其药仍用小柴胡汤者，盖血室之气肝主之，肝与胆为表里，胆因肝受邪而病如疟，非他药所宜，故亦主和其半表里，谓上焦气和，而骤结之血将自行。全书以阐发精当、深刻、平正而著称，是《金匮要略》诸注释本中的一部注本较早而价值很高的著作。
该书流传广泛，版本有十三种以上，清·康熙十年版为初刊本，乾隆、嘉庆、光绪年间曾多次翻印，解放前后都曾点校出版，国内各大图书馆均有收藏。
4.程林与《金匮要略直解》 程林，字云来，号静观居士，清朝新安人，精通《素问》、《灵枢》，多以经方济世，著《金匮要略直解》三卷，成书于清康熙十二年（1673）。
其书言简意赅，通俗易懂，多以《内经》、《难经》理论阐发金匮要义，结合各家精华经验加以注释，议论精辟，比喻恰当，简单生动，融会了前人学术思想，并参以个人心得，注释直截简要，分析清晰，义理详明，对方药的临床应用也多有发挥，方证对应，病证结合，能切合要领，取得精妙，有独特见解和发挥，如论述胃虚寒饮的恶阻证治，认为：寒在胃脘，则令呕吐不止，故用干姜散寒，半夏、生姜止呕，人参和胃。半夏、干姜能下胎。娄全善云：余治娠阻病，累用半夏，未尝动胎，亦有故无殒之义，临病之工，何必拘泥。又如释小柴胡汤治疗黄疸腹满腹痛条文，认为应属于内有实邪，当以大柴胡汤下之，用小柴胡汤，止呕吐可行，消腹满腹痛不够。此证仲景未言明使用何种柴胡汤，有的注家认为用小柴胡汤，而程氏则据理分析，认为应该使用大柴胡汤。由此可见其对原文和临床的结合认识，能切中要领，拓展思路。该书实为《金匮要略》注本中的善本之一。
5.沈明宗与《金匮要略编注》 沈明宗，字目南，清康熙时期浙江桐乡人，受当时研究仲景学说的影响，亦潜心于《伤寒》、《金匮要略》之学，善谈错简，著《金匮要略编注》二十四卷，成书于康熙三十一年（1692）。作者认为，金匮编次失序，非仲景原意，遂遵照“著书立说，必先纲领，次及条目”的观点，将《金匮要略》条文重新整理编次，使之既合实际，又有理致。他认为：世传的《金匮要略》刊本编次失序，与张仲景原著有所出入，有失仲景原义，须遵照“从来著书立言，必先纲领，次及题目”的观点，将《金匮要略》原文重新整理编次，使之既合实际，又趋于条理。本书在编排上与其他注家不同，认为《金匮要略》首章原概伤寒杂病通部之序列，其第一卷乃通部诊察疾病和辨证论治的纲领，故立望闻问切、表里阴阳、寒热虚实、标本缓急、汗吐下和温等法，悉数阐明，不遗毫末。而王叔和画蛇添足，更作序例，频举汗下诸条，应该一并删除。惟以仲景原来的论述，合梓是书，可补《内经》之不足。故每于注论之后，引用《内经》解说，使二者合而为一，以证实轩岐与仲景本是一源而出，俾后学一览无疑。全书将序例列于首，次以天时、地理、脉证、汤法，鱼尾相贯于后，以利于读者登堂入室，探究旨趣。由此足见作者匠心独具，是颇有特色的一个注家。同时，沈氏于条文中也加以详细通达的注释，深得仲景精义，对学习和研究《金匮要略》有较大的参考价值。
6.魏荔彤与《金匮要略方论本义》 魏荔彤，字念庭，康熙雍正时期直棣柏乡人，著《金匮要略方论本义》三卷，成书于清康熙五十九年（1720）。作者对《内经》、《难经》和《伤寒》都较为熟悉，能融会贯通。该书序言中谓“余自垂髫，喜玩轩岐之书，既乃知读仲景所著，往往以仲景所言释轩岐不明者，而以轩岐所言释仲景方浔明”，并认为医学理论与《易经》的理论多有相似或相同，书中多处引用《易经》作为解释，盛赞“仲景之书真与《易经》无二义也”，注释《金匮要略》，议论风生，叙理清晰，尤其对病机和治法，层层细辨，发挥颇多。如论述妇人血瘀腹痛的治法，认为：
