“兰——”一个带着发箍的短发女孩跑过来，手搭着一个长发女孩说：“明天就是二月十四号了，情人节啊情人节！刚刚阿真打电话我说买了一对情侣杯呢，一个是我的一个是他的。”满脸洋溢着幸福。她是铃木园子，帝丹高中的学生，二年级B班的学生17岁。她口里的阿真是京极真，她所谓的男友。
旁边的长发女孩说：“诶！京极对你真好啊！”她是毛利兰，是园子的好友兼同学，当然也是帝丹高中的学生，二年级B班，17岁。
听到这句话，园子戏谑的说：“不知道我家的新一什么时候才能送礼物我呢！”小兰的脸颊微微泛红：“园子——”园子口中的新一是指工藤新一，一位有名的高中生侦探，和小兰是青梅竹马，两人已经表白过了。
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一个看似7岁戴眼镜的少年，和一个茶发少女在这一群小学生们中显得格外成熟，茶发少女若有所思，似乎走了很久才开口：“最近……”戴眼镜的少年不等那个少女说完：“是他们……对吧，你感受到了？”茶发少女的声音冷静成熟，但语气里有一丝丝的恐惧：“你是怎么知道的……”少年的眼睛盯一辆车子的，茶发少女一惊，眼睛里流露出害怕的神情，她迅速躲到少年身后，不停的颤抖着。戴眼镜的少年是江户川柯南，他就是工藤新一，在罗碧加游乐园中，工藤新一目睹了一场交易，由于他只顾着看交易忽略的身后那群黑衣人的同伙，那个同伙喂他吃了一种药，名为APTX-4869，等他醒来时他的身体缩小了，暂住青梅竹马毛利兰家，因为毛利小五郎是个侦探，这样也方便调查那群黑衣组织，化名为江户川柯南。
茶发少女名为灰原哀，她的原名是宫野志保，本来是把工藤新一变小的组织中的一员，代号Sherry由于姐姐宫野明美被杀害，她开始反抗组织，本来想吃掉自己开发的药，也就是APTX-4869自杀，没想到也同样变小了，暂住阿笠博士家，原因就是……她逃出来时被博士“捡”到了。化名灰原哀。
“绝对没错的，你感受到的那种气息和现在的黑色保时捷356A就说明他绝对在这附近。”柯南很严肃的说。“什么什么，什么宝石356A？宝石还分型号吗？”一个胖乎乎的男孩说。“元太君，不是宝石356A，应该是保时捷356A，看，就是那辆车吧，现在还有这样的车真是太罕见了。”说完朝那辆车跑了过去，一个短发带着发箍又有点萝莉的女孩和那个叫元太的男孩说：“光彦，等等我们”说完也追了上去，柯南和哀的第一反应是：赶快阻止他们。同声喊到：“快回来！！！！！”可惜他们听不到，柯南和哀只好追过去，刚过去，就看见琴酒和伏特加过来，灰原立马躲到柯南身后，柯南一直看着琴酒和伏特加，琴酒一把提前元太甩在地上（甩的老远啦……起码有3米）：“真是的，哪来的小孩？”当光彦和步美都被甩到那时，柯南护紧了哀，柯南被提起，甩到光彦他们那里时，小声的说：“遭了……”，当灰原被拧起时，琴酒大惊：Sherry……怎么会有和Sherry长得这么像的人，哦不……等等，等等，刚刚这女孩好像一直躲着我，还有Sherry从那个牢房逃走时那个通风口好像是开的，难不成她……琴酒并没有把哀甩到他们那里，只是放下她，用一种狡黠的眼神看着她，然后上车了.元太他们跑过来，首先感到不满的就是元太：“灰原，凭什么没有甩你。”光彦：“看来别人是看灰原长的漂亮才没有甩她。”步美：“小哀你好幸运啊！”柯南：“不，这并不是幸运，反而是……有大麻烦了。”哀大吼：“你们知道刚才有多危险吗？”元太光彦步美都低下了头。哀对柯南说：“工藤，你刚才那句话是什么意思。”柯南用手托着下巴：“看来，我们的身份瞒不住了……”哀点点头：“工藤，解药我今天就可以研制好，一定要在关键时候吃。”柯南：“嗯，我知道了。”光彦惊奇的说：“诶！？刚刚灰原喊柯南工藤耶！还有柯南也没有反对，还说什么真实身份，你们到底是……”
