飞夜目送宇智波鼬远去后，便离开了水塘。飞夜漫无目的的走在街上，不知不觉间来到了浴室街。飞夜忽然看到自来也正在那偷窥。飞夜无奈瞬身到自来也的身旁拍了拍他：“哟，自来也。很清闲嘛你。”
自来也收起望远镜说：“啊，原来是你啊。听说是你救下了三代，击败了大蛇丸。真是后生可畏啊。”
飞夜挠了挠头有些不好意思的说：“呐，其实是三代打败的大蛇丸，我只不过是协助而已。噢对了，三代现在的情况怎么样了？”
自来也听到飞夜问神情有些低落，说：“三代的情况不太好。双腿细胞死亡，现在还处于昏迷之中。他已经无法再战斗了。长老已经命令我寻回纲手来继任五代火影。我走时会带上鸣人，因为根据我的情报有一个名为晓的组织正在抓捕尾兽人柱力，所以鸣人跟在我身边才比较安全。我走后村子中的影级强者就只剩下你了，你要多加注意。”
飞夜听到自来也的话，说：“如果说晓的话我已经见过了。就在刚才木叶叛忍宇智波鼬和雾隐叛忍千沛鬼鲛来过木叶。我跟宇智波鼬交过手，他的实力很强估计比我还要强一些。你以后遇到他们时要小心。”
“啊，我会的。你去找鸣人吧，你们会有一段时间无法见面。”自来也掏出望远镜又开始了他的取材大业。
飞夜拜别自来也后，在一乐拉面找到了鸣人。飞夜走进一乐拉面大喊：“老板一碗大碗拉面！”
“好嘞。”
鸣人正在吃拉面，听到这声音有些熟悉回头一看：“飞夜大哥！”
飞夜坐在鸣人一边，说：“鸣人，我一猜你就在这里。嗯，你在中忍考试中的表现很好，我非常满意，那么作为对你的奖励，今天拉面钱我来付。”
“好耶！万岁！飞夜大哥，你不知道，中忍考试时本来我想找卡卡西老师帮我修行，可是卡卡西老师眼中就只有佐助那个家伙，卡卡西老师就给我找了一个大色狼来教我修行。你猜怎么招，那个大色狼带着我在浴室街修行时，竟然发现了好色仙人在偷窥女浴室！好色仙人轻而易举的将大色狼打倒在地。我没了老师辅导修行我就缠着好色仙人帮我修行。最后好色仙人就教了我一个非常厉害的招式，等会儿我给你展示一下。”鸣人一边吃面一边兴奋的对飞夜说着他遇见自来也的情形。
飞夜看着兴奋的鸣人心想：只有自来也这样的家伙才能教好像鸣人这样的学生吧。
夜晚，飞夜将鸣人送回家，看着鸣人熟睡后才从鸣人家屋顶走开。飞夜在对面的楼顶看到了自来也。自来也见飞夜走了过来说：“飞夜，这些年都是你照顾鸣人，也辛苦了。鸣人是四代火影的儿子。我看到鸣人就像看到我的孙子一样。谢谢你对鸣人的照顾。”
飞夜听到自来也的感谢，有些惆怅的说：“当年要不是四代火影或许我已经死在了九尾手里，就算不死我也会浑浑噩噩的活过一生直到死去。是四代火影让我知道了活在这个世界的意义。现在木叶就像我的家，木叶的每一个人都是我的家人。所以不用感谢我照顾鸣人，因为那是我应该做的。”
自来也听到飞夜的话调笑的说：“呵呵，你和三代一个德行，都以守护木叶，木叶有你这样的人我很安心。呐，明天我就带着鸣人去找纲手，木叶的安全就交给你了。”
“嗯，希望你早些找到纲手大人，木叶还有好些重伤员需要纲手大人的治疗。”飞夜凝重的说。
“嗯，那么再见。”自来也说着瞬身消失。
没过几天，自来也便带着鸣人踏上了寻找纲手的道路。在这中间宇智波鼬带着千沛鬼鲛袭击了鸣人，不过被自来也击退。在这期间，佐助遇见了宇智波鼬，被鼬又施展了一次月渎。佐助被阿凯带回了医院一直昏迷。期间飞夜多次去看望佐助，发现小樱一直守护在佐助的病房里。飞夜见此暗暗摇头：佐助注定会走与别人不同的道路，小樱这样痴情，恐怕要受些苦了。
过了好几天，飞夜一直无所事事的在家中休息，顺便操练一下君麻吕三人。这天飞夜忽然得到消息，三代的病情忽然转坏。飞夜跑到医院看到三代的情况，知道如果纲手在不尽快回来，三代估计就要死去。飞夜决定亲自出马寻找纲手。这时，炎顾问和小春顾问找到了飞夜，问：“飞夜，你要到哪去？”
飞夜摊开手说：“我要出村去找纲手，怎么有什么问题吗？”
