流行性腮腺炎在中医被称为“痄腮”、“虾蟆瘟”、“颅鹚瘟”、“搭腮肿”、“温毒”、“佛面肿”、“含腮疮”等，俗称“寸耳核”。是由风温邪毒（腮腺炎病毒），邪毒壅阻少阳经脉，与气血相搏，凝滞耳下腮部而引起的急性呼吸道传染病。中医药对本病有很好的治疗效果，包括内治法和外治法。总体来说，内治法采取辨证的原则，将流行性腮腺炎分为“常证”和“变证”两种情况来对待，“常证”整体治疗的原则是内服以“清热解毒、凉血消肿”为法，外治以“消肿止痛”为度。如出现“变证”，当采取中西医结合的手段积极治疗，阻断危重症的发展。
常证瘟毒在表（表重热轻型）的初起表现与感冒相似，症见轻微发热恶寒，发热不高，多在37.5～38.5℃之间，1～2天后一侧或两侧腮部漫肿疼痛，咀嚼不便，或有咽红，舌红苔白或薄黄，治以疏风清热，消肿散结，采用柴胡葛根汤或银翘散加减治疗，常用中药如银花、连翘、柴胡、葛根、牛蒡子、马勃、桔梗、夏枯草、升麻等。常证热毒蕴结（表轻热重型）的表现为壮热，烦渴或伴头痛、呕吐，腮部漫肿，胀痛，坚硬拒按，咀嚼困难，舌红苔黄。治疗当以清热解毒，消肿散结为法，采用普济消毒饮、黄连解毒汤、温胆汤加减治疗，常用中药如黄芩、黄连、连翘、板蓝根、升麻、马勃、玄参、柴胡、僵蚕、甘草等。当患儿发热较高时，可配合牛黄清热散同时应用。中成药可选用连翘败毒丸、小败毒膏、五福化毒丸等。当发热已退，腮肿逐渐开始消退时，中成药可选用腮腺炎片、散结灵。常证只要患儿素体良好，医护得当，则预后良好。若患儿素体较差，医护不当，或感染邪毒较重，则患儿可能出现一些并发症，中医称为变证，此时病情多较危重，此时在西医对症治疗的基础上，中医分为邪陷心肝和毒窜睾腹两型论治。邪陷心肝主要表现为，在腮部尚未肿大或腮肿后5～7天，突然壮热、头痛项强，嗜睡，严重者抽搐、昏迷，舌红绛，脉洪数。治疗当以清热解毒，息风开窍为法，采用凉营清气汤、羚角钩藤汤、安官牛黄丸等加减，常用中药如黄连、黄芩、黄柏、栀子、羚羊角、钩藤、川贝母、生地、白芍、甘草、菖蒲、郁金等，另加服紫雪丹、至宝丹以清热镇惊，息风开窍。毒窜睾腹主要表现为，痄腮1周左右发生，男性，睾丸一侧或两侧（以一侧多见）肿胀疼痛；女性多有一侧或两侧少腹疼痛，或有脘腹疼痛，伴有发热、呕吐等症，舌红、脉数。治以清肝泻火，行气活血止痛，采用龙胆泻肝汤、大柴胡汤、柴胡疏肝散、逍遥散等、玉枢丹等加玄胡、小茴香、金铃子等治疗。常用中药如龙胆草、黄芩、栀子、柴胡、黄连、当归、川楝子、郁金、延胡索、荔枝核、大黄、枳实、赤芍、半夏等。
此外，中医外治法在痄腮治疗中具有重要作用，临床主要采用的是中药外敷的方法。最常用的药物是青黛散和如意金黄散。外用时，取青黛15克，或中成药如意金黄散15克，用醋调药面或以水调药面成糊状，外敷在腮部，每日换1次。此外也可用紫金锭，采用同样方法，调敷腮部。在农村可用新鲜仙人掌一块，削去外皮及刺，将仙人掌一劈两片，将内侧贴在腮部，或去皮刺后，洗净捣碎为泥，外敷腮部，一日更换2～3次，疗效也相当好。若无仙人掌，也可用蓝靛外敷。还有人用鲜地龙捣烂，拌上红糖外敷。用鲜公英、鲜马齿苋、鲜芙蓉花叶共捣烂如泥，外敷腮部，每天1次，连敷3～5天。也可用黄柏粉6克，青黛粉4克调匀，加入食醋调成糊状外敷腮部肿痛处，只要皮肤不敏感，可连敷8～10小时。休息3～4小时换药再敷。或用天花粉、绿豆各等份，研为细末，用冷开水加蜂蜜少许调成糊状，外敷患处，每日3～4次。也可用白绛丹膏、季得胜蛇药外敷。家长还需注意的是，在采用中药外敷时，一定要将药物很好地固定在患腮处。因为小儿调皮易动，可能会不自觉地用手去抓扯患腮处包扎物，致使药物脱落，不能起到疗效。
