田之国境内，一个名为音忍村的忍者村子渐渐兴起，音忍村的首领被誉为万蛇大人，麾下数百名平均实力都有中忍实力的忍者组成的小型忍者部队，拥有四名实力接近上忍的精英忍者，万蛇大人开发的咒印可以让四名精英忍者拥有超越上忍的能力，音忍村的突然崛起也引起木叶村的注意。
大蛇丸离开木叶后创建的村子，以八分音符为标志，村内忍者都使用声音攻击。曾和砂隐村一起攻打木叶村，但最终以失败告终。木叶崩溃计划失败后，大蛇丸便消失匿迹，音忍村却仍然存在，继任的五代火影千手纲手通过火之国大名向田之国发出了申请，以搜捕潜逃的木叶村叛忍大蛇丸为由，准备派遣数名上忍前往田之国的音忍村查找情报。田之国大名迫于压力，最终同意了火之国大名和五代火影千手纲手的申请。
与“晓”的战斗结束，因为新术威力过大，鸣人右手受伤，纲手禁止鸣人再度使用风遁?螺旋手里剑，暗部将大蛇丸巢穴消息通过信鸽传给纲手。纲手接到消息，组织由卡卡西带领牙、志乃和雏田的前往大蛇丸的基地，另一方面大蛇丸准备派遣手下红莲执行计划，红莲目赌了佐助打倒千人且衣服不沾一滴鲜血起了妒心，大蛇丸觉得差不多是时候将佐助的身体占为己有，便派遣红莲和幽鬼丸一同执行作战计划；纲手派遣大和，率领佐井、小樱二人增援卡卡西小队。
纲手下达新任务：“封印尾兽三尾，不许落入任何人手中；保护与尾兽能力有关联的幽鬼丸”，由静音领军的封印班开始建立四方封阵，搜寻三尾的下落，而兜则打算利用幽鬼丸的力量让三尾暴动，以便破坏木叶的结界，红莲因为控制三尾失败，被激怒的三尾攻击时，幽鬼丸为了救红莲而发挥了前所未有的力量，成功地让三尾停止了动作。
镜隐藏在暗处，准备夺取尾兽三尾矶怃，此时幽鬼丸已经通过外力让三尾矶怃安定下来，但是药师兜却决定让三尾矶怃发生暴动，药师兜趁着幽鬼丸和红莲休息的间歇，对静音等人发动攻击，小樱因为控制不稳定，造成三尾矶怃暴走，恰在此时，旗木卡卡西支援赶来，药师兜决定退走，但是却被卡卡西等人拦住。
鸣人与红莲为了保护幽鬼丸，在与三尾对峙的过程中一起被吞入了三尾的肚子里。两人为了寻找出口决定一起合作，而后在幽鬼丸和木叶的伙伴们展开救援行动，终于救出两人，兜利用幽鬼丸让三尾失控，攻击木叶的结界。封印结界破坏，药师兜准备心满意足的撤退，忽然三尾矶怃似乎被一股庞大的威压控制住，千手镜从湖底冲出来，右手金色的查克拉锁链锁住三尾矶怃的脖子，让三尾矶怃无法制造查克拉。
镜将三尾矶怃拉入自己体内，随后，千手镜利用木遁秘术牢牢控制住体内的三尾矶怃，三尾矶怃在千手镜体内无法发生暴动，六道仙人的查克拉和气息感染了三尾矶怃的心态，三尾矶怃和千手镜对拳和解，这也标志着千手镜正式成为第三代三尾矶怃人柱力，拥有木遁血继限界的三尾人柱力，千手镜将封印班的忍者们一一救起，众人苏醒的时候，千手镜将藏在暗处的晓力量组合击退，干柿鬼鲛重伤被轻伤的宇智波鼬救走。
三尾矶怃被千手镜安置在自己体内，千手镜成为了三尾人柱力，五代火影千手纲手下令，让千手镜教导漩涡鸣人掌控九尾的力量。任务完成，漩涡鸣人和红莲、幽鬼丸告别，红莲终于真心感悟，将虚弱的幽鬼丸带走远行。
返回村子后，千手镜便进行了短暂的修炼，利用木遁仙术优化了三尾矶怃的能力，木遁仙术激活了三尾矶怃体内的龙魂，三尾矶怃水遁能力获得了巨大的提升，三尾矶怃还小的时候曾经吞下一条被誉为魔蛟龙的海中妖兽幼崽，木遁仙术激活了三尾矶怃体内的龙魂，魔蛟龙的龙魂和三尾矶怃的尾兽灵魂完美融合，促使三尾矶怃发生第一次进化。
进化的三尾矶怃背部的龟壳变成了银黑色，背壳上的尖锐突起物变大占据着整个背部，同时，三尾矶怃的腹部长满了魔蛟龙的银黑色的龙鳞，三只尾巴变成了银黑色的龙尾形状，三条尾巴中间一条变成了可以任意伸缩，任意攻击任何方向的杀手锏。
