由于航天器损坏严重，返回地球坠入海洋后已经报废，所以先觉者集团不得不在与神秘人协商后对其支付1.5亿美金作为赔偿。不巧的是，因为事情败露，神秘人尚未拿到这笔巨额赔偿金便被美国国土安全局以泄露国家机密和私自挪用国家资产的罪名逮捕了，最终，该神秘人被国土安全局送上了军事法庭接受审判，直到他被关进美国最孤独最黑暗的关塔那摩监狱后事情才告一段落。
虽然航天器报废了，但黑匣子好歹是被完整地保留了下来。除此之外，被运回的航天器废墟被送往科研一部进行研究。期间，先觉者集团带着ATE-K智能化轻型坦克参加了国际军警武器装备展，并在展出后再次获得了伊朗军方的青睐，但由于ATE-K智能化轻型坦克的单价超出了伊朗军方的预算，所以伊朗军方虽然对其格外青睐，但却也只能望而却步。与此同时，ATE-K智能化轻型坦克所展现出来的优势也让阿根廷军方和阿联酋军方产生了极大的兴趣。最终，先觉者集团再次成为了拔得头筹的赢家——旗下的产品ATE-K智能化轻型坦克最终以580万美金的单价签下了阿根廷军方和阿联酋军方的总价值为20.3亿美金的大额订单。
满载而归后，科研一部传来了一个好消息——多转子变循环矢量发动机研制成功，已经正式进入了测试阶段！而多转子变循环双向矢量发动机也顺利通过了可研评估和一系列的技术认证，现在正由制造部负责制造第一台试验机。基于FE-Aa战斗机平台所改进和提升的机型也确定了最终方案，进入了样机的制造环节。
2004年8月，科研一部在航天器的残骸中意外发现了一枚直径约88.5厘米的天外矿石，该矿石被发现时，其内部似乎隐藏着某种未知的能量，其在丑陋的外表下不时向外散发出天蓝色的光芒。经科研一部检测发现，该矿石所包含的成分并非人类已知的任何一种元素。次月下旬，科研一部在经过一系列专项研究和检测后，成功地从该矿石中提取到大量的反物质能量。起初，伊莲娜并不为所动，因为她根本不知道这种级别的能量有什么可利用的价值。但布托并不这样想，因为就在这时，一个疯狂的想法早已在他心中萌生了。就布托的性格，他历来是一个敢想敢做的人，在提取出反物质能量以后，他暗地里组织人手成立了一个新能源研究小组，在他的带领下，这个研究小组在短短两个月的时间里成功地将该反物质能源实现了纯净化，并将其集中压缩后置于一个特制的能源储存容器中。由于反物质能量极不稳定的物理性质，布托自知若当下需要继续研究该反物质能量并将其转化成永久可持续的能源，就必须立即建立一套完整的能源监控、转化和储存系统，但就科研一部目前的资金状态，根本不足以支持这套系统的建立和运行。所以，他正式向董事长杨林伟提出了提案。布托本以为这样一个具有太多不确定性因素的提案会遭到无数的阻碍最终被回绝，但事实证明，他小看了杨林伟。在后来的日子里，布托渐渐的发现，原来这位年轻的董事长才当之无愧这个世界上独一无二的疯子！
提案被提出之时确实遭到了来自于科研部总负责人伊莲娜的抨击和反对，但在最后的投票阶段，杨林伟以董事长具有一票决定权的原则决定批复给了科研一部10亿美金的科研基金用于建立反物质能源的监控、转化与储存系统，并支持于其研究。半年后，一套完整的、总造价约6.8亿美金的反物质能源监控、转化与储存系统完美地呈现在众人眼前。在该系统经过测试与验收后，布托正式将储存的反物质能量移至该系统中进行储存。而后，科研一部耗费了一年多的时间进行了无数次的试验与验证，但最终都以失败告终。先前批复的研究资金也已经消耗殆尽，尽管布托并不甘心，但由于这项未完成的研究实在消耗了太多的人力、物力和财力，无奈之下，杨林伟只得将该项目叫停，并将所有相关的设施设备和相关资料封存起来。
期间，2004年10月底，多转子变循环矢量发动机已然顺利通过了所有的测试和调试，并最终以“先驱者4号”命名；而具备短距垂直起降的多转子变循环双向矢量发动机也已通过了测试，最终被命名为“先驱者5号”，并被正式列入先觉者集团首台科研验证机的行列中。与此同时，基于FE-Aa战斗机平台所改进和提升的机型也正式换装了“先驱者4号”发动机，在完成验证和定型后被正式命名为FE-XJ“鹰隼”多用途重型隐身战斗机，其综合作战性能评估值一跃达到了第五代战斗机的水平！但由于先觉者集团并未有将其作为部队常备战斗机或是将其作为外贸型战斗机出售的打算，所以，FE-XJ“鹰隼”多用途重型隐身战斗机最终被以先进教练机的身份列装于先觉者集团空天一位体作战指挥部下设的狮鹫空勤团、海军作战指挥部下设的海军舰队和全球联合作战指挥部下设的空中攻击大队中。其中，空天一位体作战指挥部下设的狮鹫空勤团共列装120架FE-XJ“鹰隼”；海军作战指挥部下设的海军舰队共列装96架FE-XJ“鹰隼”；全球联合作战指挥部下设的空中攻击大队共列装15架FE-XJ“鹰隼”。
2005年3月，先觉者集团制造部增加了80条生产线，其最终的生产能力较之前提升了165％。同年4月中旬，先觉者集团按照合同约定按时向阿根廷军方交付了150辆ATE-K智能化轻型坦克；提前了两个月向阿联酋军方交付了200辆ATE-K智能化轻型坦克，并意外收获阿联酋军方给予的约200万美金的奖励。同时，先觉者集团因此名声在外，但这也让先觉者集团一下子被顶到了风口浪尖上，一时间成了众矢之的。
2005年8月份，先觉者集团以自身强大的轻兵器改装技术和能力成功在世界轻兵器市场上占据了很大一部分市场份额，由此成为一大家。
2006年3月份，先觉者集团全球联合作战指挥部和海军作战指挥部先后列装了共82艘自主研发的中型导弹驱逐舰、中型导弹巡洋舰、重型护卫舰、柴电动力潜艇和综合补给舰，并初步形成战斗力。
