遂散。芝虎、芝豹环击英船，英身中五箭，负疼死战。豹将搭钩搭住，芝虎一跃过船，连砍数人。豹亦乘势跳过，大喝落舱者不杀，毓英遂被芝虎所获。龙见二弟俱跳过毓英船，随合拢前来，鸣金收军。龙忙过船，喝虎曰：『休得无礼』！改容向英揖曰：『舍弟卤莽，误犯威颜，冀将军宽宥』。英曰：『败将惟有死而已，将军何必加礼』？芝龙曰：『将军朝廷命官，龙安敢不敬礼？非龙敢拒将军，实不得已耳』！英曰：『曾闻将军业已招安，而又逸出。今将军不杀毓英，意欲何为』？龙曰：『某之受招安者，实感蔡道宪前日之恩，故不论轻重，谕到即归。但道宪书獃，奖励无别，不过分散安插而已。因此大众失望，不得不逸去』。英曰：『以将军之才貌，应为干城重寄，岂肯碌碌无闻，难怪将军其然』。龙曰：『苟一爵相加，应为朝廷效力，东南半壁，即可高枕矣』。英曰：『英不才，无力保奏，当为将军荐扬』。龙致谢，带芝虎等过船，令众船鸣金鼓送卢将军回师。英当被获之际，自知必死；不料芝龙加礼相待，心实感激。次日，船进厦门，见都督俞咨皋（大猷之子），陈说战败情由以及芝龙始末衷曲。咨皋曰：『老将军所言虽是；但我们武将只管征剿，至招安非所职掌。况将军被获发回，愈难言矣』。英闻「被获放回」之语，羞愧无地；曰：『末将老而无能，故此被获。但彼惓惓申意，又不得不为之言，正古人所谓知而不讳也』。咨皋曰：『将军奉令征剿，今既如此，亦算失机。本都督未便擅议，应自赴省听候军门处分可也』。英作谢而起曰：『谨遵谕』；退去。咨皋即飞移军门，毓英亦起身。
途次泉州时，蔡道宪已内转，仅留太守王猷（字允〔原作胤〕方，粤之东莞人，丙辰进士），毓英谒叙。猷问胜负，英备述始末，称『芝龙将才，因前受抚无职，空为安插，恐势官欺凌，故此逸去。倘当事假以一命，决可再招。弟细思若招此人，年少英勇，尽可用也』。猷点首曰：『将军所言，甚得权宜抚恤用人之要法』。英遂赴省。但朱之凭已接俞咨皋报文，内有云『卢游击舟师战败，被获放回，辱身辱国，莫此为甚』之语。
八月，之凭正欲修文覆咨皋；而皋已亲至三山（福州别号），会见之凭。凭责皋：『须会师刻期扑灭，岂可延纵贻害地方』？咨皋即飞檄千户马胜、百户杨世爵，统船二十，前去剿捕。胜与世爵出泊镇海卫，爵谓胜曰：『芝龙在旧镇。我们二十只分为两队，明早我乘潮起，直入海内捣其穴，彼必然情急死战。俟潮退，诱其出港，公督十只合击，彼必星散，一战可以成功』。胜曰：『此议甚妙』！遂与世爵分船，各叮照应。芝燕、芝鸾适在东椗，了望镇海有许多战舰，即着两个能干军士作渔父，坐小艇带鲜鱼数筋混入〈舟宗〉内，以卖鱼为由，侦探消息。尚隔里许，各相唤争买。二人望尾楼上插五方旗者，拢卖之，故意叫苦：『海面不宁，难作生活。今幸大师进剿，我们就有性命；但不知老爷是谁』？军士曰：『我这船是马老爷、那船是杨老爷，极出名、会打仗』。始末皆说。二人听毕，收了鱼钱，飞驾从连江还旧镇回报。芝龙方知是马胜、杨世爵奉令前来。芝虎闻说，大怒曰：『亦不必烦哥哥动身，弟自领船十只，擒此二贼』。龙曰：『马、杨二人是千户、百户中之最骁勇者，吾弟未可轻视』！虎曰：『哥哥何长别人志气？若不生擒此贼，誓不为人』。龙曰：『吾弟既欲前去，须着芝豹同行。凡事要相机而动，不可徒恃血气之勇』。虎应诺，即领船十只，同豹乘潮落出港。天明，到将军澳前，摇旗擂鼓而进。马、杨二人遇之，笑曰：『狂奴来寻死』。发令迎敌。自巳至未，火烟蔽空，往来冲击，不分胜负。