妇人腹中经尽之时及产子之后，卒皆空虚，风入无所捍卫，此风及腹中之由也。风邪入腹，扰气乱血，腹中必刺痛。主之以红蓝花酒，酒以温和其血，红蓝花以行散其瘀，而痛可止”。又如论述妊娠血虚热郁的小便不利证治，认为“妊娠小便难，饮食如故者，血虚生热，津液伤而气化斯不利也。主之以当归贝母苦参丸，当归生血，贝母清气化之源，苦参降血热之火，又为虚热之妊娠家立一法也。魏氏在方药的阐发上受王晋三的影响，注释亦甚精详，既明确阐述方药所治疗病证的作用机制，又注重引用各家对方药的解说和应用，使之更为全面周详，这是一般金匮注家所少见的，故本书也是金匮较好的注本之一。
7.尤怡与《金匮要略心典》 尤怡，字在泾，号饲鹤山人，清康熙雍正间长洲（吴县）人，对《伤寒》、《金匮要略》颇有研究，且医术精湛，临证多验，著《金匮要略心典》三卷，共二十二篇，成书于清雍正七年（1729）。作者以注释精练、文笔流畅、颇得《金匮要略》要领而著称。尤氏治学严谨，一丝不苟，凡原书中简奥难通之处，宁缺而不强释；凡属传写之误，悉予订正，以突出辨证。同时，结合临床应用扩大思路，如对蛔虫病证治的阐述：吐涎，吐出清水也。心痛，痛如咬啮，时时上下是也。
发作有时者，蛔饱而静，则痛立止；蛔饥求食，则痛复发也。毒药，即锡粉、雷丸等杀虫之药。毒药者，折之以其所恶也。甘草粉蜜汤者，诱之以其所喜也。白粉即铅白粉，能杀三虫，而杂于甘草、白蜜之中，诱使虫食，甘味既尽，毒性旋发，而虫患乃除，此医药之变诈也。”又如论述血虚湿热胎动不安的治法，认为“妊娠之后，最虑湿热伤动胎气，故于芎、归、芍药养血之中，用白术除湿，黄芩除热。丹溪称黄芩、白术为安胎之圣药。夫芩、术非能安胎者，去其湿热而胎自安耳。徐大椿赞许《心典》说：
“条理通达，指归明显。辞不必烦，而意已尽；语不必深，而旨已传。”是书自问世以后，流行颇广，影响很大，后世医者多尊该书为学习仲景《金匮要略》的门径和指南。
此外，尤氏还著有《金匮翼》，全书讨论内科杂病辨治方药，补充了《心典》之不足，也很切合实用。
8.吴谦与《医宗金鉴·订正仲景全书·金匮要略注》 吴谦，字六吉，清雍正乾隆间安徽歙县人，曾任清太医院判，对《伤寒》、《金匮要略》等有深入研究，乾隆四年奉敕主编《医宗金鉴》，为总修官。《金匮要略注》八卷是《医宗金鉴》的一部分，刊于乾隆七年（1742）。吴谦认为，旧本《金匮要略》中多有伪错，其注家常“随文附会，难以凭信”，遂参照赵以德《衍义》、徐彬《论注》等十余家善本，亲自进行删订整理。
书中对《金匮要略》原条文详加注释，如论述冲任虚寒兼有瘀血所致的崩漏证治，认为：妇人年已五十，冲任皆虚，天癸当竭，地道不通矣。今下血数十日不止，宿瘀下也；五心烦热，阴血虚也。唇口干燥，任冲血伤不上荣也；少腹急满，胞中有寒，瘀不行也。此皆曾经半产崩中，新血难生，瘀血未尽，风寒客于胞中，为带下，为崩中，为经水愆期，为胞寒不孕。均用温经汤主之者，以此方生新去瘀，暖子宫补冲任也”再如论述产后气血郁滞成实的腹痛证治，认为“产妇腹痛，属气结血凝者，枳实芍药散以调之。假令服后不愈，此为热灼血干，著于脐下而痛，非枳实芍药之所能治也。
