第二天大早，九江城外秩序较为混乱，三个匪徒趁骚乱冲进大码头的协顺土店，抢了几千铜圆和银元后夺路狂奔，被闻讯追赶的革命军抓获并就地正法。此时，人们才发现，九江城随处可见湖北军政府都督黎元洪的文告，并竖起三面起义大旗，城内警察纷纷响应，都在左臂缠上白布。数千年的帝王专制体制在九江灭亡。
九江独立后，革命军将九江道署改为军政分府，众人推马毓宝为中华民国驻浔军政分府都督。两天后，李烈钧赶到九江，被公举为参谋部长。
此时，清朝政府还没放弃抵抗，受清廷之命的海军提督萨镇冰令海军司令黄钟瑛领3艘巡洋舰、2艘鱼雷艇、8艘炮舰增援武汉清兵。但他听到九江独立，担心燃料和粮草不济，慌忙驶向上海，不料经过九江时，被金鸡坡炮台的大炮一阵狂轰。无奈之下，黄钟瑛命部下打旗语表示合作。马毓宝、李烈钧知道舰上官兵多是福建人，便下令停炮，并派出也是福建人的参谋龚少甫上舰游说，各舰听后表示愿意加入革命军。
在商会摆设的欢迎宴上，黄钟瑛突然放下酒杯拍案而起，令同来的军官立刻回舰准备作战。原来是马毓宝趁海军军官赴宴，偷偷派金鸡坡炮台司令登舰拆了舰上的炮闩。李烈钧见气氛紧张，暗示龚少甫出面打圆场。就在海军怒气稍平时，炮台司令又盛气而来，李烈钧忙笑脸介绍双方，复入座。第二天，李烈钧派人将炮闩送回，海军也送来舰上的几十挺机关枪和步枪，事件平息。就这样，清廷的全部海军在九江参加革命，李烈钧成了海陆军总司令。
四、九江光复 万众欢腾
1911年10月23日（农历九月初二），同盟会会员林森、蒋群、吴照轩、张鲁玮等联络军、学各界，剪掉了第五十三标标统马毓宝的辫子，逼其下令全标起义，响应武昌，宣告九江独立。马毓宝为了活命，接受了革命党人的要求，命令第五十三标起义，并规定了三条纪律，即“不扰害租界教堂”“不扰害人民”“不加害非敌对满人”等。接着，起义军很快就攻下道府两署，道台保恒、知府璞良闻声匿迹，不知去向。
从当晚9点至12点，起义新军相继攻占了道、署两衙，24日上午8时，起义军进攻坐镇九江的清提法使行辕，其卫队40人归顺新军，城内外的警兵同时响应新军起义。至此，九江道台保恒和九江知府璞良闻声携家眷逃走，其他零散清军，见大势已去，不敢抵抗，都先后加入起义队伍，这样九江起义就兵不血刃取得了胜利。清军在九江的江防、陆防、警界武装相继瓦解，九江城乡全部光复。革命军公举马毓宝为都督。25日，马标统移居道署，称中华民国驻浔军政分府，分军务、政务二部。军务部由马自己负责，政务部公推罗大佺负责。当时军政府官员共80余人。起义清军宣布脱离清政府，并照同盟会会章，升起青天白日旗。不久，九江军政府成立，公推马毓宝为九江都督，蒋群为帮办兼参谋长，林森为民政长。林森因“须主持同盟会方面的工作，没有就事”。不久李烈钧到九江，蒋群慨让参谋长一职给他。据1911年11月18日日本筱本警士向日本驻汉口总领事报告的《九江事情》记载，当时军政府主要成员是：
驻浔军政分府都督：马毓宝
参谋处参谋总长：李烈钧
政事参谋官：蒋群、吴照轩
军事参谋官：潘世远、刘世钧、范增福、何文斌、唐作模、祚祯
宪兵部总部：廖柏琅
执法部部长：张宗林
运送部部长：张荣屿
筹粮局局长：顾英
军机局局长：柳国璋
联队统带：第一联队大队长：范增福（兼）
第二联队大队长：何文斌（兼）
第三联队大队长：李定魁
第四联队大队长：黄焕章
炮台统领：戈克安
水师统领：杨全标
