一晃时间到了崇祯十八年三月，败退回燕京的多铎和阿齐格部也得到了来自东北的补充，此次多尔衮命令满洲14岁以上至50岁以下的男丁全部进入军伍，给每个旗都补到50个牛录，一个牛录是300人，也就是满洲八旗每旗15000人，共计12万人，蒙古各部出兵总数12万人，强征鄂伦春兵3万人，汉奸部队20万人，共47万人。
多尔衮决定于崇祯十八年四月分兵两路，一路统帅是英亲王阿齐格，携苏克萨哈、伪怀顺王耿仲明、耿继茂父子率镶白.旗满洲15000人、镶黄.旗满洲15000人、镶白.旗蒙古15000人、镶黄.旗蒙古15000、汉军旗30000人共9万人过黄河进攻左良玉部，意图夺取湖广朔江而下直取南京。
另一路由豫亲王多铎为统帅、肃亲王豪格为副帅领着多罗贝勒尼堪、图赖、鳌拜和伪恭顺王孔友德、孔廷训父子领着正白.旗满洲、正黄.旗满洲、正红.旗满洲、镶红.旗满洲各15000人，共60000满洲八旗，正白.旗蒙古、正黄.旗蒙古、正红.旗蒙古、镶红.旗蒙古各15000人，共60000蒙古八旗，以及孔友德、孔廷训的30000人的汉奸部队共15万人，过黄河经过商丘直插泗水直驱扬州。
其余的正蓝.旗、镶蓝.旗满洲、正蓝.旗、镶蓝.旗蒙古各3万共6万人加上其余汉奸部队在郑亲王济尔哈朗统帅下与山.东地区的明军对峙，意图待多铎部夺取南京后，南北对进一举击溃明军。
在满清部署时，朱慈烺也完成了战略部署，在崇祯十八年二月出吴三桂领着夏国相、李本深、王屏藩、马宝、高得节、郭壮图、王辅臣、谭洪、吴之茂带着关宁铁骑3万人押送着李自成、高一功、李过、李来亨、郝摇旗、佟图赖、洪承畴进入南京城。
朱慈烺亲自为高一功、李过、李来亨、郝摇旗松绑道“汝等皆为我华夏赤子，当初无奈造反，而今国家用人之际，且我华夏民族之大敌为建奴，望尔等将来好生报孝国家，莫在做亲者痛仇者快的事情。”遂请旨封饶恕高一功、李过、李来亨、郝摇旗，准其军前效力，并擢升吴三桂为辽国公，并授予吴三桂武备学堂副祭酒兼骑兵课课长。此前朱慈烺通过葡萄牙商人引进了首批3000匹安达卢西亚马，红马、白马、黑马各千匹，安排在马群育种。
崇祯准之，高一功、李过、李来亨、郝摇旗等闯军降将也一律免罪，安排入武备学堂学习，主要是让钱谦益、刘宗周等人给他们洗脑，说到洗脑钱谦益是把好手，郑森之所以爱国就是拜他所赐，但是给别人洗脑是强项，自己却在历史上留下了‘水太凉’的经典笑话。
随后，朱慈烺请旨将李自成判处终身监禁，在南京老虎桥监狱服刑，而洪承畴、佟图赖则被凌迟而后枭首示众。
崇祯十八年三月十九日，钟山武备学堂正式开课，朱慈烺出席开学典礼并致辞道“同学们，你们中将有人成为把总、管带、总兵、总统官、甚至是都督，我们的校训是‘亲爱精诚、真诚守信、爱国爱民。’”顿了顿朱慈烺又道“打仗要想赢就得讲纪律，戚少保初到在蓟门，训话间下雨了，所有原先戚家军的士卒没一个挪窝，而原先蓟门的士兵呢？作鸟兽散，浑河之战戚家军6000人对30000满洲八旗，虽然结果是全军覆没，可是八旗兵是用死了20000人的代价，都说满不过万，过万无敌，放屁，真正无敌的是我大明的戚家军，我要打造你们成为大明军的骨干，成为百战百胜的王师。