在KOF2003中，迷之组织一员“无界”，成功松动了大蛇的封印，乘着混乱，（阿修。克里门森）ASHCRIMSON偷走了[八咫之镜]。并掌握了八咫之镜的技能“芽月”。KOF大会的主办者神乐千鹤负伤，一切在混乱中落下帷幕。
季节更替，时光流逝，今年的KOF大会又宣布开始了。
拳皇xi开赛，矢吹真吾受神乐千鹤所托，再次将八神跟草薙撮合成一支队伍。
前来寻找阿修的伊丽莎白布兰克托什跟红丸和已离开阿修的堕陇组成队伍参赛。
阿修再度找来了神武，两人一起到爱尔兰去找奥斯华参战KOF。艾修以钱和奥斯华正寻找的龙药作诱饵，成功招揽奥斯华入队。
大会完结后艾修被奥斯华追讨报酬，艾修挑拨离间队友：“你(奥斯华)正急著得到的龙药正是上海药局的秘药‘龙丸‘。如果能够打倒上海药局正通缉的神武就有可能收到药局的‘龙丸‘作报酬“，成功甩开奥斯华和神武。
而京庵队，却与遥彼的紫苑碰面了，几人打了起来。紫苑很是强大，京和庵不得不一起出手对付他，而矢吹真吾则在一旁加油（晕，果然很没用），最后京和庵共同使出鬼烧，赤紫两道火焰齐出，将紫苑击败了。
紫苑败退后，真正的大BOSS祸忌出场，被打败的紫苑被祸忌拖入了异空间中，然后祸忌决战三神器。原来，这和前年一样，他们都是和无界一伙的——遥彼一族。祸忌的实力比紫苑更强，京和庵再次联手对付祸忌。
与此同时，阿修也成功的挑拨了神武和奥斯华德，趁机与队友分开，独自来寻找京庵队。
京庵队与变身的祸忌进行了艰苦的战斗，然而随着大蛇的气息出现，八神被影响无法出手。草薙京用最后的力量使出了神尘，同时祸忌也使出了虫忌。眼看草薙京就要败了，矢吹真吾不顾一切拖住了祸忌的双脚，以致祸忌无法出招。草薙京的神尘轰在祸忌身上，最终，祸忌败了。
被三神器打败的祸忌企图逃入异空间中，谁知道却从中伸出了紫苑的长枪，祸忌被穿胸惨死。
大蛇封印的松动导致了大蛇气息的流出，八神的大蛇之血被再次唤醒，并陷入了暴走，瞬间干倒了草薙京和那个一直莫名其妙不知所谓打酱油的矢吹真吾，这时候，坏小子ASH又出现了，趁着八神暴走意识不明，并且在重伤的情况下打倒了八神，自然，八神的神器—八尺琼勾玉就落入了ASH的手里，同时ASH也得到了控制八神的紫色火焰的能力。
正当他要取走草薙剑时，竞争对手队来了。伊莉莎白痛斥阿修背叛了使命，而红丸则要为京报仇。虽然被伊莉莎白一行人阻截，但阿修还是利用八咫之镜的力量成功逃走，更说出他的下一个目标就是草剃京的草剃之剑。
KOFXII，是没有剧情的大乱斗，这场KOF比赛彻底的让新人们骂娘了。
“我草，这拳皇世界也太变态了，一年比一年变态，现在八神和京都快打酱油了，这武力值提升的也太快了吧，完全跟不上呀！”
“好了，别骂娘了，能坚持到现在已经不错了，不过，他妈比的连时间空间能力都出来了，这尼玛还是拳皇吗？完全是超能力的世界呀！”
“好了，赶紧去练功吧，我好不容易在KOF大会上拿到了八神受伤时留在地上的血液，并在音巢融合了，结果到现在还是沦为了打酱油的角色，真不甘心呀！”
“估计我们也快要失败了吧……”
“……”
