木叶29年，第二次忍者大战爆发，导火线不明。以云忍、岩忍为首的同盟发动战争，对木叶、涡之国的同盟国发起冲击。正在壮年的木叶第三代火影迎战。
以三代目的弟子自来也为首的队伍迎战岩忍村的忍者，同时拉开战线，尽量不在木叶本土进行战争，进而可以防止周边的砂之国的突然参战。
以旗木塑茂、大蛇丸、纲手为首的大军，集聚最强兵力抵抗云忍的部队。三代火影知道，以岩忍村的三代土影性格他是绝对不会刚开始就将村子的最为强大的力量来联合云忍，进攻木叶。同时也是土影这中唯利是图的性格，才避免木叶以一国的力量抵抗几乎除自己以外的所有忍者。这也让三代火影避免了最尴尬的场景，不然木叶直接投降算了。
所以木叶目前最主要的敌人是云忍，但是也必须防止雾忍，砂忍的偷袭。第一次忍者大战的开始，随着二代火影的病故，木叶依靠村内大家族的力量艰难的胜利，同时也使得其他村子不敢再随意的发动战争。
木叶31年，经过一年多的战争，各个国家也开始投入越来越多的忍者部队。同年，以自来也为首的第七小队炸毁岩忍在神无昆桥的基地，以及后来支援的部队全歼岩忍所有基地成员，是的岩忍的补给断了。随即岩忍被迫收缩战线，即以雨之国为中心的主战场靠近。
慕枫所在的第七小队本来只是想这摧毁一座分基地而已，却误打误撞的解决了岩忍最为重要的战略基地，切断了岩忍的补给。木叶有了喘气的机会。
此时慕枫正在毫无形象的做在地上大声的呼吸，同样在周围的还有数十个和慕枫一样的忍者。自来也也在这些人当中。
自来也看着这些人叹了口气，“没有想到啊，这个小小基地竟然有那么多的忍者”慕枫深以为然的点点头，本来以为这只是岩忍的普通基地，可是在打的时候才发现，岩忍几乎是以这作为主基地的打算啊！虽然将岩忍全部歼灭，但木叶支援来的10个小队也只是剩下4个而已。这可是敌在明我在暗的情况啊。
慕枫想起不久前4人在基地周围安置起爆符的时候，真是够侥幸的，早知道那么多忍者，谁敢做这么疯狂的事情。确定敌方全灭的时候，慕枫双手不停的颤抖，双脚也不知觉的软了下来。看着一个个岩忍的死亡，以及不久前还和自己一块的队友的尸体，慕枫闭上了眼睛。
自来也做到慕枫的身边：“慕枫，你知道吗，我第一次杀人的时候我吐了，但我却不得不杀，因为战场上不是你死就是我亡，没有第三个结果”。慕枫知道战场上的生命本身是没有什么价值可说的，但慕枫还是见不得生命的消失。
看着自来也，慕枫轻轻的说着“大哥，你说战争什么时候会结束呢？”
自来也摇摇头“我一直在寻找和平的方法，仙人说我会遇到命运之子，他会给忍者世界带来重大变革”。接着拿出一本书“我这些年一直想写一本书，知道现在却无法写下一个字，我不知道什么时候可以结束战争，也不知道什么时候才会遇到仙人说的那个命运之子。”
慕枫接过自来也还没有开始的书“这书的主人公叫鸣人吗？”
自来也听见这名字说“不，这本书还没有主人公”，随即想想说“鸣人？坚强，永不放弃？嗯不错，这书的主人公就叫鸣人了”
（鸣人这词在日文里应该就是这意思吧）
慕枫错愕了，苦笑了一下，原来鸣人这名字还是自己想到的呢。
慕枫想了会说：“是不是只要还存在忍者这种体制，只要这世上还有利益、欲望，人与人之间，国与国的关系永远都不可能缓解，不是吗。”
自来也看着慕枫说“我相信人与人之间能相互理解的时代定会来临，我永远都不会怀疑。”慕枫没有回答，就算在前世，看似和平的背后也存在着许许多多的局部战争，只是利益不够，一些超级大国不会轻易让战争扩大罢了。
“嗯，自来也大哥我相信你可以写出一本好书的。”慕枫没有说他相信世界会和平。
