三人离开了浅红道馆，继续出发。当天，他们就来到了野生神奇宝贝保护区，这里是一望无际的大平原，而且，有很多野生神奇宝贝，个个健壮的不得了。小智现在可不笨，他没有打算收服这里的神奇宝贝。不过，那个叫富子的女孩依旧出现了。
“你们好！欢迎来到野生神奇宝贝保护区！”富子骑在小火马上说道。“如此发展下去，五年后肯定是个大美女~~”小刚脸红着说，一脸痴迷的望着。
“呃~~他就是这样，请别介意……”小智尴尬的一笑，而小霞早就揪住了小刚的耳朵，看来，小霞跨越等级提前学会了这一招……
“没关系，要不要去我们镇上看一看呢？我们这里正在举行庆典哦！”富子微微笑着说道。“听起来很有趣啊……”小刚一脸向往的说道。接着富子将神奇宝贝赛跑一事告诉了小智三人。
“可惜我没有能跑的神奇宝贝！不然我一定拿冠军！”小智心有不甘。现在是晚上，在富子的带领下，四人一起逛起了夜市。本以为没有火箭队三人组（喵喵勉强凑一个好了）的捣乱，富子家的肯泰罗应该不会发生骚乱的，可没想到那个叫都利夫的仍然出现了：“喂~富子！你家照顾的那群肯泰罗情况有些不对劲啊！”都利夫出现，并且嚷嚷道。富子立刻回到家里，结果还是受伤了。
“可恶！火箭队又跟上来了吗！？”小智咬牙暗恨道。这时，富子将打算让小智代赛的想法说了出来，“就凭你刚才平息了小火马的不安，我就知道，你能够驾驭它……”富子说道。最终，小智代替富子出赛，而小智也很快找到了与小火马的默契。
第二天，比赛如期举行。在路过一个下坡时，火箭队登场了。但出现的是两拨人，一拨是亚马多一组，而另一拨居然是武藏一组，他们已经出狱了，不过是不是坂木保释的就不知道了。“可恶，难道他们都盯上我了！？”小智暗想道。但是就算是他们两拨人，也耐何不了小智，因为小智已经不是原来那个愣头青。而小智来到这个镇上后，已将交换了神奇宝贝，现在队伍是皮卡丘、比比鸟、妙蛙种子、两只伊布，小火马不算在列。伊布由于之前信任了小智，因此在大木研究所也是很认真的在训练。这时小智派出队伍中了最强的皮卡丘、比比鸟和妙蛙种子，顺利地将两拨人打飞，接着全速追赶都利夫。果然，快到终点时，小火马彻底爆发，进化成烈焰马，一举扭转劣势，反败为胜。
比赛结束后，三人带着好心情出发。过了有一个星期，他们终于到了野生原野区。小智可不想被凯撒拿着枪吼，于是就没有唱歌，不过他本来也就没想过要唱歌，因为原来的他就是个大音痴……
在原野区内，他们找到了管理员凯撒。“您好！我们是来收服神奇宝贝的！”小智在房间内说道。凯撒没有多说话，拿出了三套一模一样的宝贝球和一个钓竿，“我先跟你们讲清楚，在原野区内，只可以用原野区的宝贝球和钓竿，不遵守规矩的人，就别怪我雷霆兄弟伺候了！”“知道，放心好了！对了，可以用神奇宝贝对战收服吗？”小智一口答应，然后又问了一句。“可以！”凯撒说道。
三人离开了房间，“我们这次分开行动好了，到了傍晚，我们就在这里会和好了。”小智说道。“好主意，我们来公平竞争，到时候，看谁收服得多！”小刚说到。小霞也无异议的同意了，于是三人就分开行动了。
小智放出了妙蛙种子，很久没有见到主人的妙蛙种子出来后很亲昵地蹭了蹭小智的腿。前几天虽然出来训练时能见到小智，但却以训练为主，没能很好的呆在一起，现在有了机会，可不能放过。小智蹲下身来，摸了摸妙蛙种子的头，也觉得欠这几个元老级别的朋友很多，因此决定将这次换来的神奇宝贝多留一阵子。
他们继续前进，很快，小智发现了肯泰罗群，“对付这种头脑简单的家伙，大概直接扔就行了吧……”小智想到，于是就观察起来，终于，他找到了两头最壮，看起来最有前途的肯泰罗，于是扔出了宝贝球，果然，肯泰罗毫无悬念的被收服。接着，小智又想起了自己的代步工具。“嘟嘟利是最好的选择，耐力十足，爆发力十足，恩，就是它了！”小智又想了一下，开始寻找嘟嘟和嘟嘟利。很快，他发现并不是想找什么就来什么，于是他又开始物色其他神奇宝贝。他看到了一只豪力，那只豪力在不停的寻找什么，很快，它找到了一只铁甲犀牛，结果冲上去一顿爆揍，铁甲犀牛被打跑，接着，他又打跑了肯泰罗、尼多力诺、臭臭花等角色。“恩，大木博士说我的火爆猴老在后院捣乱，看来，应该给他找个对手了。”于是派妙蛙种子上场，“用藤鞭抓住它！”妙蛙种子立刻伸出藤鞭，将豪力绑住，接着，妙蛙种子的藤鞭上发出了绿光，接着，豪力痛苦的大叫起来，小智拿出图鉴后高兴的叫了起来：“太棒了！超级吸收（亿万吸收）！你真的变得很强了！”妙蛙种子听到小智夸奖自己，便又使出了另一招——叶暴风。关于这一招，是在一次和比比鸟的对练中被激发出来的，者应该是遗传下来的技能。这令小智兴奋不已，很快，豪力也被收服。