一支军队要有军魂就要有军旗、军徽、军歌，军歌就用凯歌‘万众一心兮，群山可撼。惟忠与义兮，气冲斗牛。主将亲我兮，胜如父母。干犯军法兮，身不自由。号令明兮，赏罚信。赴水火兮，敢迟留！上报天子兮，下救黔首。杀尽强奴兮，觅个封侯。’，为什么不用建奴而用强奴，因为教训，倭寇灭了，戚家军也没了，戚家军的军魂也没了，我是要告诉你们有敌人要有强军，没有敌人我们依旧不可马放南山。”又顿了顿道“多铎、和阿齐格马上就要带着24万鞑子和汉奸南下，能让他们活着回去吗？”
“不能”校场上的将士高声道。
“那你们就要苦学杀敌本领，这次我们要一战将多尔衮打得半身不遂。”朱慈烺说着传达命令道“夏国相、李本深、王屏藩、马宝”
“末将在”夏国相、李本深、王屏藩、马宝出班行一跪一揖礼道
“你们四人从京营选兵7万组建近卫第二纵队，严加训练后驻守栖霞山，以响箭为号，届时杀奔镇江”
“得令”
“高一功、李过、李来亨、郝摇旗听令”
“末将在”
“你们四人从京营选兵7万组建近卫第三纵队，严加训练后前往九江，平定左良玉叛军”
“左良玉会叛乱？”吴三桂不解的问道
“左良玉或许不会，但是左良玉的儿子左梦庚会投敌”
“为何让高一功他们去，我关宁军虽只有3万对付他左良玉20万乌合之众还是绰绰有余的”
“定辽王是鞑子的克星，高一功、郝摇旗这些英雄则是左的克星”朱慈烺笑着道
“高得节、郭壮图、王辅臣、谭洪听令”
“末将在”
“你们四人在京营中选兵4万合着关宁军组建近卫第四纵队进入钟山待机，只需保护孝陵，等到响箭发出后进攻多铎大营”
“沈廷扬、郑鸿逵、郑森听令”
“末将在”
“你三人各带水师‘新式战船’10艘”朱慈烺顿了顿“郑鸿逵，朔江而上，配合陆路打击左良玉和阿齐格。沈廷扬率队出海骚扰天.津。郑森率队出海至吴淞待多铎渡江后封锁镇江，使敌有来无回。”
“得令”
当夜，朱慈烺写信给孙传庭所部，让他们守住陕甘。同时得到信的有姜让、姜瑄、姜镶兄弟让他们只管守城不必勤王，等多铎覆灭再北伐收复北直。
同时得到信的还有周遇吉、刘肇基、唐通等诸将，并告知要坚壁清野，连树木都砍伐光，城外房屋扒光。
转眼间四月就到了，阿齐格在三月就迫不及待的发起进攻，在河南自然是如入无人之境，而后从荆州襄阳，再到武昌，沿途的大小城市，渡口，几乎没有像样的抵抗。左良玉麾下的大将马进忠被打的溃不成军。三月二十五日畏敌如虎的左良玉就火烧武昌城继而以‘废太子，清君侧’为名率18万残部进攻九江，沿途烧杀抢掠，又拉了几万夫子，在九江他遇到的是老对手‘闯贼’，高一功、李过、李来亨、郝摇旗所率的不再是乌合之众，而是装备了960门‘克努伯’和1000枚‘龙卷风’火箭的第三近卫纵队，虽然由于产量和对这四人的一些顾忌，灭奴神机铳只给了一万只，其余都是练得‘鸳鸯阵’冷兵器部队。但是还是打的左良玉一溃数十里，死在撤退途中，左良玉之子左梦庚在黄澍怂恿下抓了湖广总督袁继咸向阿齐格投降。
……
“左将军，真俊杰”阿齐格道“你率部为先锋，待打下南京，你也不失封王”
“谢英亲王”左梦庚如同哈巴狗一般的跪在地上
……