自来也也听出慕枫话里的意思，没有说什么，拍拍慕枫的肩。转过头对众人说到“这场战役，我们取得巨大的成功。相信岩忍暂时不会有大动作，现在我们开始向主战场靠近。”木叶33年，因为神无昆桥战役的胜利，木叶第一次取得了战场的主动权。随着自来也进入主战场木叶的优势有着明显的扩大，双方开始陷入的焦灼的状态。如果没有哪一方显出明显的优势，站在必定会一直持续，并且没玩没了，直到双方没有一兵一卒。
云忍自然不想看到这样的场面持续下去，所以第三代雷影找到砂之国的第三代风影商量着让沙忍参与到这长战斗中，沙忍以千代为首的主战派同意沙忍小规模的参与到战争中。
随着沙忍的参战，木叶不得不将战线拉开，分成两部分。此时的木叶，除了自来也，纲手，大蛇丸三人以外，木叶的旗木塑茂也开始渐渐扬名，有着木叶白牙的称号。三代火影知道沙忍参加战斗后立即派遣白牙以及大蛇丸前往西南战线，用以抵抗沙忍。
经过两年战场的历练，慕枫渐渐的成熟起来，实力离精英上忍的距离也只是经验不足而已，这两年的战斗，慕枫没有了最初的惶恐，给人们的感觉只是冷静。慕枫知道战场不知道会发生什么事情，感情是最奢侈的了，无论对敌人还是对己方的人。也只有在自来也面前，慕枫才会有11岁的样子。
这天，自来也拿着酒来到慕枫帐篷里。
“慕枫君，来来，不要冷静的和老头子一样，陪我喝点酒”。自来也拉着慕枫说道“认识你那么久都没有和我说过你的家人呢，和我说说。”
家人？慕枫除了刚进入战场那年，而后的时间几乎没有想过，不是不想，只是不敢，没有时间。因为慕枫不知道什么时候敌人会突然在你身边丢一张起爆符。
“我父亲在刚开战的那年就牺牲了，我母亲是个很温柔的女子，自来也大哥，我还有个脾气很暴躁的妹妹呢。”慕枫倒了一杯酒，慢慢的回忆，三年了。慕枫脸上慢慢浮现幸福的笑容，他仿佛看到母亲的微笑，玖辛奈奶声奶气的叫着哥哥。
自来也看着慕枫的笑容不禁有些落寞，随机自嘲的笑了笑。慕枫看着自来也说“大哥，以后慕枫的就是你的亲人，慕枫的亲人也是你的亲人。”自来也感动的点点头。
“自来也，给我出来”慕枫听见这语气，马上知道是纲手。自来也也开始苦笑起来，“纲手，你来的正好，刚想找你喝酒呢。”
纲手进来，看着自来也和慕枫说：“三代老师让我即刻回村，应该发生什么大事了。”
自来也收起笑容“知道什么事吗？那么急，我们一起回去。”
“不知道什么事，现在战事平稳，我们先回去一趟，慕枫你也一起”
慕枫点点头，心中却是想着“估计是千手绳树死了。”二代火影千手扉间死的时候正是第一次忍者大战爆发的时候，当时的三代还没有成长起来，木叶完全是靠着千手一族为主导的大家族来支撑，战争结束后，木叶的大家族，尤其是千手一族损失巨大。
三天之后，自来也纲手慕枫回到木叶。火影的办公室内。“老师发生什么事了？这么急着叫我回来”。纲手看着三代马上问道。
三代吸了口烟“纲手，让你回来是因为沙忍的傀儡上的毒使我们的忍者伤亡很大，另外绳树死了。”
纲手刚听完马上前往木叶医院，看见大蛇丸站在门口，立即问道“大蛇丸，绳树在哪里，说啊！”
大蛇丸很平静的拿出哪条一代的项链：“你不是已经知道了吗。”
慕枫和自来也刚到就看见纲手拿着一条项链微微的哭泣，自来也连忙的安慰。慕枫看着大蛇丸，看见大蛇丸脸上浮现的酸楚，心中也有些讶异。
第二天，因为千手绳树的死亡原因是重伤来不及有效的治疗。所以纲手在三代召开的会议上提出，每个队伍执行任务的时候应该提供一个医疗忍者。长老会以战事吃紧，以及医疗队伍会影响队伍的行动速度和撤退速度为理由否决了这一提议。
过了几天，慕枫、自来也两人随着补给队伍重新回到西北战线，而因为沙忍的傀儡大军的毒使得纲手去到西南战线。
