哥白尼的学说渐渐地在欧洲流传了开来，一开始的时候教会并没有关注到这个学说的可怕之处，他们任由那些反对者去抨击这种学说。
但是随着日心说的广泛流传，教廷终于感觉到了这种学说的可怕之处：哥白尼对于宇宙的认识从根本上推翻了亚里士多德以来地球是宇宙中心的说法。
日月星辰不再围绕着地球旋转，而都是围绕着太阳旋转，那么上帝住哪儿？去住在那滚热滚热的太阳中吗？
“如果地球也是行星之一，那么圣经上所说的事情就都不会发生了，那么谁还会相信我们的话，教会拿什么来维持统治？来人，快快下令，将《天体运行论》通通回收，全部焚毁，一定要把它烧成灰烬。”
罗马教廷害怕了，哥白尼的学说触动了他们的统治地位，他们想尽一切办法阻止这种学说的流传。
但是，真理是阻止不了的，旧传统的力量是阻挡不住真理和科学的光芒的。虽然会有流血、有牺牲，但是坚定地信任科学总有一天能够战胜黑暗的统治。
在哥白尼生活工作过的地方弗龙堡，每年总有一些人前来参观和凭吊。这些人中间产生了哥白尼学说最早的信仰者，他就是丹麦著名天文学家第谷·布拉赫。
第谷以擅长于天文观测著称，他发明了新的观察仪器，改进了旧的仪器。
第谷孜孜不倦地观察了20年，对各个行星的位置作了测定，误差不大于0.067度。这种观察精确度之高在同时代是无与伦比的，可以说已达到肉眼观察所能达到的极限。
第谷编制的行星表也相当准确，因此人们称他为“星学之王”。由于第谷的声望和才能，1576年他被聘为皇室天文学家，受到格外优待。国王还拨出巨款，在滨海的一个岛上为他修建了一座天文台。这比起哥白尼来他的工作条件，可算是非常优越了。
第谷非常崇拜哥白尼。1584年他专门派了学生到弗龙堡，以便在那里考察验证哥白尼做过的一些计算，并收集有关哥白尼的文物。
他在自己的观察站里悬挂了哥白尼的画像，还曾写诗赞颂过哥白尼。他称赞日心说是“美丽的几何结构”，为它的简洁、清晰、能有力说明现象而赞叹不已。
尽管如此，第谷并没有接受哥白尼的学说。他是一位相信事实的天文学家，他认为如果地球在旋转，那么在地球上观察恒星时在不同的时候应该有差别。而第谷在观察中从未发现过这种视差。
第谷发现了托勒密学说的缺点和矛盾，又了解到了哥白尼学说的先进，但由于缺乏前瞻性，摆脱不了常识的束缚，第谷并不认为地球这样“既大且笨”的东西会动。
所以第谷采取了折中的策略，他自己另行设计了一套混合体系，又被称为第谷体系。
第谷吸取了哥白尼体系的精髓，认为行星是绕太阳而非绕地球运行的，但他仍然把地球静止在宇宙中心，认为太阳统率着行星、月亮同整个恒星天穹一起围绕地球作昼夜旋转。
充分理解哥白尼学说意义的是德国学者约翰尼斯·开普勒。开普勒是第谷的助手，从第谷那里得到了他毕生测量的大量数据。
开普勒也是了解奥西安德尔篡改哥白尼原著的第一位学者，并且成功地收集到一本未经篡改的原著《天体运行论》以及奥西安德尔写给哥白尼和雷蒂克的信件。
开普勒不仅理解哥白尼的理论，而且又把它向前推进了一步，他发现并解释了三大定律。
第一定律，所有行星分别在大小不同的椭圆轨道上运动。太阳的位置不在轨道中心，而在轨道的两个焦点之一。
第二定律，行星的向径，即太阳中心到行星中心的连线在相等时间内所扫过的面积相等。
第三定律，行星绕太阳运动的公转周期的平方与行星轨道半径的立方成正比例。
以上三个定律被称为开普勒定律。
开普勒获得了对行星运动的清晰认识。哥白尼体系到了开普勒手中真正变成了一个相当简洁、明晰、统一的体系。
伴随着文艺复兴运动的蓬勃发展，新的科学曙光已经浮现在世间。中世纪教廷为了维持他们的专制统治地位，在这个时候对所有的异教和科学进行了无情的毁灭和打击。
科学与宗教最大的一次较量开始了。为了打破宗教赖以维系统治的理论基础，一代又一代的真理信奉者们用自己的热血和生命宣扬和捍卫了哥白尼的日心说。
