周佛海在白公馆一再要求司法审判，政治解决的幻梦彻底破灭了。
1946年7月中旬，毛人凤跑来说：“好吧，收拾一下，到南京去司法解决。”
周佛海很高兴，自以为替蒋介石、戴笠做过不少事，法律上至少也可将功抵过。但不知为何，又拖了很久，直至9月16日，军统才将周佛海、丁默邨等用飞机送到南京。
周佛海等先被关在南京宁海路军统看守所，生活上依旧优待，饭菜都是酒楼送来的。
9月23日，周被移押到老虎桥法院看守所。这是一座小洋房，内有花园，放风时还可散步。周佛海被关在“忠”字监，和丁默邨、罗君强同住。但伙食已是犯人的规格了，周佛海终于正式过监狱生活。
周佛海在重庆时，就写好了很长的自白书，内容全是表功，说明自己做了许多有利于抗战的事，功比天高，足可抵过。
9月21日，南京高等法院检察官已到军统看守所提审过一次，周佛海即交了自白书，一口咬定自己在1942年早已向军统自首，有戴笠的信件可以作证。
移押法院看守所后，9月24日、25日、26日接连提审。审讯员告诉周佛海：“罪行严重，抛弃幻想。”
这样一来，周佛海和丁默邨等就有些惴惴不安。大汉奸缪斌也替蒋介石做过不少事，但在5月间第一个被枪毙了！接着，陈公博、褚民谊等接连被处决，他们对蒋介石也是多少有功的。丁默邨虽是特工魔头，但胆小如鼠，天天向周佛海唠叨：“老头子恐要一锅端，死定了！”周佛海也坐立不安，但自忖还有蒋的亲笔信这张王牌。但大汉奸缪斌也是有的呀，他为什么会被枪毙？周佛海茫然了，无以自答。国民党司法界的内幕十分复杂。负责周佛海案件的高等法院推事金世鼎和检察官陈绳祖，几经密商，计划要判周佛海死刑。
当然，这是得到最高当局暗示的。蒋介石侍从室传来口谕，要严厉肃奸，不管任何人，不得从宽。而社会上也盛传，周家有钱，已重贿法官，可免一死。主办案件的金世鼎和陈绳祖，钱哪有不要，只是周家的钱太烫手，拿不得，何况周家也未开后门来“献宝”。所以，周佛海自以为“功高盖天”，但还未审判，就已被定了个死罪！
杨淑慧使出她浑身解数，忙得不可开交。她确信丈夫立过大功，又一直是蒋介石的亲信，可以免罪。现在最要紧的是金钱铺路，打好官司。为了取得大量有利于周佛海的证明材料，杨淑慧不惜重金，到处送礼。在所有的大汉奸中，证明材料最多的，要数周佛海了，包括杜月笙写的证明不下30多份。杨淑慧什么都想到了，就是没有想到塞法院的洞。在大量闪闪发光的黄金前，法官也许会怦然心动的，但杨淑慧失策了。
杨淑慧花重金聘请章士钊、王善祥、杨家麟三位著名律师，负责辩护。但杨淑慧纵有通天本领，过不了蒋介石这一关也不行。
1946年10月21日，国民党南京高等法院在朝天宫宽敞的大成殿内，布置法庭，公审周佛海。
一早，朝天宫内外就密布宪兵法警，三步一岗，五步一哨，气氛紧张。尽管如此，旁听者还是来如潮涌，不到9时，已经挤得水泄不通，连两边窗槛及围廊里也全是人了。
上午9时30分，公审开始。由院长赵琛任审判长，推事葛之覃、金世鼎，检察官陈绳祖，都是司法界的名流，加上响当当的三位辩护律师，像唱戏一样，名角如云。
律师提供的有利于周佛海的证明是大量的，有军统的，陆军总司令何应钦的，第三战区司令顾祝同的，“党皇帝”吴开先的，上海市党部的……
但军统毛人凤大概因为没有拿到杨淑慧的大金条而昏了头，在证明周佛海有功后，又有一封公函，说“完全是对汉奸在策略上的利用”，前后矛盾。
审判开始。官样文章般问过一通后，就进行辩论。法官、检察官、律师和被告唇枪舌剑，车轮大战，拖了近五个半钟头。
辩论集中在“通谋敌国”上，检察官一口咬定，被告出卖国家，所谓立功，不足抵罪。周佛海说了大段表功的辩词，滔滔不绝，竟达一小时之久。
周佛海在后来的《狱中日记》内写道：
检察官控告通谋敌国，图谋反抗本国。余谓，上半段为通谋敌国，图谋挽救本国，因历述动摇日军士气，淆混日本国民各谋略以及妨碍日军各种行动等。后半段应为通谋本国，图谋反抗敌国，因详述与中央联络后如何营救抗战工作人员，如何刺探敌军军情等。