宜下瘀血，主之下瘀血汤，攻热下瘀血也。并主经水不通，亦因热灼血干故也”。又如论述咽中痰凝气滞的证治，认为：“咽中如有炙脔，谓咽中有痰涎，如同炙肉，咯之不出，咽之不下者，即今之梅核气也。此病得于七情郁气凝涎而生，故用半夏、厚朴、生姜，辛以散结，苦以降逆，茯苓佐半夏以利饮行涎，紫苏芳香以宣通郁气。俾气舒涎去，病自愈。此证男子亦有，不独妇人也。并集各家之说分列于注释之后，便于学者掌握。
9.黄元御与《金匮悬解》 黄元御在撰成《伤寒悬解》之后，又进行了《金匮悬解》的编著工作，约成书于1754年，因此二书的思路非常相似。他将《金匮要略》的篇目、条文也重新进行调整编排，并进行一些删减，如删去“杂疗方第二十三”等三篇。他认为《金匮要略》治内伤杂病，以扶助阳气、运化气血、温煦脏腑功能为大旨。
但又兼采后世滋阴之说，推阐“阳自阴开，阴由阳降”之理，言之颇见透彻。书中逐篇诠释原文，并详述四诊九候之法。在他的《金匮悬解》中，将《金匮要略》条文分成外感、内伤、外科、妇人四大部分，各部分又按原类病法分类，每类各为一卷，卷前加以短论对该卷内容进行提纲挈领的阐述。
10.陈念祖与《金匮要略浅注》 陈念祖，字修园，为清乾隆时期福建长乐人，著《金匮要略浅注》十卷，刊于清嘉庆八年（1803）。作者采诸前贤如赵以德、徐彬、喻昌、尤怡等注本之精华，并结合个人心得进行编纂，文章深得《金匮要略》要旨，文词简明，浅显易懂。如论述阳明病热入血室的证治，认为：此言阳明病亦有热入血室者，不必拘于经水之来与断也。但其证下血、头汗出之独异也。盖阳明之热，从气而之血，袭入胞宫，即下血而谵语，不必乘经水之来而后热邪得以入之。彼为血去而热乘其虚而后入，此为热入而血有所迫而自下也。然既入血室，则不以阳明为主，而以冲任、厥阴之血海为主。冲任，奇脉之，又以厥阴为主。厥阴之气不通，故一身无汗，郁而求通，遂于其少阳之腑而达之，故头上汗出。治法亦当刺期门，以泻其实，刺已，周身然汗出，则阴之闭者亦通，故愈。在行文中还用小字浅释贯于其间，深入浅出，一气呵成，便于初学者诵读。
11.丹波父子与《金匮玉函要略辑义》、《金匮玉函要略述义》 丹波元简，日本江户时期人，尤重经学和考据学的研究，著《金匮玉函要略辑义》六卷，刊于日本宽政甲寅年（1807），相当于清嘉庆年间。该书将先贤经文列于前，个人见解评语按于后，其经文采撷精当周到，个人按语分析简要透彻，深得仲景奥义。作者对方剂的辑义诠解亦有很多发明。该书还参考宋本、徐镕本、俞桥本、赵开美本等对《金匮要略》原文进行了考订校勘。《金匮玉函要略述义》为元简次子丹波元坚所作，刊于日本天保王寅年（1842），相当于清道光年间。自《辑义》问世后，丹波元坚又看到《金匮玉函经二注》及朱光被的《金匮要略正义》等书籍，于是结合自己学习《金匮要略》的心得体会，选择性地对《金匮要略》方证进行注释，并对《辑义》中一些遗漏、欠妥的《金匮要略》条文重新进行考订、校核，以补充《辑义》之不足。
12.唐宗海与《金匮要略浅注补正》 唐宗海，字容川，晚清咸丰光绪年间四川彭县人，早年即钻研医书，是汇通中西医学的代表人物之一，著《金匮要略浅注补正》九卷，刊于清光绪二十二年（1896）。作者推崇陈念祖《金匮要略浅注》，但又认为陈氏《浅注》对脏腑气化病机之学仍守旧说，且原书条文词义的注释亦有不当之处，因此，作者在陈氏《浅注》的基础上，试图用中西汇通的观点加以注释补正，取得新的成绩。如论述热入血室的证候和治禁，认为：旧注解“必自愈”以为不须治之，其邪必将自解，夫谵语重证岂易自解？况此明有“治之”二字，何得以为不须治之？