财政局长：陈中瑞
外交官：黎成英、吴铁城、王成、黎宗岳
交涉课一等副官：卓仁机
江西各炮台水陆全军统制：徐世法
九江军政分府成立后，“即于招商局（今港口公寓处）码头竖立中华民国大旗，军学各界以及城中商店均悬挂白旗及欢迎民国之小红旗”。同时，布告民众，通电全国。革命党人将“浔军都督‘马’”的布告遍贴城区内外。布告曰：“大汉光复，万姓欢腾。义旗所指，首在安民。胡虏入关，各处屠城。我军宽大，不乱杀人，倘敢抵抗，有死无生。凡我同胞，戮力同心。解放束缚，再见光明。三呼万岁，革命功成。”
当时武汉的军事很失利，使九江方面也受到了不良的影响。马都督和他部下，有许多人似有悔惧的心理。隔了六七天，李烈钧从安徽太湖来九江。他是云南派来参观秋操的，武汉事起，秋操停止，他才到九江来。蒋群就介绍他见马都督，并且把参谋长让给他。驻浔军政府人员一致认为，南昌是江西的省会，安庆是安徽的省会，都有策动反正的必要，这样才可保九江的安全。否则九江孤悬江表，腹背受敌，恐难持久，所以决定出兵南昌和安庆的计划，由李烈钧和蒋群分别负责办理。后来湖北蒋作宾自武汉来九江，报告那边军情，危在旦夕，希望出师援鄂。那时候李烈钧要赴皖，参谋长一职，就请蒋担任了。所以这一时期，刚刚独立的九江军政府就面临着援皖、援赣、援鄂和统一江西内部等许多事件，在李烈钧、蒋作宾和蒋群三个人共同决策下，逐渐一一付之实行。
九江独立后，可谓是内忧外患。武汉国民军正在失败中，江西内地和扬子江下游都没有发动，九江实力有限，情势很危险，所以对于江防，他们不能不特加重视，上自都督，下到士兵，无不废寝忘食，严为戒备。扼大江中流、居江湖要冲的湖口马当炮台，都派重兵据守，对于截留北军水路接济，和捕捉敌探，发挥着重大作用。本来武汉北军的水路接济，必须经过九江，要制北军死命，必须隔断他们的接济，所以军政府规定每天自下午6时到次晨6时，无论何种船只，不准行驶，偷运的就完全截留。两个月中，所获北军的煤、米、枪、炮、弹药等不少。有一个粮台委员徐某，由下游运来军米一千五百多担，就被全部截获。还有假借外国旗子送军火的船只，因为驻九江的外国领事答应严守中立，也可以搜查扣留，没有阻碍。
至于北军谋探，他们也捕获多人。其中最重要的，就是马献廷。马是江西的候补道，他在九江独立前，任督修九江营房委员，贪污受贿。光复后，他却假意投诚，到军政府来见马都督。马都督信以为真，委为办理税务。那一天，马献廷正在等候任命书，凑巧李烈钧和蒋群进去，察破他的隐情，驱之不走，李烈钧拔出指挥刀砍去，马受了重伤，蒋群就命卫兵交给军法庭去审问。哪知他罪恶贯盈，当时便在他身上搜出预备给北军的密信，信里写道：“九江民军都是乌合之众，只需少数援军来攻，就可成功”等语。再派人到他寓所搜查，果然搜出名册、枪弹、旗号等，并且已经招了许多人在等候着时机起事，所以当天晚上就把马献廷枪毙了。
五、首义之地 功不可没
首先，九江作为江西的首义之地，推倒了革命在江西的第一张多米诺骨牌，接着，在赣鄱大地上，独立、光复的势头风起云涌。10月25日，九江起义的捷报在南昌传开。《江西民报》大造革命舆论。清朝的江西参议官张季煜、陆军协统吴介璋等已有与民军联合之动机。江西巡抚冯汝骙战守无策，而地方巡警亦已罢岗。市民中亦有人在预制白旗，准备欢迎民军。1911年11月1日，南昌光复；11月3日，萍乡光复；11月4日，鄱阳、瑞州、临江、抚州、上饶等先后光复；11月17日，赣南宁都督分府召开成立大会；11月23日，宜黄、分宜相继光复。总之，九江光复后，省内各地及外省邻近地区尚未独立，因而都以九江为榜样。据《江西通志稿》第三册记载：“九江于九月初二、南昌于初十先后响应独立，全省各属靡然成风，不及一月，全省底定。”
