“咦，你们怎么在这，小兰姐姐我的哥哥怎么没有回来呢，不是说和你约会了吗？”工藤樱一假装什么都不知道的进入了书房，一下子就看见了在小兰身边的柯南，但樱一还是疑惑地问：“这个男孩是谁我怎么没有见过？你好我叫工藤樱一。”“他是我亲戚家的孩子，因为父母出车祸了所以在我家住，但我是个单身汉，不会照顾小孩，小兰就让他到你家住吧，樱一啊，你哥哥有大案子要处理你也去小兰家住，可以吗小兰？当然新一回来了你就向他要抚养费。”阿笠博士赶紧说。“那你叫什么呢？”小兰跪坐在地板上问变小的新一。变小的新一灵机一动（看了一眼书架上的书）说：“我叫江户川柯南。”小兰便把樱一和柯南（也就是变小的新一）带回了侦探事务所。
在事务所的门口，看见了正在要坐上出租车的毛利小五郎，柯南跟着上车小兰带着樱一也上了出租车，当小五郎回过神来，看见车子上多了的人，很是无语，并要他们下车可是已经到高速上了，只能吩咐他们不要打扰他工作。是有钱人家的孩子被绑架，柯南询问管家麻生：“当时情况怎么样？”“小鬼”毛利小五郎气急败坏的说，并敲了柯南的头。樱一看着这情况笑了出来，并到处看看。
柯南在玩球时发现了一只叫巨无霸的看家狗，了解了事情的大概。这时真正的歹徒打了电话，而京子小姐则说了句关于地点的提示——是能看到烟冲的学校。柯南立马就冲了出去，而樱一则跟在他的身后，当找到犯人时，柯南因身体变小而无法抓歹徒，还被歹徒打时樱一看到了却没有出手，但已经准备好要出手了只要歹徒伤到柯南性命就出手。眼看歹徒就要打到柯南的千钧一发之际，樱一出手了，她拿起石头用起内力，向歹徒的手丢了过去，打的歹徒的手上一痛歹徒手上的棍子就掉了，而这时小兰也来了，把歹徒打倒在地。毛利小五郎杉杉来迟他们是被那只巨无霸的狗给带来的。因为这件事樱一和柯南就被接受住在毛利小五郎的侦探事务所里。毛利小五郎觉得他们给他带来了工作。樱一和小兰住在一起，柯南和毛利小五郎住在一间。
第二天，毛利小五郎对着柯南问“小鬼，你上什么学校啊。”“阿笠博士会帮我转校的。我去阿笠博士那里了。”柯南说着便跑了出去。樱一联系了以前认识的一个大姐姐（她救过这个女的杀手）帮她买一幢别墅，并改装成她想要模样。柯南一整天都在阿笠博士家。樱一则在弄她的房子。傍晚樱一到了阿笠博士家，“阿笠博士，我哥哥呢？”樱一问道。“新一有案件要处理，还没有回来。”“大侦探就没有什么想问的吗？”樱一向柯南问道。
“当然有，你到底是谁。”柯南语气沉重的说。“她不就是你父母收养的女儿吗。”阿笠博士说道。
“还有呢，你的身份不简单吧。”“哎呀呀，我不就是你的妹妹吗？”“你的一切都有古怪，昨天那个歹徒要打我时，手中的棍子掉了，这是为什么呢。”“不就是没有拿好吗。”“怎么你一来棍子就没拿好呢。”
“谁知到...你看到我了。”“当然，看到了一个小孩的人影。”“我还真是不小心呢。新一哥哥（小兰的声音）。”“原来是你啊，那个在我昏迷时在我耳边用小兰的说话，你到底是谁。”“我是你的妹妹啊，工藤新一，不对现在应该叫江户川柯南才是。”“你果然知道。”“当然，因为我也是吃那种药变小的啊。”“什么”柯南惊奇的问道。“我知道你想问什么，我是工藤樱一，你的龙凤胎妹妹。当年失忆了到了组织，后恢复记忆为了逃离组织所以被喂下毒药APTX—4869那两个男的，胖的是伏加特，高的是GIN，你要小心他们。我的力气、速度比别人好是因为学习了一种奇怪的功法，但你不能学。还有什么要问的吗？”柯南惊呆了“我给你一点时间思考，我的身份是不能暴露的否则我们都要死，现在的我不是GIN的对手。不要告诉任何人我们的身份，知道的人都可能会死。阿笠博士我们走吧。”“奥，好。”阿笠博士关上了房门。柯南思考了很久，才从房间里出来。
“对了，哥我要出去一趟大概半个月，你自己要小心，别再莽撞行事了，别让小兰看出你的身份了，否则小兰会是组织要解决的目标。“看着柯南出来，樱一对柯南说着。
第二天，有人来到阿笠博士门前接走了工藤樱一。小兰来接柯南时看见了问柯南是怎么会是，柯南回答:“她以前父母的朋友接她去别的地方小住。已经和学校请过假了。“
