在京都大学初次得见这本学报，系明治三十七年七月二十日即光绪三十年六月七日印行，东京高等师范学校教授葛冈信虎纂辑。赞助人列名有二，一是东亚同文会副总裁、东亚同文书院院长长冈护美子爵，一是东京高等师范学校校长、弘文学院院长嘉纳治五郎。弘文学院专为中国留日学生所设，相当于升入日本正规大学之前的预备学校。
这本学报设有论说、教育、地理历史、理学、法制经济、殖产兴业、传记、特别讲义、艺苑、汇报、学海丛录、广告等专栏。
第一篇之论说栏刊载长冈护美《告清国志士诸君》一文，内称：“近时清廷深悟既往谬计，虚心降气，孜孜图治，以故观光重臣，留学士子，相踵东渡，就我寻师。我国上下，亦同感动其热心求道，为公忘私，胥俱竭力殚虑，日思切磋琢磨，忠告相导。而其少壮人士，才隽气锐，矫枉过正，或有放言妄议，空想一跃直与美洲同其政体，主张共和。遂使彼中外枢要，老成贤达，嫌疑引身，顾虑无为。而宇内大势，推移不已，东亚同盟，多为阻止。蚌鹬相争，渔翁得利，其误国自毁，祸决非小也。苟真实忧国愤世之士，岂当如是耶？”
论说栏还有葛冈信虎《学报所以急于今》一文，强调日本“任开导之天职”，以学校、图书、报刊“启发陶冶清人思想”。“现在东京清国留学生，其数及二千余名。”“清国留学生等于东京所刊行杂志亦有六七种，然记事大抵偏一局，且其论说或有弄过激之言，猥煽世人之弊。或不免孟浪杜撰之讥，往往传误谬揭僻说，有灭却彼我真相之虞。”
这本学报主要是为中国留学生预备教育而创办，但其政治倾向则是维护清廷而反对民主共和。当时《湖北学生界》、《浙江潮》、《江苏》等期刊已接踵而起，东京中国进步留学生革命思想日趋成熟，所谓“弄过激之言，猥煽世人”，即针对这一趋势而言。
作为《日新学报》赞助人之一的嘉纳治五郎，对中国留日学生曾有长期教育工作经验。早在1899年，他就将自己主持的私塾改名亦乐书院，接待张之洞派遣的11名留学生，校名亦乐系取“有朋自远方来，不亦乐乎”之意。1902年1月，他又在亦乐书院的基础上创建弘（宏）文学院，以适应日益增多的中国留日学生的需要。该校主要是为中国学生在接受高等教育前进行预备教育。三年制本科讲授日语及中学课程，第三学年分为文理两科。然后又在此基础上增设分别为一年、八个月、六个月的速成师范科、速成音乐科等。弘文学院发展很快，据1906年的《宏文学院一览》记载，该校已毕业1959人，在校学生1615人。分36班，班名多以地区命名，如南京普通班、湖北普通班、四川速成师范科班等。黄兴、鲁迅、陈独秀等初来日本时均曾在该院就学。但嘉纳治五郎办学成绩并非甚好，《江苏》第一期发表的《弘文学院学生退校善后始末记》已有所陈述。日本有识之士也为留学生速成教育感到忧虑，1905年7月17日东京《朝日新闻》刊载《中国留学生问题》一文，即曾痛陈中日双方热衷速成教育之失策。嘉纳治五郎为了赢利，除迎合中国政府与学生急于速成心理外，还加强与中国官府联络，游说他们派遣更多的留学生。他的这种思想状态，在《日新学报》上自然会有所反映。（参见实藤惠秀《中国人留学日本史》。）