辛亥九江起义在全国范围内仅晚湖南、陕西一天响应武昌起义，在关键时刻解除了长江下游清军对武汉的威胁，直接推动了本省及长江流域革命形势的迅速发展，加速了清王朝的崩溃。
其次，九江光复的重要功绩，还在于直接支援了鄂皖革命斗争。九江独立后，李烈钧由上海到达九江，就任都督府总参谋长，并处决内奸马献廷，撤换金鸡坡炮台司令徐世法，改派戈克安继任。不久，李被举为陆海军总司令，改编两舰队，以黄钟瑛、汤芗铭分别为第一、第二舰队司令。安徽胡万泰来九江，请李出兵援皖，李即派团长黄焕章率兵两营，援助安庆起义。同时，李烈钧任参谋长后，立即下令严密控制金鸡坡炮台，封锁长江，拦截上行船只，断绝了汉口清军的水路供应。这样，有力地支援了武昌革命军，使清政府大为震恐。
对于江西九江的光复，武汉军政府也是非常的重视。独立后一个月（11月23日），湖北黎元洪电马毓宝说：“浔江重镇，有我公在，可免他虑，尤为欣慰。”并在同一天决定“筹拨银六万元，官票六万张，明日由许君瑞解来。余款及枪械当竭力设法代办。”第二天再次电马毓宝言：“此次我公被举，不独皖省之幸，鄂中从此无东顾之忧矣。”1912年1月22日，黎元洪为请暂借电话材料以济军用致九江马毓宝电：“现鄂军北伐，第二军已占领黄陂、祁家湾一带，但电话不敷听用，故一切报告诸多阻碍。请贵处暂借多数电话材料，饬工程队运送阳逻，以济第二军之用，是所切祷。”
辛亥革命武昌起义成功后，清政府急派陆军大臣荫昌、海军提督萨镇冰各统陆、海军进攻武汉，大有一举扑灭革命火焰之势。九江光复前，清海军十几艘舰船已陆续开到武汉江面。10月26日，清海军各舰炮击汉口造纸厂革命军阵地，击死500余名革命军官兵，致革命军阵地失守，使革命军颇受威胁。九江光复后，军政分府总参谋长李烈钧亲自指挥金鸡坡炮台封锁江面，使一些驶抵九江的舰船“被创而退，震动了全国，壮大了革命军的声威”，“是九江军政府立下的头一次大功”。更为重要的是，当时清廷为镇压武昌起义，调集海军第二舰队（计有巡洋舰3艘、炮舰12艘、驱逐舰1艘），由海军总司令官吴应科、海军司令部长黄钟瑛亲自率领，威胁武昌。其中有12艘因米煤盐缺乏，自汉口退至九江，陈中瑞（即陈蔼亭）与林森、吴铁城等登舰劝其合作，并负责筹发薪饷，慷慨陈词，诸舰将卒均被感动，遂加入新军。这样，清廷第二舰队海军全部在九江起义参加革命。11月19日，九江军政分府派遣的战舰及步兵两队抵达武汉下游青山前线，攻击三道桥的清军。击死敌兵约600余人，致清军受创甚巨。11月21日九江军步兵第四营又受命支援武昌，22日在青山一带攻击清军。27日九江援军约3000人抵达武昌参战，解除了武昌之危。当时，九江可谓是武汉地区的水上前哨，也可以说是武汉之屏障。
九江光复，开往上游大部分军舰相率归顺，迄镇江独立，则全部悬挂义旗。海军全属起义军，海军的威胁自然完全排除，清军在武汉又不能制胜。袁世凯无力以图江南，也是其停战议和的重要因素。可见，九江的光复对辛亥首义之地——武昌的贡献是巨大的。
