却说鸿蒙教现世，巫妖两族都很无奈，知道，无论谁获胜，天地主角都将成为一个笑话，只是又不得不做过一场了结因果，原来两族天定陨落，退出洪荒主角，给人族腾地方，现在两族各有人为逍遥子门徒，都明了了因果，原来这一切正如龙汉初劫，都是天道在算计洪荒生灵，于是，气愤的同时，也是无奈，于是相约，各出一部分老弱残兵，打一场终极之战，然后听从鸿蒙教的安排再做打算，这也是逍遥子命盘古和盘娥前去两族劝说的结果，做过一场，全了天道的面子，然后各过各的。天道得知情况，也是无奈，形势比人强啊，于是逍遥子决定，巫妖大战后，为两族分别开辟妖界和魔界，以供其生息。
两族大战开始了，无数的小妖，老妖，普通巫人开始了持续千年的战斗。这场大战虽然没有高绝实力的大妖大巫出战，但洪荒出世无有废柴，也是打的日月无光，洪荒震动，也不怪天道算计巫妖两族，老弱尚且如此，更遑两族精英战力了。在天道的算计下，巫妖两族边战边走，战场逐渐转移到不周山下，巫妖双方虽是做做表面文章，但是打着打着，众人逐渐被大劫煞气影响，都打出了真火，演变成生死大战，到处是残肢断臂，自爆声不绝于耳，突然两个夸父族的巫人显出巨人真身，大吼一声，高喊为夸父大巫报仇，齐齐冲向妖族阵营，妖族中一穿山甲化形的老妖随即显出本体迎了上去，双方二对一，结果可想而知，只见穿山甲被两巫撞得倒飞而回，直朝着不周山撞去，两巫也由于惯性，无法止住身形，只听咔嚓一声，天柱不周山被三人拦腰撞断，天斜西北地陷东南，天河之水滚滚而来，霎时间无数生灵死于非命，三清、女娲、西方二圣忙各施法力，护住生灵，阻止天塌地陷。只见女娲说道：“吾有五色精石，可做补天之用，只是熔炼神石尚缺一物。”说话间将目光看向天外。只见天外飞来一鼎，女娲顿时拜谢，也不矫情，接过乾坤鼎，当即开始熔炼神石。乾坤鼎返本还源，无物不熔，不一会儿便将神石熔炼成液体状。女娲看着散发着五彩霞光的液体，皱眉从中挑出一块废石，随手将其丢向东方。准提看着顽石落下的地方，像是算到了什么，脸上浮现出一丝笑容。而这顽石和废石却是让后世多了一段传说。五色神石熔炼完成。圣人出手。不一会儿便将天补好了。天上出现五彩霞光，后世传闻，那有霞光的地方便是女娲补天之处。女娲说道：“天虽补好，却不稳定。天柱之事如何解决？”老子言道：“此事还需女娲师妹到北海一行，北海有玄龟，开天便生，却不明天道，难以化形，其四肢可为撑天四极。”心思单纯的女娲却是不知，这是老子在算计她，消减她的补天功德，只见女娲道：“有劳诸位，本尊这就去北海。”言毕，女娲往北海而去，其余诸圣看向老子的眼神，多了一丝莫名，老子也不在意，只道此为平衡而已，诸圣自然乐的轻松，也没人自讨没趣，抓着不放。须臾，女娲带着玄龟的四肢返回，运用大法力，将其祭炼，分别放在天地四极，至此，天地终于稳定下来，只见大片功德从天而降，女娲得四分，乾坤鼎得一分，其余五圣各得一分，老子等人暗自纳闷，为何女娲得到如此多的功德，杀了玄龟，不是会降低其功德吗？只见女娲挥手一道乌光打入六道轮回，众人才恍然，暗道天道至公，原来女娲见杀了玄龟，于心不忍，于是将玄龟元神送入轮回，助其超脱，玄龟本就无法化形，如今转世，确是谋得了一线生机。
诸事已毕，乾坤鼎飞走了，众圣人看着残存的巫妖两族，都是无奈，事情偏离的太厉害了，于是老子选了一头老牛，原始向来看不起巫妖，什么也没选，倒是通天得了一尊青牛座骑，并数百小妖，女娲自领一众自愿跟随的妖族离去，余下的妖族被西方渡化了一些，巫族众人竟然无人收录，只见，众圣离去，巫族中走出一个牛角巫人，厉声道：“我等使命已完，当听从祖巫安排往南而去，同人族混合生存，以待来日。”众人于是在此人带领下，往人族行去，此人便是后来的魔神蚩尤，而这一部分巫族和人族通婚，早就了以后的九黎部落。自此巫妖双双退出洪荒舞台。
百年之后，巫妖两族分别迁入逍遥子开辟的妖界和魔界，两界出入口均在方丈岛上，变相的，两族成了鸿蒙教的势力，两族虽不是鸿蒙教弟子，但受鸿蒙教庇护，同时效忠鸿蒙教，可以说是鸿蒙教的私军，当然后来两族多有族人拜入鸿蒙教，此话暂且不提，鸿蒙教一时声名更胜。巫妖战罢归鸿蒙，妖魔两界自此生。
