刘邦攻入咸阳之后，过不多久项羽的部队也开了过来。项羽将部队驻扎在鸿门，由于刘邦军中曹无伤的告密，项羽对刘邦大起疑心，决定要解决刘邦。公元前206年12月，项羽在新丰鸿门举行了一个暗藏有杀机的宴会。项羽的军队都是身经百战的精兵强将，如果当真打起来，是四十万对十万，刘邦绝对败阵。幸好张良利用自己和项伯的关系打通关节，项羽才给了刘邦一个辩白的机会——鸿门宴。在宴会上，项羽的谋士范增见到项羽渐渐的被刘邦说服，就密令项庄诈称舞剑，要害刘邦性命，幸亏项伯比较够意思，他也起来舞剑，用身体挡住了项庄的进攻路线。当时情况已经非常危急。
刘邦身边只有一位手无寸铁的张良，面对这种情况是束手无策，他走出军门见待命在营外的樊哙。樊哙问：“情况怎样？”张良道：“情况紧急！现在项庄拔剑起舞，用心时时在沛公身上！”樊哙当机立断：“如此说来情况很紧迫了！让我进去，与他拼命！”说完持剑盾闯项羽的军门。军门卫士拦阻樊哙，不让进去，樊哙持盾掩着身体，向卫兵撞去，卫兵全部倒地，樊哙径直闯进去，分开帐帏，向西站立，双眼瞪着项王，眼角都快裂开，头发根根直立。项羽大吃一惊，被樊哙这惊人举动吓着了，按剑喝问：“请问你是谁？”张良跟进禀报：“这是沛公的参乘，叫樊哙！”项羽身居显赫的身份总不好意思当着这么多人的面和一个无名小辈计较吧？樊哙这豪壮举动让项羽顿时哈哈大笑：“好个壮士啊！赐他卮酒！”左右便送来一斗卮酒。樊哙拜谢后，站着一饮而尽。项羽：“赐给他猪腿！”左右又送来一条生猪腿。樊哙把盾倒扣在地上，把猪腿放在盾上，用剑切着就大嚼大吞。项羽佩服他说：“壮士！还能再喝酒吗？”樊哙说：“死也不怕，还怕喝酒？现在秦王暴虐狠毒，是虎狼之心，杀人只怕不尽，用刑只怕不重。天下人痛苦不堪，都起来反秦。楚怀王和诸将有约：‘先打败秦军进入咸阳的，在关中为王。’如今沛公先破秦进入咸阳，对咸阳的一切连毫毛大的都不敢接近；封闭官室，回军霸上，专等您大王来主断。派遣将士驻守函谷关，是为了防备其它盗贼进入和发生意外。我们沛公，这样劳苦功高，没有封侯之赏，反而大王听信小人之言，要杀有功之人，这种做法，就是暴秦那一套的继续罢了！我认为大王实在不该这样！”项羽一时之间还没词回答，说：“坐。”樊哙就随张良坐在一起，趁着项羽犹豫不决的时候，刘邦去上厕所，樊哙跟了出去。樊哙说：“沛公！咱们走吧！”沛公：“刚才出来没有告辞，这怎么办？”樊哙说：“办大事不必拘小节，讲求大礼不在乎小的责难。如今人家是快刀和菜板，我们是鱼和肉，为什么要告辞？就让张良留下来向项羽告辞吧！”樊哙就把张良唤出对他道明情况，张良问：“大王今天带什么东西来没有？”沛公：“我带来白璧一双，想要献给项王；又带玉斗一双，想献给亚父，看他们正在发怒，就没献出，你替我献上吧。”张良：“遵命！”项羽军队在鸿门，沛公军队在霸上，两军相距四十里路。刘邦对张良说：“我留下车马随从在鸿门，独自一人骑马，脱身而去。樊哙、夏侯婴等四人持盾步行跟随，都由骊山抄芷阳小路走。从这条小路到我军住地，不过二十里路，估计我已到军营，你再进去辞谢。”张良遵照嘱托磨蹭一会去致谢说：“沛公不胜酒力，不能亲自向大王告辞，谨使张良举白璧一双，再拜献上大王。玉斗一双，再拜献上大将军。”张良举献上白璧和玉斗。项羽问：“沛公现在在什么地方？”张良说：“沛公听说大王对他有责备之意，十分害怕，所以就先走了，想必可能已回到军中！”项羽便接受了白璧，把它放在座席上。范增接过玉斗，扔到地上，用剑把它砍破了，还哀叹道：“唉！项伯这小子，不好共同谋大事！夺项王天下的人，一定是沛公了！我们这些人眼见要成为刘邦的俘虏了！”刘邦回到军中，立刻诛杀了曹无伤。（史记.本纪）
樊哙有了在鸿门宴上的卓越表现，能够在天下无敌的西楚霸王面前耍酷，胆子也够大的。鸿门宴后，刘邦与项羽就拉开了漫长而激烈的“楚汉相争”的序幕。楚汉相争，樊哙开始率领部队作战，不停的立着一些战功。八月，由汉中还定三秦，樊哙升郎中骑将，复迁为将军。继参加对楚作战，屯守广武(今河南荥阳北)一年。刘邦在樊哙、曹参、萧何、韩信、张良等人的大力支持配合下，最后是反败为胜。
