天启六年丙寅二月，龙集众会议曰：『今诸务颇已就绪，岂可坐老其师？我欲领战船十只、快哨三只，配坐前往金、厦，一以观边境，二可取粮饷。不知诸君意下如何』？衷纪曰：『主君此举甚是。夫人惰则力倦、勤则思奋，刘先主之所以泣髀肉生也』。芝龙即令杲卿、衷纪调拨船只，并选精壮匀配。杲卿二人前去派定，开单送阅：第一号先锋，芝虎、芝燕；第二号先锋，芝鹗、芝豸；第三号援剿，芝彪、张泓；第四号援剿，芝獬、李明；第五号冲锋，芝蛟、芝鹄；第六号中军主帅参谋，天生、杲卿；左右亲军，芝豹、芝熊；第七号护卫，芝莞、陈衷纪；第八号游哨，芝麟、陈勳；第九号监督，芝麒、吴化龙。每船各配六十人。第十号哨探艄仔二只，芝凤、芝鸾；各配二十五人。悉给发口粮一月。择三月初三日出师。其余林翌、杨经、李英、高贯、方胜、傅春等，领诸军看守寨栅。芝龙看毕，曰：『调拨得宜，但不知先往何处』？衷纪曰：『今南风已发，吕宋船以及暹罗、咬〈口留〉吧之各港皆回。可从澎湖下，缓缓坐风，半逆半顺，挨至甘吉等候』（甘吉海石名，在铜山对面）。芝龙依其议，至初三日连〈舟宗〉出港。行二昼夜，初五早，龙又令人上桅观望。望者回报曰：『看前面的山，不是南太武，敢是北太武』（南太武系漳镇海卫，在厦门之下，北太武系泉州同安地，在厦门之上）？芝龙曰：『夜来南风，驶上为是』。遂传令各船火炮军器勿得参差。
初十日，犯金门。十八日，犯厦门。四月杪下犯粤东之靖海、甲子地方。
时太平日久，人不知兵。卫所虽有指挥、千百户、水澎金门游击、钦依把总诸官，悉承荫袭，宽衣大袖，坐享君禄。其所辖军士，亦应操点卯而已。故芝龙得肆志，遇船一鼓而擒；登岸抢掠殆尽。其略有纪律者，不许掳妇女、屠人民、纵火焚烧、榨艾稻谷。比乘风横行，羽檄飞报，沿海戒严，当事者咄咄一筹莫展。惟查郑芝龙系泉州府库吏郑绍祖之子，六岁时曾受知府蔡善继掷石不责之恩。即起善继泉州巡海道，招安芝龙。善继抵任，又奉巡抚朱钦相檄，差旗鼓黄昌奇（系泉州府礼房，有口才，与绍祖共事；迨继为海道，委为辕门旗鼓事）委之齎谕，出海招安。时郑芝龙统船随风驰逐，适逢雨水不顺，失于收成，富者遏粜，米价腾贵，游手好闲，悉往投之。芝龙将夺来船只，分配驾驶，因而日盛。边将望风披靡，不敢与敌。偶燀洗诸船于湄洲，忽报海道差官到，芝龙延之上船。昌奇曰：『数载违别，果然一表魁梧，真将军也』！龙曰：『流落海外，久离乡井，凡诸亲友，有失候问！今日何幸逐波涛而屈临至此』？执手至官厅，叙礼献茶毕，昌奇曰：『老拙与令先尊共事时，将军才有六、七岁，顽耍丢石，掷着太守乌纱帽。本府自赞将军非凡，将军尚能记忆否』？芝龙曰：『儿童时事，影响略知』。昌奇曰：『现任海道，即当日将军所掷之太守也』。龙曰：『呵，海道就是当日太府』！昌奇曰：『然。知将军扬名海外，恐为沉迷，专遣老拙前来相劝，有谕在此』。芝龙拆其谕曰：『自你髫龄时，仪表可爱。岂料壮年，海滨寄迹，使闻之恻然，谅情非得已耳！