慈禧太后对于胡孚宸的这番弹劾批示极严，命令光绪皇帝立刻查办翁同龢。光绪皇帝在慈禧太后面前流着眼泪、磕磕巴巴地为翁同龢反复辩护，军机大臣廖寿恒为了搭救翁同龢，也特意向慈禧太后叩头谏阻。最后，慈禧太后总算是微微地冷笑一声，允许对翁同龢施以"免议"、不再查究的隆恩……
就在这一天，慈禧太后命令光绪皇帝颁布上谕，派军机大臣刚毅管理健锐营，派礼部满尚书怀塔布管理圆明园官兵。
光绪二十四年五月初八日（1898年6月26日），光绪皇帝谕令太常寺少卿盛宣怀，芦汉铁路刻日兴工，并开办粤汉、宁沪各路。同一天，鉴于诸顽固守旧大臣将《明定国是诏》中所强调的"京师大学堂为各行省之倡，尤应首先举办。着军机大臣，总理各国事务衙门王大臣，会同妥速议奏。"这一重要新政持续敷衍拖延、不予执行，光绪皇帝再次发出上谕，严令军机处与总理各国事务衙门"迅速覆奏，毋稍迟延。"
光绪二十四年五月十三日（1898年7月1日），被"开缺回籍"的翁大状元翁同龢终于离开了让他这么多年以来历真、历幻的皇城北京，启程返回家乡江苏常熟……
翁同龢在马家铺火车站登上了前往天津而去的火车，到火车站为他送行的各界人物很多，出名的大官僚有军机大臣王文韶、军机大臣廖寿恒、军机大臣钱应溥、协办大学士孙家鼐、内阁学士那桐、侍读学士徐致靖等人，有名的"清流"人物有盛昱、黄绍箕等人，著名的维新人物有康有为、梁启超、沈曾植、沈曾桐、张謇等人……与此同时，许多人也分别派人持函、替自己到火车站为他送行，这其中有许多是与他在朝廷、官场上为权、为利、为名而争斗了多年的人物，例如：总理衙门大臣李鸿章、总理衙门大臣张荫桓、前军机大臣兼总理衙门大臣徐用仪、前军机大臣孙毓汶等人……
时已过午，喷火的骄阳渐渐隐没在黯然沉闷的浓云厚雾之后……未初时分（下午一点钟），翁同龢所乘坐的那列火车鸣笛启行……
当车窗的玻璃上已经不再有送行的人群、高大的城楼、厚实的城墙的掠影出现的时候，翁同龢开始翻看那些送行的书函。厚厚的一摞书函，他唯独将李鸿章的那封挑了出来，仔细地、反复地看着……
第二天--光绪二十四年五月十四日（1898年7月2日），翁同龢在塘沽换乘了海轮，在大海波涛的颠簸中往南而去……
翁同龢被迫"开缺回籍"让人们强烈地感觉到了维新变法事业所面临的不祥前景，尽管如此，维新变法事业仍然在勉强进行着……
光绪二十四年五月十五日（1898年7月3日），光绪皇帝诏立京师大学堂，任命协办大学士孙家鼐为管学大臣。同一天，光绪皇帝赏举人功名的梁启超以六品衔，命令他办理译书局事务，并将译书局与早在光绪二十二年正月二十一日（1896年3月4日）就已成立的官书局一起并入京师大学堂内，由管学大臣孙家鼐督率办理。
光绪二十四年五月十六日（1898年7月4日），光绪皇帝诏兴农学，并谕曰："振兴庶务，首在鼓励人材。各省士民著有新书，及创新法，成新器，堪资实用者，宜悬赏以劝。或试之实职，或锡之章服。所制器给券，限年专利售卖。其有独力创建学堂，开辟地利，兴造枪砲厂者，并照军功例赏励之。"
这一天，湖广总督张之洞将他所写的《妥议科举新章折》向光绪皇帝呈递了上去，这道奏折所谓的"妥议"，其实是说康有为在那道《请废八股试帖楷法试士改用策论折》中所述观点不妥。张之洞在这道奏折中提出了与康有为的观点针锋相对的观点，并提出了一个他认为可行的改革科举考试的方案：乡、会试分三场考试，第三场试四书五经。
光绪二十四年五月二十一日（1898年7月9日），光绪皇帝诏令八旗两翼诸营，均以其半改习洋枪、抬枪。--早在二十天之前，光绪二十四年五月初一日（1898年6月19日），光绪皇帝为了军事改革的问题，还曾颁布过这样一道诏令："陆军改练洋操，令营弁学成者教练，于北由新建陆军，于南由自强军派往。各疆臣限六阅月，举并饷练兵及分驻地，妥议以闻。其军械枪砲，各省机器局酌定格式，精求制造。"