甚至，连戴笠密令毒杀“76号”魔头李士群一事也搬出来了。周佛海在庭上说：“戴局长有电，处死李士群。后和华中宪兵司令部科长冈村商量，予以毒毙。”
周佛海说得额头冒汗，手舞足蹈。
辩论快终结时，已经夕阳西下。哪知冷火里爆出颗热栗子，检察官陈绳祖站起身来，举手摇着几张纸，声震屋宇般喊道：“这里有蒋委员长侍从室和军统局的公文，对周犯所称功劳及胜利时委派为上海行动总队司令一事，完全是一时利用！”
轻飘飘的两张信纸，也不知是真是假，就将周佛海的表功全部否定了。旁听的人群一阵骚动，审判长不断摇铃，提醒肃静。周佛海也有点心慌，但马上镇静下来，心中暗忖：我还有老蒋亲笔信这张王牌呢！
审判长宣布辩论结束，定期宣判后，这场闹剧暂时落下帷幕。
周佛海虽经检察官重重一击，但仍精神亢奋，陶醉于自己的表演。回监房后竟然忘形地写了一首歪诗：“六年险苦事非常，欲挽狂澜愿幸偿。举国纷纷论杀宥，万人空巷看周郎。”
11月7日，晴天霹雳，高等法院以“特定第三四六号特种刑事判决书”，判处周佛海死刑。杨淑慧一听，三魂出窍，六魄飘荡，顿时目瞪口呆，周佛海真的要等枪毙了吗？
杨淑慧当然立即上诉，但1947年1月20日被最高法院驳回，死刑原判。按照国民党的法律，还有最后一条路，就是家属向司法行政部提出抗告，但仍被驳回。
满城爆竹，声声响在杨淑慧心头，因为抗告驳回24小时之内，丈夫随时可以枪毙。
杨淑慧大冷天浑身汗淋，顾不上忌讳礼节，当夜就闯进了蒋介石侍从室机要秘书陈方的家。陈方是丈夫的老朋友，又能随时见到蒋，不会坐视不救。
陈方见她头发蓬乱，脸色刷白，知道定有急事，马上进入客厅说：“周太太，定定神，慢慢地说。”
杨淑慧也不哭，一副豁出去的样子：“抗告驳回，佛海随时可以枪毙。如果蒋先生一定要杀他，就杀吧！我马上到香港，将蒋先生的亲笔信向海内外公布。这是个政治道德问题，看今后还有谁肯替蒋先生卖命！”
陈方一听，也着了慌，连忙说：“蒋先生早已说过，没有他点头，任何人不得处决佛海。法院如要执行，肯定先要有文到侍从室，我一定压下。我以生命担保，佛海不会死。明天年初一，我向蒋先生拜年，一定提醒他处理佛海的事。周太太放心吧！”
陈方言尽于此，杨淑慧只得半信半疑地走了。天寒地冻，朔风凛冽，她听着远近爆竹，万箭穿心。
年初五一过，毛人凤突然找到杨淑慧，说蒋介石召见她。她到了官邸，陈方领她进去，只见蒋介石早端坐在客厅里了。她一见蒋介石，眼泪就簌簌地流了下来。她赶忙跪倒在地，什么话也说不出来，只有阵阵抽泣悲咽的声音在四周荡漾，气氛悲切。
杨淑慧以无言代替千言万语，事至如今，说话是多余的。
蒋介石皱着眉头，打破沉默说：“这几年来的东南沦陷区，还亏了佛海，一切我都明白。起来，安心回去吧，我会想办法的。让他在里面休息一两年，我一定放他出来。”
杨淑慧终于吃了定心丸，轻轻地又磕了几个头，就站起来走了。从头到尾，一言未发。
杨淑慧以忐忑不安的心情等着，时间是一秒一秒挨过去的。周佛海既没有被枪毙，蒋介石也未见动静，这葫芦里到底卖的是什么药呢？杨淑慧身心煎熬，度日如年。
直至1947年3月26日，蒋介石才以国民政府主席的身份，发布特赦令。
特赦令说：“周佛海在敌寇投降前后，维持京沪杭一带秩序，使人民不致遭受涂炭，对社会之安全，究属不无贡献。兹依约法第六十八条之规定，准将周犯原判之死刑，减为无期徒刑。此令。”
命令一出，压在杨淑慧心上沉甸甸的石头落地，丈夫性命到底保全了，“让他在里面休息一两年”，就可以出来重整旗鼓了。这是国民党对汉奸发布的唯一的特赦令，来之不易，周佛海终于死里逃生。
周佛海逃脱一死，喜出望外，但庆幸之余，惦量一下“终身监禁”的份量，想起将要在监狱里打发未了的岁月，看看四周的破壁，阴森森的铁栅栏，还有苦于下咽的饭菜，再忆起位于上海西流湾8号的自己公馆里的风景和养尊处优的生活，一种说不尽的凄凉、哀怨、忧伤、绝望顿时涌上心头。
1948年2月28日，在一阵哀号之后，周佛海口鼻流血，毙命于老虎桥监狱。
