大胜三河镇，解天京之围后，李秀成休兵三日。洪秀全因迫于当时形势需要，命李秀成整兵出发，去攻打常州、苏州，限在一个月内把这两郡攻下。李秀成当时表示不愿意，但王命不得不听，只好整兵于5月15日出发，向丹阳进军。丹阳城内外，有清军张国华败军把守，外扎军营。到丹阳第二天，李秀成在外叫阵，张国华当即大开南门出兵迎战。第一日战争激烈，两军死伤都很惨重。第二日又战，从早晨一直战斗到晚上，张国华的清兵大败，死伤无数，张国华也在激战中死于南门河下乱军中。丹阳之战，清军死伤一万多人。战后，李秀成派人找到张国华的尸体，用棺材埋葬于丹阳塔底下。李秀成为何这样做呢？在他后来的《自述》中解说道：“两国交兵，各帅其主，胜败乃英雄，死不与仇，此是英雄之心。”即是说他敬佩张国华的英雄之心。5月22日，李秀成顺势攻下常州。在攻常州城时，大败清水陆兵。正当常州危急时，清军救兵张玉良率部从杭州郡内出发赶到，全部屯扎在常州城外，有大小营盘四十多个。5月22日开战，李秀成尽破清军之营，大败张玉良之军。张玉良之军浩浩荡荡而来，却大败而归。
此时，金陵外围的和春、张国华的大营在太平军的攻击下，败的败，撤的撤，损失无数。连和春、张国华所率的清军都遭惨败，其他守地的清军更是无抗击之心，闻风丧胆，都在援助常州的途中遇上太平军而溃逃。这样，常州城孤立无援，被太平军连攻数日后，于26日开城投降。李秀成进城后，安抚百姓，休兵二日，稍作休整后又向无锡进发。
无锡由张玉良驻常州的残军败将镇守。张玉良一边守城，一边焦急地等待援兵。当时，宜兴守将刘季三奉命率军赶到无锡援助。刘、张二军汇合，军力有所增强。开战第一天，未分胜负，清军依城死守。第二天，李秀成亲自率军自惠泉山向无锡城西门进攻，架起云梯爬城而入，打开城门，太平军蜂拥而入。张玉良水陆两军大败，弃城而逃。李秀成攻下无锡城后，也不急着追击张玉良逃兵，而是安抚城中百姓，养兵二日，再拔营寨于6月1日进军到苏州阊门，围困苏州城。当时，清军在城内胡作非为，抢掠百姓财物，极为猖獗，城内百姓怨恨不已。而且，苏州城内守兵所剩无几，都因去援助无锡而造成城内空虚。城内守兵也大多是南京、常州、无锡一带败回的残军败将，在城内惶惶不可终日。张玉良见太平军势不可挡，带领其部下连夜逃出城。城内守将见张玉良未战先逃，非常气愤。李文炳、何信义等人密谋献出苏州城。1860年6月2日，苏州城内清军向太平军投降。李秀成带兵入城，发出告示安抚苏州城内百姓，对投降的清军说，要回家的就回家，发给盘缠；要留下的就留下，继续随太平军作战。许多清兵纷纷归顺太平军。城内百姓由于长期遭受清军的剥削压迫，对军队士兵戒备之心很强，所以也经常困扰李秀成的军队，连续捣乱十多日（其实这也主要是当地的地主武装所为）。李秀成采取安抚政策，宣布减轻赋税，由政府定出租额，按定额收取，同时还监督地主对农民的收租，以减轻农民的负担，还鼓励发展手工业和商业等。李秀成在苏州采取的各种措施，减轻了地主对农民的剥削和政府对农民征收的田赋，这在很大程度上减轻了农民的双重负担，有利于提高广大农民的生产积极性，促进了当地农业经济的发展，又扶助工商业发展，活跃了当地的商品流通，市场物资丰足，人民生活富裕。这样就给太平军提供了一个坚实的后方，既有丰足的粮食，又有广大百姓的支持。这也是李秀成在苏、浙一带行军作战后一贯采取的政策，为巩固和发展本地区的太平军根据地，作出了很大的贡献。
当张玉良放弃苏州城带领部下向杭州郡而逃时，李秀成派陈坤书、陈炳文率军从苏州出发尾随张玉良之军。1860年6月13日攻克吴江县，次日攻取平望，后直进嘉兴。在嘉兴攻打二日后占领该城，守将战败而逃。李秀成下令停止追击，安抚城内百姓。张玉良在杭州休整两日后，渐渐恢复士气，于7月带兵反扑嘉兴。在嘉兴城外驻扎大小营寨四十多座，将嘉兴南门紧紧围住。太平军出城应战，战败退回城内，据城力守。8月15日，张玉良用炮轰开嘉兴南城城墙五丈多宽。清军乘势涌入城内，城内太平军奋力抵抗，打退清军。在苏州的李秀成得知嘉兴危急，就从上海撤军立即前往嘉兴增援。一路上攻克嘉善、平湖，于9月4日到达嘉兴，立即与张玉良军开战。李秀成分兵一路进扎石门，截断清军的退路，正面同张玉良激战5日后，打败了张玉良。张玉良向后撤退，见退路已断，江浙一带多为水路，清军见无陆路可逃，只好献营投降了。张玉良率部仍在顽固抵抗，最后见其部下都已投降，不敢再战，杀出一条血路从小道逃回杭州城。李秀成解了嘉兴之围后，也就带领本部兵马回到苏州，息兵安民、开仓放粮、接济贫民，对农民减轻赋税，采取休养生息的政策。