龙见虎悻然而去，虞其有失，自带船六只前往观敌。马、杨二人正在酣战之际，忽见虎后添船，未知几多，遂尔怯战。被芝虎冲过，持火罐掷去，火遂发。世爵同军士救无及，俱赴水。马胜见世爵船中起火，转舵欲救。芝豹尾后赶击。虎又迎敌与战，发斗头炮将胜船打穿，延着火药桶发火。马胜情急，抱铜炮沈于海底。虎、豹挥船攻击，龙又合击，连沈船三只，余舰星奔。龙方鸣金收军，仍回旧镇。马、杨所统之船烧沈五只、败坏六只；其余伤残者，回报失机情由。
九月，俞咨皋知杨、马二将阵没，即咨副总兵陈希范刻日进剿。侦卒探报芝龙，龙曰：『希范酒徒耳，一鼓破之』。遂整船出，相遇于杏仔。芝虎首冲其〈舟宗〉，豹继之，人莫敢御，范坐潮遁。芝莞、芝豹等合攻，杨六、杨七船不敢前（杨六、杨七系受招之盗，后复叛去，被龙所斩，有刻杨略、杨速者误也）。百户洪应斗四面受敌，势窘发火自焚；百户张选举抱〈舟宗〉铳赴水死焉。俞咨皋接报，飞调闽安、兴化、永宁、铜山、陆鹅、悬钟、镇海、金门众指挥千百户诸船齐到，听令出师。龙侦知，集诸弟会议。芝蚊劝龙且避粤东。龙曰：『咨皋膏粱纨裤，徒读父书，虚有其名。何必远避』？芝虎曰：『弟愿为先锋』。龙许之，整船以待。俞咨皋调军已齐，以指挥张挺桂、千户林盛二人领船各五只为先锋，指挥杨国柱、李应龙、千户吴虎、傅圭各领船五只为合后。咨皋自坐大－船，竖一帅旗，为中军提调。又令指挥黄胜、胡如海、黄庭、李廷圭、千户周之士、何世雄、林勳、姚应科、百户王飞熊，李梦斗等各坐船一只，为中护卫冲锋。以游击商世禄领船五只，为监督接应。调拨已定，择日祭江出师。
芝龙在旧镇，日则差芝虎、芝燕等轮流驾大船十只、快哨二只，于陆鹅将军澳了望。如有敌情，即便飞报。忽厦门细作探俞都督于六月初八日出师。龙即谕诸弟曰：『明日此敌，惟王飞熊、林盛、李梦斗三人深识水务，兼有胆略，当先除去！其余碌碌群鸡，不足介意』。令芝虎为副将、芝彪驾船十只为先锋。又着芝豹、芝凤、芝豸、芝獬、芝鹄、芝鸾、芝鹗八将，各坐一船，乘夜潮驾出青水墘，然后回头，约明日午时从东椗杀来。又令芝莞、芝麒、芝燕、芝蟒四将，领船各四只，作左右救护。自领芝熊、芝鸾共船六只，居中策应。是夜三鼓，龙统众出泊陆鹅。天明，咨皋大队至，列阵飘扬，炮声振天，烟焰如云。芝虎恃勇，率诸众冲〈舟宗〉，与林盛、李梦斗等互相攻击。自辰至午，虽各损伤，却未分胜负。芝龙见不能取胜，又望芝豹之船未见影响，无奈亲督〈舟宗〉船一齐冲入。忽孙雄船被芝熊尾送一炮打沈。咨皋见雄船失，亦催船齐笼围攻。将及酉时，芝豹大〈舟宗〉已过东碇，闻炮声不绝，顺风潮赶来。咨皋见后面又有贼船将至，急传令与商世禄带领船只分御。世禄奉令，方指挥转舵欲去迎敌，别船诸将不知是要分军，误为退师，各转舵，一时全〈舟宗〉哄动大乱。咨皋制按不住，被芝虎、芝熊、芝莞、芝燕四将乘虚奋击。王贵、林盛二船发火。芝豹、芝蛟等又从后杀来。皋首尾受敌，兼之潮起风逆，各星散而遁，咨皋亦退。芝龙挥军急追，又连击坏船三只。至浯屿天昏，方鸣金收军。