再说小霞这边，她派出了暴鲤龙和宝石海星。收服了大舌贝、尼多兰、皮皮、蚊香蝌蚪、小海狮和可拉可拉，基本上以潜力股和乖乖为主。而小刚，收服了穿山鼠、嘟嘟、小磁怪、喇叭芽和地鼠。
就在这时，小智走到了那个迷你龙和哈克龙所在的湖泊。这里的湖面很静，像一面镜子，偶尔微风吹过泛起一丝涟漪。“不知道火箭对他们会不会真的来捣乱……”小智心想道。这时，一只像蛇一样的神奇宝贝从湖面探出了脑袋，“是迷你龙！”小智惊喜的叫了起来，他立刻跑到湖边，迷你龙也好奇的望着眼前这个兴奋地男孩，不过似乎对小智没有什么戒心。
这时，火箭队登场了，而且，是两队人一起行动，不知为什么他们居然能走到一起。“可恶！比比鸟，用龙卷风；皮卡丘，打雷；妙蛙种子，叶暴风！”小智放出了比比鸟后，立刻命令道，三只神奇宝贝一起发力，亚玛多一组最先遭殃，被打飞，接着，武藏一组拿出了机器人。这时，小霞小刚赶到了，“怎么回事？小智！”小霞最先担心地问道。“他们打算抢夺迷你龙！”小智说道。小霞立刻派出暴鲤龙，而暴鲤龙抬头就是一记水炮；小刚也派出了大岩蛇，使出了龙吸，武藏这边的机器人被打碎了。“天呐！我们的预算就这样没了，喵~~！”喵喵包头痛哭起来，“可恶！我们好不容易造出来的机器你们就这样给我们毁了，太可恶了！”小次郎也怒吼道，“少废话，滚吧！皮卡丘，打雷！”小智最后说了一句话，火箭队被顺利的打飞。哈克龙似乎是被惊动，也从湖底钻了出来。迷你龙立刻迎上前去，‘ni~~ni~~‘地叫了两声，接着，哈克龙感激的望着小智三人。
这时，凯撒先生跑了过来，他是听到爆炸声后赶过来的。他看到了哈克龙。
“你、你是……你是那只迷你龙！？”凯撒激动地叫道，哈克龙慢慢游到凯撒身边，眼里满是泪光……
小智三人没有打扰这美好的时刻，悄悄离开了。去继续收服自己的神奇宝贝。小智一出来，便发现了自己的目标——嘟嘟。虽然没有进化，但是看得出来，很好斗，而且发育的还不错。小智立刻派出了比比鸟，虽然那只嘟嘟发育不错，但比起严格训练的比比鸟，还是差了一大截，再比比鸟连续的破空斩和最后一击龙卷风的攻击下被打败，接着被小智收服。随后，小智又收服了一直自行进化了的雷丘，这居然给皮卡丘带来了意想不到的动力。经过了一阵子后，小智又收服了派拉斯、尼多朗、海刺龙、大葱鸭和百变怪。所有人都没有用完自己的球，只用了很少一部分。
很快，天色暗了下来，所有人都回到了管理区的屋子。“今天太晚了，你们就留下来吧！”凯撒先生和哈克龙相会后，心情似乎变得很好，居然招待三人住下来。“那我们就不客气咯！”小智笑着说道。
接着，三人整理了一下神奇宝贝，小霞的神奇宝贝是海星星、暴鲤龙、小海狮、大舌贝、走路草和蚊香蝌蚪；小刚的神奇宝贝是大岩蛇、小拳石、嘟嘟、超音蝠、小磁怪和六尾；小智的神奇宝贝是皮卡丘、比比鸟、妙蛙种子、两只伊布、雷丘、嘟嘟、海刺龙和百变怪。为什么是九只呢？因为在交换之前，大木博士和小智还有一番对话。
“小智啊！你可是立了大功啦！”“怎么了？”“还跟我装！你捣毁了火箭队的秘密基地，这不是大功一件吗？”“哦……那又怎样？”“怎样！联盟通过会议决定嘉奖你，让我转告你，你可以提三个要求，可以要东西，要神奇宝贝，或者拜托他们帮你做点什么事。只要不过分，都可以满足你。怎么样，是不是很惊喜！”大木博士说完后淡淡的吸了一口茶。“真的吗？太棒了！”小智差点儿在对讲机面前跳起来，过了一会儿，小智说道：“想好了，我要一整套的进化工具；一整套宝贝球，双份的；还有就是想要一块神奥地区的头盖龙化石，没问题吧？”“恩，的确不过分，不过我很好奇你是怎么知道头盖龙的，这个东西可是神奥地区的特产啊！”“哎呀，这您就甭管了嘛！给我就是了啊！我还等着在红莲岛复活它呢！”“好吧，那这些东西就全帮你送到红莲岛好了，你到了那边，就到神奇宝贝中心接收吧。”“没问题，谢谢了博士！”“不客气，还有别的事吗？”“恩……我想把我的神奇宝贝携带上限调到九只行不行啊？”“九只？你确定能同时训练这么多？”大木博士一脸惊讶和疑惑。“当然能！相信我吧！”“好吧，等着。”很快，大木博士离开，又很快回来，“已近搞定，没事我就先挂了，拜拜~~”接着，通话结束。
收服了这么多神奇宝贝后，又得到了联盟的嘉奖，小智开始盘算着怎么分配这些东西，“跟水有关的宝贝球给小霞，超重球给小刚，王者信物就用来进化河马王……”
