我们在研究中，主要研究了下列问题：
（1）对专业技术企业孵化器基本理论及其进展进行了研究。
（2）采用比较分析等方法，结合国外专业技术企业孵化器的运行情况，全面分析了我国专业技术企业孵化器运行的现状、取得的成就、存在的问题，以及影响专业技术企业孵化器有效运行的因素。
（3）系统地研究了专业技术企业孵化器运行的环境问题。专业技术企业孵化器的运行环境包括外部环境和内部条件两大部分。
（4）对专业技术企业孵化器运行模式进行了理论研究，指出专业技术企业孵化器运行的模式有多种，主要是非营利性专业技术企业孵化器运行模式和营利性专业技术企业孵化器运行模式；认为我国现有的事业单位企业化运行的专业技术企业孵化器的发展方向是非营利性专业技术企业孵化器和公司制（营利性）专业技术企业孵化器；我国现有的专业技术企业孵化器采用是封闭式、实体式的运行模式，发展思路存在着严重的问题，而应该采用开放式、虚拟式的专业技术企业孵化器运行模式。
（5）对专业技术企业孵化器的运行过程进行了研究，包括专业技术企业孵化器的市场研究与开发、在孵企业的选择、在孵企业的培育和孵化、外部资源的获取、企业孵化器内部企业集聚与合作、在孵企业的评价等。
（6）对专业技术企业孵化器的运行管理问题进行了研究。专业技术企业孵化器的运行需要一定的组织机构和管理团队。专业技术企业孵化器的管理团队经历了三个阶段的动态发展，即管理团队的初步形成阶段、专业化服务与管理阶段、网络化服务与管理阶段。
（7）在分析传统的新创企业绩效模型的基础上，建立了在孵企业成长绩效决定要素模型并重点研究了基于接触、沟通与交流的在孵企业绩效概念模型。
（8）通过调查问卷及其分析，对提出的理论假设和建立的概念模型进行实证检验。在假设验证中，我们提出的8个假设除假设6外的7个都获得了实证支持。
