异次元空间开启了，从里面走出来了一个黑影，忽然，它快速飞向天边黑洞，一头钻了进去。
反转世界里，帕鲁奇亚正和帝牙卢卡扭做一团，破坏死光满天飞舞，这时，那黑影飞出，一瞬间，两只精灵倒下了。黑洞里又飞出一只猫形精灵，这就是梦幻，它飞到黑影面前，叫了几声，只见黑影说到：“他来了吗？想不到千年彗星，这么快就到了。天洛，这个世界能否存活，就靠你了。千年前的事，你还怪我吗？”梦幻点了点头，黑影又说到：“梦幻，走吧，记得把帕鲁奇亚和帝牙卢卡带走。”说完，黑影就飞走了，梦幻连忙跟了上去。
时空倒流一千年前，神殿中，创世神阿尔宙斯正和天洛聊天，“黑暗之魂快复活了，需要光明之力才能再次封印它。”阿尔宙斯对天洛说。“既然这样，那就封印它呗”天洛回答道。“可是，现在只有你才能封印它”阿尔宙斯紧张地望着天洛，生怕他不同意。天洛点了点头，离开了。阿尔宙斯默默地自言自语：“天洛，对不起了，虽然我们是朋友，但为了神奇宝贝世界，我也没有办法了”
黑暗之魂即将冲破封印，阿尔宙斯和天洛来准备封印它，天洛用光明之力挡住了黑暗之力，这时，黑暗之魂说道：“天洛，你封印了我，你也会死的”天洛惊奇地看向阿尔宙斯，阿尔宙斯正为难到看着他，对他说：“对不起了”然后用幻术强行把他大了进去。天洛狠狠地说“阿尔宙斯，你竟然骗我！”然后消失在黑暗之轮中。阿尔宙斯说：“一千年后，你将回来，再次来到这个世界。”
现在，一千年到了，天洛重现，将再次开始他的旅途。