小春顾问说：“现在木叶实力受到巨创已经到了木叶建村以来的最低。你现在是村子里唯一的影级强者，这个时候你应该呆在村子里以防万一。而且寻找纲手已经有自来也去做了。”
飞夜听到这非常气愤的说：“现在三代的情况不好，如果不快点找回纲手，那就糟了。我决定了，谁也别想拦我！”说着飞夜通灵出穿云鸟头也不回的跳上鸟背直冲云霄。飞夜一路狂飞，几乎不停歇。飞夜知道纲手会在短册街出现，飞夜打听到地方之后就一停不停的赶到了短册街。这时，飞夜在高空中看到三头巨大的通灵兽被召唤出来。飞夜知道自己还是赶上了。飞夜控制着穿云鸟俯冲而下飞夜在空中结印“通灵术巨熊！”飞夜通灵出的巨熊直接站在了三忍之间。飞夜站在巨熊的头上冷冷的看着大蛇丸。
纲手看到飞夜从天而降大吃一惊问：“什么人？”
自来也这时还没有从纲手下的药中恢复过来，见飞夜从天而降大舒一口气。自来也给纲手说：“这时木叶刚出现的天才忍者旗木飞夜，自己人。”
飞夜打开写轮眼看着大蛇丸说：“大蛇丸，你的一切行动都在这双眼睛的注视之下。今天我就在这里彻底解决你这个木叶的大患。”
大蛇丸看着飞夜的眼睛流露出一丝贪婪。大蛇丸知道现在的自己已经不是飞夜的对手，就更加渴望得到佐助。大蛇丸没有理会飞夜的威胁对纲手说：“纲手，你难道真的不想让你的恋人，你的弟弟复活了吗？”
纲手听到这里对大蛇丸说：“大蛇丸，我不会再相信你的鬼话了。我已经决定回到木叶担任第五代火影！你走吧，以后我再见到你就不会手下留情了。”
大蛇丸见无法说动纲手，而眼前又有飞夜的威胁，于是大蛇丸便光棍的消失了。
飞夜见大蛇丸走了也暗暗松了一口气。自己在中忍考试的几天里连续击杀团藏，击退大蛇丸这两场激烈的战斗，身体已经极度疲惫。如果再和大蛇丸打上一场，估计不用大蛇丸来解决掉自己，光累就能累死自己。飞夜不顾自己连日来飞奔的疲劳，走到自来也和纲手的身边说：“两位我们快点启程回木叶吧。”
自来也看着飞夜的急躁有些不解，问：“为什么这么急，木叶又发生了什么吗？”
飞夜解释说：“三代的状况不太好，我来的时候已经生命垂危，所以纲手大人必须马上回去。这也是我来的目的。纲手大人我们立刻起程吧。”
纲手看着自己怀里仍然昏迷的鸣人答应了。
飞夜立刻通灵出一只较大的穿云鸟将纲手四人带上立刻朝木叶飞去。
回到木叶经过纲手的治疗，三代也醒了过来。木叶医院中的各个重伤员的情况也得到了改善。纲手忙完这些，便准备就任五代火影的职务。飞夜带领团藏遗留的根部成员全部效忠了纲手。
飞夜将根部的事情解决之后，就到医院看佐助。佐助经过纲手的治疗已经从昏迷中醒了过来。飞夜走进病房发现小樱也在，说：“小樱，你先去看看小李吧，我有些话要单独对佐助说。”
小樱看到飞夜严肃的表情虽然不太情愿但是勉强同意了。
飞夜走到佐助的面前，看着佐助说：“佐助，我有些事情要和你说。”
佐助看这飞夜没有理会飞夜的话而是直接问：“你为什么会有写轮眼？”
飞夜看出佐助眼中的怨恨，说：“这件事和我要和你说的事情有些关联。佐助，你真的以为宇智波家族是你的哥哥宇智波鼬灭掉的？”
佐助听到飞夜的疑问对着挡飞夜大吼：“当然是他！那是我亲眼看到的！”
飞夜没有说话，等到佐助平静下来才继续说：“看到的并不一定是真的。而且你所说的亲眼看到只不过是在鼬的幻术里看到的。鼬所作的这一切全部是为了你，宇智波佐助！佐助，现在的我已经拥有万花筒写轮眼很多年了，然而就是我这达到影级的实力想要将木叶任何一个家族灭族而不被其他人发觉也是不可能的。而当年宇智波家族灭族是鼬才刚刚得到万花筒写轮眼，你认为就凭鼬那时的实力能够将宇智波家族灭族？其实鼬背负灭族的罪名叛出木叶都是为了保护你。当时真正将宇智波家族灭族不是别人就是宇智波家族的创始人宇智波斑！”
佐助听到这里完全惊呆了。飞夜的一番话完全将自己几年来活着的动力给抹去了！