崇祯元年六月九日，俞咨皋遁入厦门，船不得连〈舟宗〉，而军失纪律。快哨又报芝龙大队咸屯岛美、浯屿，急传指挥傅圭领船十五只，前去南山边青崎一带湾泊，防其突入。厦门百姓，惊慌逃窜。咨皋亦不登岸，即停船水仙宫前。芝龙至五更水涨，吹角进师，圭整船迎敌。芝虎擂鼓首冲，圭船稍怯。龙乘势趱其大队齐攻，圭大败。皋急催师进接，已无及矣，悉回舵星奔。龙追至海门收军（海澄旧水口），号令不许登岸抢掠，即退出厦门港宿夜。天明，仍将舟师收回旧镇。咨皋走至三叉河停泊，申报欲再大会师合剿。工科给事中颜继祖疏参俞咨皋有曰：『郑芝龙生长泉州，凡我内地之虚实，了然于胸。加以岁月所招徕，金钱所诱饵，聚艇数百，聚徒数万。城社之鼠狐，甘为爪牙；郡县之胥役，尽属腹心。乡绅偶有条陈，事未行而机先泄；官府才一告示，甲造谤而乙讹言。复以小惠济其大奸，礼贤而下士、劫富而施贫，来者不拒而去者不追。故官不忧盗而忧民，民不畏官而畏贼，贼不任怨而任德。一人作贼，一家自喜无恙；一姓从贼，一方可保无虞。族属亲故击楫相访，虚往皆得实归，恍若向现任官抽丰。偶或上岸买货讨水，则闾阎市里牵羊载酒、承筐束帛，惟恐后也。真耳目未经之奇变，古今旷见之元凶也。谁酝酿以有今日？则大将军俞咨皋无所逃罪矣。咨皋七尺魁梧，自是将种；奔驰水陆，效有微劳。只因与吴淳夫为儿女婿（淳夫晋江人，庚戌进士，为工部尚书），线索相通，狼狈相依，遂至藐简书如弁髦，视桑梓如秦越。丙寅招抚之议，实倾贼囊以充私橐，敢于孟浪主张。尔时按臣周昌晋及藩、臬诸臣，多讶其非策。而旧抚朱钦相怜地方疲困，不乐观兵，姑听其言，收杨六、杨七以为用。岂知抚寇者，必未抚之先，晓以利害、示以兵威，使彼摇尾而乞怜；又必既抚之后，散以原籍、领以保约，使之乐业而安生。而咨皋招之海，仍置之海。首从无分别，商民任劫掠；故今日授抚之职，即明日作贼之人。且也杀人可以不死，家享巨室良田之福，而身被黄盖腰金之贵，人皆有所利而为贼，何所惩而不为贼乎？去年春间，羽书络绎，咨皋抱头三山，趦趄观望。及标船标兵陆续先发，咨皋始出。副将陈希范嗜酒有癖，占风无智。泊舟铜陵之内港，流连杯酌。哨探报警，屈被鞭笞。贼已迫而缆未解，无怪九十余之战舰、千余人之壮丁，尽投烈焰而葬鱼腹也。最可痛者，把总洪应斗、张选举奋不顾身，手刃贼级数十颗。贼以火攻，应斗、选举以火攻贼，贼锋稍挫。奈希范之扬帆远遁，杨六、杨七之袖手旁观，应斗自知不免，发火而自焚死。选举势穷，抱铜铳自沈于海底，有心人咸为流涕。希范既以身免，犹诬应斗以未知着落。天日在上，将谁欺乎？此恤典宜急，以慰忠魂。至抚臣朱之凭严檄杨六、杨七而杳然无踪，咨皋始缩舌无辞。抚臣劾希范并及咨皋，人皆谓二将必伏斧钺之诛。而财神有灵，冰山是倚，白简已入长安，希范尚扬扬自得，仪从鼓吹，放铳开门。咨皋则掩耳偷生，听强寇蹂躏内地，游戏于同安、海澄、石码之间；以至贼突入镇门，离漳郡仅咫尺。非县令曹履泰、刘斯泝卧薪尝胆，保障于外，巡道朱大典发令指挥，弹压于内，斗大孤城，几乎断送；而漳亦岌岌不保矣。闽事尚忍言哉！粤艘不通，岁荒米贵，小民枵腹，莫必其命。而咨皋反委官驾船买谷，名为给食于兵，而实则齎粮于盗，漳民争欲脔其肉而寝其皮。淳夫虽一手障天，曲庇咨皋；而先帝明旨于抚臣疏中，直以攻堡烧船伤兵损将，诘其招抚之效安在，并究其酿祸之责，安所逃罪矣。后复于按臣疏中专责咨皋，以策后效，偿前失矣。荏苒居诸，于今八月，不闻咨皋有尺寸之树立，岂谓贼稍离汛地，遂可骄语驱除之功乎？贼避北风，非慑咨皋。闽粤辅车唇齿之势，粤危则闽不得独安，贼若再顺风为阵，臣必料咨皋之束手无措。此在咨皋之罢斥宜早、希范之逮问难宽也』。疏上，下廷臣会议。俞咨皋即解任，陈希范听处分（后二人咸问斩）。于是芝龙纵横沿海，当事者莫敢问焉。
