混沌初开，盘古身死化为世界。之后盘古涅槃，元神分化三清，为太清道德天尊、玉清元始天尊、上清灵宝天尊；身体血脉化为十二祖巫。十二祖巫外界称为“十二魔神”，天生肉身强横无匹，吞噬天地，操纵风水雷电，填山移海、改天换地。当十二巫祖聚集催动十二都天神魔大阵之时可凝聚出盘古真身，开天辟地，毁天灭地，圣人之下鲜有其匹。
十二巫祖其一状如黄囊，赤如丹火，六足四翼，浑敦无面目，是为帝江；其二青若翠竹，鸟身人面，足乘两龙，是为句芒；其三人面虎身，身披金鳞，胛生双翼，左耳穿蛇，足乘两龙，是为蓐收；其四蟒头人身，身披黑鳞，脚踏黑龙，手缠青蟒，是为共工；其五兽头人身，身披红鳞，耳穿火蛇，脚踏火龙，是为祝融；其六八首人面，虎身十尾，是为天吴；其七嘴里衔蛇，手中握蛇。虎头人身，四蹄足，长手肘，是为强良；其八人面鸟身，耳挂青蛇，手拿红蛇，是为翕兹；其九人面蛇身，全身赤红，是为烛九阴；其十人面兽身，双耳似犬，耳挂青蛇，是为奢比尸；其十一人身蛇尾，背后七手，胸前双手，双手握腾蛇，是为后土；其十二乃一狰狞巨兽，全身生有骨刺，是为玄冥。
十二巫祖共创巫族，以改天换地之神力大破小千世界和中千世界，直捣大千世界；此时，诸天神邸从大千世界杀出，率领无数天兵天将与巫族死战，血流漂杵，生灵涂炭。诸天神邸皆受重伤垂死，以一缕残魂留下传承，燃烧灵魂将十二巫祖一一封印在小千世界。自此，巫族全灭，三界混乱，天音帝率领残兵共同修复三界，并将三界之间布下封印，将三界称为修真界、仙界和神界。大战结束，天音帝一统三界，将神邸的传人命名为“天行者”，天行者现，则三界大战。数千年来，无一天行者现世，天行者也变得更加神秘，渐渐消失在历史长河中……
时已至此，三界之战恰好过去万年，一颗死星从天而降，天地都为之变色，死星燃起熊熊黑焰，激起雷音滚滚，浊浪滔天，狂风怒号，山崩地裂，直接坠落至小千世界一处深渊之中，深渊方圆万丈，生机全无，险象环生。正当死星坠落之日，一片黑气从天际飘来，笼罩在深渊之上，引来千万雷劫，死星经历万千雷劫，千疮百孔，轰然炸裂，化作一人型，身怀至邪之气与上古邪兵，不死不灭。
三界再次陷入慌乱，天音帝破碎虚空，来到深渊之中，与邪气鏖战，无奈邪气诡异无常，又身携邪兵，天音帝陷入苦战。正当此时，一柄黄金圣剑从天而降，空间扭曲，将邪气镇压，一举斩碎邪气，不料邪气一分化九，成为九颗邪珠，身携邪兵逃出深渊。天音帝元气大损，手执圣剑，以神道大能将深渊封印，奔赴神界疗伤，并遣神将下界寻找天行者，聚集天行者，彻底消灭邪气。
三界大乱，一场大战，拉开帷幕……