樊哙不仅取得了刘邦的信任，而且还取得了吕后的信任，他得了吕后的妹妹吕须为妻，加入了吕氏的政治集团。樊哙就成了红人，开始进入刘邦的核心统治集团。
（202年）在刘邦伙同樊哙、曹参、萧何、韩信、彭越、英布等人打败项羽之后蹲上了皇帝的宝座。樊哙跟着刘邦南征北战，论功行赏，终于被封为舞阳侯。十月，燕王臧荼造反，高祖亲自挂帅，樊哙带兵攻取代地，俘虏臧荼。不久，利几又谋反。利几本是项羽的部将，项羽被打败后，就投降了高祖，高祖封利几为颍川侯。高祖到洛阳按名册召诸侯，利几担心自己以前是项羽的部将，会有所不测，因此就谋反。仍是高祖亲自挂帅，樊哙带兵攻取，把利几打跑了（史记本纪）。高祖七年，匈奴攻击韩信所辖的马邑，韩信趁机勾结匈奴在太原谋反，白土城有他的部将曼丘和王黄，一起拥立前赵将赵利为王，也反叛汉朝。高祖又亲自领兵前往征讨镇压。正值天气寒冷，士卒手指冻落的达十分之二三，好不容易达到平城。却让匈奴人把他们围困了七天，还是樊哙鼓舞士兵并带士兵去打退了韩信。又让樊哙留守北方，直到宰杀了陈豨。平定了代地（史记本纪）。汉高祖十二年(前195)二月，樊哙率兵击燕王卢绾,平定燕地（史记本纪）。樊哙带兵摆平了多个异姓诸侯王的叛乱。当然，他为了汉朝的稳定，也成了人见人畏的杀人王。楚后无二将，汉兴第一名。樊哙就成为了勇将的代名词。
在英布造反的时候，刘邦正在生病，在宫中不想见人，就命令手下把守大门不准把大臣们放进来。这个时候包括周勃在内，所有的大臣都不敢进去。事情变的越来越麻烦，樊哙就直接闯了进去，见到刘邦靠着一个太监正在睡觉。樊哙立即跪下，号啕大哭说：皇上！您为什么要这么消沉？而且现在您身体不好，大臣们都很担心，您不和我们商量事情，您难道忘了赵高的事情吗？——这种话也只有樊哙敢讲。樊哙的心直口快，也给他埋下了祸端。
吕后随着年纪大了，常留守在家。戚夫人受到宠幸，常随高祖到关东作战。吕后就很少有机会与高祖见面。在太监的唆使下，刘邦越来越宠爱自己的嫔妃戚夫人，生下了赵隐王如意。高祖常认为孝惠帝为人仁慈柔弱，不像自己，于是就常常想废掉太子，想改立戚夫人生的赵王如意为太子，他认为如意的个性比较像自己。好几次取替太子的事都被大臣力劝住，张良也用了计谋，就是因为樊哙的威望，孝惠帝才保住了太子地位。刘邦冷落吕后，樊哙由于和吕后有姻亲关系，自然也就受到了一些牵连。在燕王卢绾造反的时候，因为刘邦身体不适，所以下令樊哙率领部队去平定。有人本来就对吕后樊哙这个政治集团不满意，这个时候就出来告黑状，说樊哙想趁这次机会彻底消灭戚夫人以及赵王如意一伙人。刘邦顿时大怒，立即命令陈平和周勃去代替樊哙率领部队，并且直接将樊哙斩首。此时樊哙势力庞大，大臣有所畏惧，倘若斩了樊哙，如果再有人叛乱，就没有人能平定得了。如果宰杀了樊哙，更让戚夫人以及赵王如意一伙人得逞。所以吕氏一帮又竭力保救樊哙。刘邦就没有让陈平杀樊哙，释放了樊哙，还是官复原职。
刘邦在攻打英布时，被箭射中，行途中病重。吕后请良医来医治。刘邦见到医生就骂起来：“我布衣手提三尺剑取天下，这不是命吗？性命在天，虽有扁鹊在世有什么用处？”于是不让治疗，赐五十两黄金给医生，停止治疗。吕后惴惴不安的问：“陛下百岁后，萧相国也死，谁可以代替？”皇上说：“曹参可以。”吕后又问：“曹参死后啦？”刘邦说：“王陵可以，他虽然年少憨厚，陈平可以帮助。陈平智谋有余，然而难以独挡一面。周勃稳重忠厚少文雅，安定刘氏天下者一定是周勃，可任太尉。”吕后又问其次，皇上说：“这以后也不是你所能知道的了。”吕后心想：樊哙在朝廷也是一重臣，为何他子字未提。她越发感觉樊哙势力对她的威胁。吕后的两个哥哥都是高祖的部将，加之吕后为人刚强坚毅，辅佐高祖平定天下，后来诛杀大臣的谋略也多是由他们出力献策。大哥周吕侯死于战事，他的儿子吕台被封为郦侯，吕产为交侯；二哥吕释被封为建成侯。
