7月1日，登陆行动刚开始不久，麦克阿瑟即命令马上派一艘汽艇来送他上岸。但负责作战的海军将领认为当时滩头正处于敌人的炮火之下，因此未按预定时间派汽艇来。麦克阿瑟让手下人告诉这位将军：“立刻派汽艇来！”5分钟后，汽艇果然来了。上岸后，他在一个离日军阵地不到200码的高地上驻足，与战地指挥官一起查看地图。这时，日军一挺机枪向他们射来，溅起一片尘土。其他人都卧倒在地，惟有麦克阿瑟仍站在那里若无其事、一动不动地还在看地图。末了，他把地图交还给那位军官，并指着附近的另一个高地说：“我们去那里看看。”
当他们从高地上下来时，那挺机枪又扫射过来，打落了他们身旁树上的树叶。麦克阿瑟转身对那位指挥官说：“顺便提一下，我想最好派几个人干掉那挺机枪，免得它伤了什么人。”过后，美国的一家报纸以《卧倒，将军，卧倒！》为题，强烈呼吁麦克阿瑟“下次再发生这样的情况，听到卧倒的命令后，可别再站着不动了”，以免带来毫无意义的牺牲。该文还讽刺说：“您真以为危险是那么甜滋滋的，她的脸蛋是那么白皙，使您沉迷不能自拔吗？常识断定应该卧倒，您就要卧倒。您不必使您的士兵信服您是一位勇士。您不必使我们这些纳税人和战争债券的购买者信服。”
7月5日，麦克阿瑟返回马尼拉。在前一天，他已宣布菲律宾战役正式结束。实际上，克鲁格在吕宋的清剿作战还远未结束，他只消灭了10万余日军，还有6万多躲在吕宋北部山区，他们直到战争结束才投降。但这股几近弹尽粮绝、疲惫不堪的残敌，此时已构不成什么威胁。在菲律宾战役（包括莱特、吕宋和南部诸岛作战）中，日军共被击毙40余万人，而美军则只伤亡6．2万人（其中亡1．4万）。与日军的损失相比，美军的伤亡是微不足道的：每阵亡1人，就有30名日军被打死。
在婆罗洲战役接近尾声时，麦克阿瑟还拟订了爪哇登陆计划，以夺取荷属东印度群岛，恢复荷兰人的殖民统治。但参谋长联席会议考虑到进攻爪哇在战略上没有什么意义，且盟军要全力用来准备对日本本土发动进攻，故未批准该计划。对此，麦克阿瑟认为这是一个严重错误，是政治在干涉军事。
为彻底摧毁日本的战争潜力和日军的抵抗意志，创造进攻日本本土的有利条件，美军从3月份开始还加强了对日本的空中轰炸和海上封锁。3月9日夜，美军第20航空队在柯蒂斯·李梅将军指挥下，从关岛出动334架B-29轰炸机对东京实施第一次低空大规模“火攻”，共投燃烧弹1667吨。东京顿时成为一片火海，1／4以上的市区被烧毁，8万多人被炸死或烧死，100万人无家可归。以后10天，李梅又出动轰炸机1595架次，对东京、大阪、名古屋和神户投燃烧弹9373吨，被称之为“火攻闪击战”。这种要命的“火攻”，其规模越来越大，并扩大到其他城市。到7月份，肯尼的飞机和哈尔西的舰载机也加入到这一轰炸行列。肯尼说，他几乎每天都以冲绳为基地出动600架以上的飞机对日本进行袭击。哈尔西自7月1日率第3舰队自莱特湾再次出海后，三次袭击东京、两次袭击北海道、三次袭击獭户内海。大轰炸使日本98座城市遭到不同程度的毁坏，轻者被毁一半，重者全部成为废墟；大轰炸给日本平民带来深重的灾难，数十万人被炸死，上千万人流离失所；大轰炸几乎使日本工业陷于瘫痪状态，飞机、电力和炼油工业分别下降65％、70％和80％，其他军工生产下降30％以上；大轰炸给日本的海、空军也带来极大的破坏，大量机场被摧毁，日本海军残部被基本消灭。这些连续不断而肆无忌惮的轰炸，几乎未引来任何报复性行动。日军大本营已把飞机（其中大部分是“神风队”特攻机）隐蔽起来，一心准备在本土与美军决战。
与此同时，美军从3月份起开始对日本本土实施大规模海上封锁，以切断其海上运输线，使日本列岛成为孤岛。美军除组织潜艇、航空兵和水面舰只袭击日本商船，实施破坏交通线作战外，还重点对日本本土实施了代号为“饥饿战役”的布雷封锁。布雷兵力主要由第20航空队的B-29轰炸机担任，由战术航空兵和潜艇协同。从3月27日起到战争结束的4个半月时间里，第20航空队共出动飞机1500余架次，向下关海峡、獭户内海以及各大海港投布水雷1．2万余枚，毁伤日本船只670艘，总吨位近140万吨，使日本本土与其西南诸岛、中国和朝鲜之间的海上交通基本被切断。结果，在轰炸和封锁的共同打击下，日本经济陷于崩溃，许多工厂关闭，物资补给中断，军需生产停顿，油料枯竭，飞机和舰船停航；全国陷于混乱、恐慌和饥饿之中。
天皇发布投降诏书
面临绝境，日本统治集团一面企图垂死挣扎，准备本土决战，一面进行和平试探，寻求体面投降。从3月份开始，日本即试图通过瑞士和瑞典某些中间人向美国进行这种和平试探，但由于其内部主战派和主和派之间严重对抗，使执政者举棋不定，毫无结果。4月上旬，铃木贯太郎上台，起用主和派东乡茂德任外相，向盟国摆出和平姿态。德国投降后，日本统治者不得不正视败局已定的现实，开始真正考虑和平问题。在5月12日举行的最高战争指导会议上，海军大臣米内光政提议由苏联出面调停，以保留帝国国体为条件，与盟国达成不丢面子的和平。这项建议受到铃木首相的认同，但却遭到东乡外相的反对。东乡认为，苏联人不会帮助日本，它的要价会很高，要使它不参战都难办到。按他的意见，最好还是与美国直接进行停火谈判。最后，会议还是决定求助于苏联，并请前首相广田弘毅出面与苏联大使接触。广田在与苏联驻日大使马立克接触时，并未直接挑明来意，而只是希望苏联继续保持中立。马立克对广田的建议态度冷淡，不置可否。