今特遣旗鼓黄昌奇前来宣谕及你部属人等，幸勿久恋迷津，须当速登彼岸。本道当为力请，卖刀买犊，永作圣世良民。从此安插，复业归农；坐享太平，和好室家。言出于衷，幸其听之！此谕』。芝龙观毕曰：『海上弄兵，原非本意。因寄迹东洋（日本在东，故称东洋），受困倭人，迫而成之。今既承道宪严命，岂敢固执，以负德意？自与诸将领商之』。芝龙心感善继之德，遂传集众头领曰：『我想飘颻海外，虚度岁月，总无了局。今道宪招安，意欲就抚，不知诸位心曲何如』？衷纪曰：『主公就抚，道宪决然垂青。我等并无夙昔之交，虽今日藉主公余庇：倘后来道宪陞转，官势罗织，有司不谅，那时进退维谷。乞假我船只，仍回台湾。同李英等观看主公得意，纪等再来相寻未迟。不知主公允否』？龙曰：『衷纪兄所言亦是一着，岂有不听之理』？杲卿、天生、子大、陈勳等一十三人，齐向前请命，欲与衷纪同去。龙即拨大小船六只，粮饷薪蔬、布帛器械俱各满足，分支过台。
芝龙统船十二只，计八百余众，同昌奇入泉州港。诣辕门，去衣帽，龙与芝虎、芝豹等二十人背捆，泥首阶下。蔡善继令释其缚，慰抚之曰：『你原是有家子，生在公门，况又容貌堂堂；虽你父已死，汝应立志，以图上进，光耀门闾。何忽作乱阶，飘流海外，而暴弃至此？倘非本道，岂能瓦全？今既翻然而悟，贵于自新。本道应为汝详请上宪，通行府县安插得所』。芝龙曰：『此实迫于倭番，不得已也，非芝龙敢萌此不肖之心』。善继曰：『谁能无过，第患知而不改。今你能改，自是完人，将来功名未可量也』。龙等叩首称谢出，守候军门安插回文（东旭曰：昔日高牙剑戟尊，今朝低首叩辕门。一书非是能饶舌，欲报当年掷石恩）。
岂料巡抚朱钦相染病甚重，一切事务悉暂搁起。月余方愈，检阅文书，见郑芝龙已招安，立批该道即为安插，并将船只军器追存，造册报缴。善继见批，即着昌奇将郑芝龙所带人众，开造籍贯住址，以候发文行县安插。一应军器船只另造册，以便缴报。龙许诺，造完即缴昌奇去。芝虎说龙曰：『虎不可失威，人不可失势。今当事举动，不过欲散我们党羽耳。党羽散，将来祸福未定，不如乘今夜潮退，扬帆而去』。龙闻言俛首不答。芝豹曰：『三哥所言诚是；不可错过，追悔莫及』！龙曰：『难负道宪一片好意』。芝虎曰：『不提道宪还可，若提道宪早该去了』。龙曰：『何说』？虎曰：『道宪书獃，如此安插我们，以为恩莫大矣。安望其有格外乎？况汝又未授有官职，倘后来有事，衙门深远，那时呼应不灵，将奈何』？龙顿悟曰：『若非吾弟提醒，几乎为其所误』。遂嘱芝虎等，密传收拾。于是夜三更，于船上放炮三声，随潮而去（东旭曰：因无薄禄难羁絷，顿使英雄脱笼飞）。芝龙即将船只人众等驶到围头外湾泊。善继闻报，知龙仍逸去，愤曰：『这辈小人，反覆不测，真难凭信！既不受德化，则当以法处之』。随发文行各卫、所、府、县整备，以防劫掠；另具文申请军门。时朱钦相内擢起程，新抚朱之凭尚未莅任，剿抚之议，因此耽延。郑芝龙得以从容将各船燀洗，整顿帆席索路军器旗帜。八月，乘北风，下粤之海丰，攻打嵌头村。又犯甲子、靖海二所。