柯南突然发现自己当着他们的面说了不该说的话，立马反应过来：“因为我和新一哥哥是远方亲戚，所以我还有一个姓也是工藤，灰原刚刚就喊了。我们的身份指的是我们少年侦探团又被他们刚刚那群人发现了，恐怕很危险。”光彦虽然有些不相信，但一时半会也想不出什么，所以就相信了。
————————我是华丽丽的分割线————场景切换：博士家
“那这么说你们岂不是很危险。”一个白发苍苍的老人开口道.他就是阿笠博士。柯南沉思了一会：“看来我们只能退学了。”灰原哀：“退学应该不用吧……”柯南：“你想啊，我们被GIN发现了身份，那群孩子那时也和我们在一起，GIN很有可能会对那群孩子下手，不退学是不可能的”灰原从抽题里拿出两颗药，这两颗药是绿白相间的，灰原严肃的说：“工藤，这是APTX-4869的完整改良版，我说过的，不到关键时刻是不可以吃的。”柯南点点头，离开了。殊不知，灰原哀身上有一个亮闪闪的东西。
————————————我是华丽丽的分割线——————第二天
灰原准备背书包上学，刚出门，就停住了脚步，反而往屋内跑。转身后，哀感觉身后有一股冷嗖嗖的气息，隔着空气，传来阴冷的声音：“Sherry，你打算去哪？”哀胆怯的转过身：“Gin……”她被GIN迷昏带走了。
——————————我是华丽丽的分割线——————帝丹小学
“灰原今天没来上学？是不是病了”元太问柯南，柯南摇摇头『灰原是不会生病的，除非……』迟疑一下，柯南急忙说：“元太，帮我找老师请个假。”说完拿起书包跑出去了，校门口，一辆保时捷356A停在门口，柯南看着靠在车上的琴酒，琴酒也同样注意到了柯南，一把提起他：“工藤新一，不，应该是江户川柯南，没想到你居然变小了，本来我都不记得你了，直到昨天你护着Sherry，我才知道你可能知道我们组织，所以想起来Sherry吃了APTX4869变小了并且昨天我在Sherry身上安装了窃听器，发现她叫你工藤，然后查看了APTX4869的死亡名单中有一位叫工藤新一的人，然后查了你的资料就可以确定了，没有除掉你是我的失误，你应该掌握了许多组织里的东西吧，我带你去Boss那会怎样呢？”
柯南对琴酒打晕带走了，当他醒来时他已经在一个废弃的工厂里，他用手扶了扶额，旁边空无一人，哒哒哒——清脆的脚步声城旁边传来。柯南大喊：“琴酒你快放了灰原。”琴酒狡诈一笑：“别急嘛，大侦探，还有一位小姐。”柯南一时间脑袋空白，什么也想不出来，突然说：“难道是小兰？”琴酒拍拍手说：“不愧是大侦探，看来boss的决定是对的。”这时小兰清醒了过来，由于嘴巴被胶带封住，只能发出一声声呜呜的声音，柯南听到了小兰的声音，手中不经捏起了拳头：“琴酒里要我做什么才能放了兰和灰原？”“你跟我们走。”琴酒狡诈一笑。“不可以工藤，琴酒你放他们走，我跟你走。”柯南身后传来一个女孩的声音，她是灰原哀。琴酒：“雪莉你对我们已经没有利用的价值了。既然大侦探你这么不想跟我们走，那么我只好杀了和你有关系的人。”柯南的手握紧拳头：“我跟你走。”琴酒笑的很猖狂：“伏特加放了雪莉，和这位大侦探所在乎的小姐。”伏特加走上前，把灰原哀和小兰身上的绳子解开，小兰一把拿下嘴里的胶带，伏特加跟着琴酒坐上保时捷365a，小兰回灰原哀目送着保时捷开的无影无踪。小兰意识到不对劲：“柯南和那些人到底是什么关系？还有，为什么我是柯南最重要的人。”灰原哀叹了口气把组织的，无恶不作告诉了小兰并且告诉了她新一变小的经过。，小兰在那里伤心的哭，灰原在那里劝她，突然小兰一把抓住了灰原，问：“告诉我，有什么办法可以消灭这个组织。警察，当刑警可以吗？”灰原哀告诉她：“这个组织警察都调查不到的，如果你真的想消灭组织的话，在日本就只有fbi了。”小兰相信工藤新一一定会回来的，等工藤新一回来就一起加入fbi，可是事实结果并不是这样……