天启七年丁卯正月，芝龙从粤回闽铜山。沿海戒严，全队泊漳浦之旧镇。朱之凭檄骁将都司洪先春，会把总许心素、陈文廉等合剿（之凭字勉斋，进士，大兴人）。芝龙侦知，令芝豹领船五只敌先春，芝虎领船三只敌文廉，芝彪领船三只敌心素。龙与芝凤等率大队从中接应。又着芝鹏各领快哨三只，作游兵救援。遂进师，相遇于连江将军澳（漳浦县属）。先春挥船合进，互相攻击。自辰至酉，冲突数十次，未分胜负，会潮泛涨，风起流逆，心素、文廉二船被流所脱，不能成〈舟宗〉。先春首尾受敌，无奈，收入旧镇。檄铜山、悬钟、陆鹅、镇海指挥、千户、把总，调拨精壮军士前来配驾；另调附近沿海乡勇各出备捕。芝龙以先春收入旧镇，亦不追赶，就鸣金收军，泊陆鹅外屿。忽细作报：洪先春调各卫所军士配船并乡勇齐御，不日即出兵。龙亦整船拣将，欲决雌雄。芝豹向前献计曰：『洪先春奉巡抚差遣，便于调拨，何不将计就计破他』？龙曰：『计将安在』？豹曰：『乘彼在旧镇调拨军士、乡勇，我带一旅，分为两队登岸，扮作乡勇，前去策应，哥哥即统大队攻击。俟将交锋时，我在岸上两师杀起，彼则水陆受敌，一鼓可擒』。龙曰：『此计甚妙。可乘今夜人静，悄悄带众登岸，须要小心，不可露出圭角』！豹曰：『自然相机而行。哥哥亦速整舟师来』。豹将海丰抢的乡壮旗帜竖起，挑选二百人，乘黄昏带芝麟上岸。
时洪先春调来铜山、悬钟二所军，即配在船；其附近乡勇，令其按队屯劄候齐。日则放炮升旗，夜则定更伏路，提调周密。芝豹于是夜领师登岸，天明至盐墩，造饭食毕，缓缓而行。至黄昏到旧镇，见调乡勇先至者，咸安顿无混。分其半与芝麟，曰：『汝往洲尾屯劄，我在此安营。若问你是何乡来的，汝可应是「浮南桥」；若再问你镇海卫军可来否，汝可应他「随后亦来了」；若问汝姓名，说是「杨德」；若问汝同来者是何乡，汝说是「湖西黄默」。倘外面有信，彼船出港，当看我这里连珠火箭起，便一齐喊杀，寻岸边船只，毋论大小，抢并合攻。须谨慎在意，不可孟浪误事』！芝麟依令往洲尾，凡所过问者，悉照前答之。
二月，先春见船只收拾完备，诸军陆续将齐，惟镇海途远未到。正调拨分配间，忽了望炮响，快哨飞报贼船至。先春即发令：『各起碇乘潮落冲出』！再至港口，即遇芝虎。虎站尾楼上高叫：『洪先春！今日誓必擒汝』。春见虎船只，语言狂妄，随趱各船围攻，曰：『先擒此贼，以挫其锐』。指挥间，听见岸上炮声不绝，响杀连天。快哨飞报，有贼从岸上杀来。先春疑惑未定，而芝龙大队至。春无奈，向前督战。芝豹、芝麟杀散乡勇，抢拼鱼船、艋仔，摇旗擂鼓，从旧镇港出，随先春船后，合攻杀来。春首尾受敌，坐潮而遁。诸船无帅，咸星散焉。芝龙大胜，会同豹、麟，亦不追赶，鸣金收军。令芝虎领船五只湾白石头，以作犄角（白石头在旧镇之南）。又令芝豹领船五只泊港口，以备先春复来。自领全队舟师，随潮至旧镇，犒赏诸军。另着芝莞登岸，安抚附近乡民，禁饬骚扰。先春走到甘吉，回望芝龙不追，其神方定。见南风微起，即令驶上金门，投卢游击，再整船剿捕（游击卢毓英，字宁侯，原籍山东卫，荫袭百户。少年猛勇，箭有穿杨之能，兼精武艺。因日本倭番统船犯闽、浙沿海地方，总制胡宗宪题山东参将戚继光前来征剿。继光素知毓英猛勇，详请随军。由浙入闽，屡建奇功，升千户。迨兴化陷，继光奉令恢复，即着指挥使马飞龙统船，毓英副之，从福州港出，水陆合剿。光由陆路至埔尾安营，选百人带「临时硬」欲去偷城。「临时硬」者，系竹打通锯断，每节共串以绳索，头上另缚一横梁。未用时，放松则软；欲用时，将索推紧则硬，如一枝竹然。将头上横梁挂住城垛，人可攀援而上。光带此，令大队掩旗息鼓，随后而进，看火箭为号，便倚梯攻打。行十余步，光将手按百人胸前，内脉浮跳者，即发回。如此数按，至兴化府城下，只有自己与大旗李明二人。侧听谯鼓三更二点，遂将「临时硬」挂住城垛，口含刀爬上。伏候巡更来，擒刺之，取其衣帽穿戴。敲锣击柝，缓步挨巡，凡遇者悉砍死。抵府署前，鼓方交四，倭番酣饮，咸熟睡焉。二人偷登鼓楼，将打更者杀倒。令李明下去附近处放起连珠火箭，将所带火药点烧房屋喊杀。自把楼上大鼓刳孔，爬进在内。李明火号放起，火药亦发。倭番睡梦惊醒，不知兵从天降，朦胧中互相砍杀，不攻自乱。城外大队见城内火箭连发，光焰烛天，掌号放炮，喊杀蜂起，云梯齐泊。倭番两难相顾，惟争开四门逃窜。继光复得城池，扑救余火，安抚百姓，立即整军追捕。倭番奔下夹板，乘潮而遁。将出口，又逢马飞龙督舟师至。夹板炮声轰天，哨角蜂斗。飞龙挥诸船，且避其锋。毓英向前高叫曰：『养军千日，用在一朝。调我们前来，原是合剿，岂有陆师杀来，水师反纵其走。他如今是伤弓之鸟，速当进兵，以火攻之，再无不胜。好汉者跟我前进』！其船首冲。飞龙闻英言，遂不敢退。亦即发令鼓噪助威，一齐攻击。毓英将火箭喷筒火烺尽放。倭番虽精炮火鸟枪，其奈山上日夜被追，下船又逢此劲敌，终有胆战心惊，炮发悉不准，故各船无不失措。兼之毓英坐上风，乘势所攻，火器咸粘船上。况倭番船系「打傌油」造的，粘著者火尽发，火借油力，风助火威，首先二只火起，倭人救之不息，各跳水死。其余夹板望见，无心恋战，惟逃而已。此役毓英首功，擢指挥，转升游击，大有声名。召守金门）。
五月，巡抚朱之凭接洪先春初败请兵，立飞檄令卢游击带船与洪先春合征。毓英正在遣员知会，忽洪游击奔投，哭诉致败情由。英曰：『量此游魂小丑，无难平也。长兄宽怀』！随整顿本辖舟师，同先春进剿。侦者报芝龙，龙集诸弟曰：『卢游击虽称宿将，素未逢劲敌；况今老矣，无能为也』。谓芝虎曰：『汝带双帆〈舟宗〉船五只，扮作商船，陆续寄泊岛美、浯屿』。芝鹏！汝带小鱼船三只，前往东椗一带钓鱼哨抹（东椗，海中石名，在镇海卫前）。若卢游击船出，即飞报芝虎，以便合攻』。分拨去后，龙带战船八只，出泊陆鹅候敌。其余船只，令芝鹗、芝燕等尽藏散处，看我退师，出冲击，则彼可擒。
