关东地区南部小镇真新镇，曾经被称为最强神奇宝贝训练家的大木博士晚年选择的归隐之所。
大木博士，本名大木雪成，有人称他为世界第一的神奇宝贝训练家，真实实力神鬼莫测。不过这一切都是过去式了，现在的他只是万人敬仰的神奇宝贝研究专家大木博士而已。
在大木雪成的年代，关东地区群雄并出，尤其是当时被誉为天才的菊子最为出众。而那时大木不过是个新人训练家，但是他靠着与神奇宝贝的羁绊一路走来，在第一届石英大会上力挫菊子夺冠，之后更是势不可挡，声明响彻全世界。
在大木之后的时代，虽然有天赋的训练家越来越多，却再也没有出现群雄争锋的局面。这个时代一直是渡的一枝独秀，因为这时的大木已经决定专心研究神奇宝贝所以渐渐淡出人们的视线。
而现在，在这个阴云笼罩的关东地区，一个全新的时代到来！
“终于完成了，神奇宝贝图鉴。这个可是跨时代的杰作啊！小智这家伙还真是慢啊，花子不是说他今天会回来吗？”
与此同时，真新镇的上空，一个黑影快速掠过。如果大木博士在的话一定会大吃一惊，芳缘地区水都的守护神拉帝欧斯居然会来到这里。
从拉帝欧斯背上跳下来一个少年，不用想了，他就是小智。
“啊啊！小白快变成气垫接住我啊！”
为了耍帅特意从半空中跳下来的小智这下作茧自缚了。不过他的腰间白光一闪，一只粉嫩嫩的百变怪登场。
小白深吸一口气，身体迅速膨胀成气垫。小智在重力加速度的作用下狠狠地摔在小白身上，随即又被弹起。
“雅蠛蝶！”小智惊叫一声，拉帝欧斯及时接住了他。
“谢谢你，拉帝欧斯。”
将小智安全送到地面上，拉帝欧斯咻的一下飞走了。
目送拉帝欧斯飞远再也看不到，小智才回过头来环顾四周，这个他母亲花子的本家真新镇。
“空气挺清新的呢，是个好地方！”
这时不远处传来争吵的声音，出于好奇的小智走向那边。
“神奇宝贝是人类的伙伴，它们怎么能被用来战斗！”
“小平你可真幼稚啊，神奇宝贝战斗自古以来就已经存在，用神奇宝贝战斗早已是理所当然的事情。”
被叫做小平的孩子大吼：“幼稚的明明就是阿红你，神奇宝贝与人类一起生活一起成长，可是就是因为像你这种人存在，才会有神奇宝贝战斗，才会有那么多神奇宝贝受伤甚至死亡！”
阿红也不甘示弱地吼回去：“那像你这么说这个世界上所有的人还有什么存在的价值，神奇宝贝中心还有什么存在的必要！”
小平顿时被吓住，说不出话来，憋了一阵，最终还是大哭起来。
“真是的，阿红你明知道小平最不喜欢神奇宝贝战斗还非要跟他吵，你就不能让着点他吗。”
“对不起，小莲。”
“你应该说对不起的是小平吧。”
小智站在不远处的树荫下听着他们的争吵，感觉还蛮有意思的。他本人也很不喜欢神奇宝贝战斗，他喜欢的是人与神奇宝贝和谐相处，共同进退。不过神奇宝贝战斗他并没有去否定它，这也是为什么小平理亏的原因。
神奇宝贝战斗既然存在那就必定有它存在的价值，即便有人讨厌，但却不应该去否定它。
好不容易让小平停止哭泣，附近的草丛却传来神奇宝贝的吼声。几秒钟的功夫，一只尼多利诺从草丛中蹿了出来，3人吓得抱作一团。不过尼多利诺只是看了他们几眼，就蹲下来休息了。
“看起来是野生的尼多利诺，可能是不小心闯进来了吧。”阿红说着，随地拾起一根树枝慢慢靠近尼多利诺。
感觉到有人靠近的尼多利诺突然睁开眼冲着阿红吼了一声。阿红起先被吓退几步，但一想到小莲就在后面，于是又大着胆子走上前，轻轻戳了一下尼多利诺。
尼多利诺再次怒吼，吓得阿红一屁股坐在地上。而这时小平却毫无畏惧的走向尼多利诺。尼多利诺继续怒吼，不过小平依旧在靠近。尼多利诺慌了，它原本就已经受了伤，现在已经没有体力了，它非常讨厌人类，但这时候却无可奈何。
“乖乖，”小平走到尼多利诺身边，轻柔地抚摸着尼多利诺的身躯，“你一定是受伤了吧。”
尼多利诺一惊，它还是第一次见到人类善良的一面，心里对人类的仇恨淡化了一些。
“原来如此，这只尼多利诺受伤了啊。”阿红似乎也看出尼多利诺受伤，立刻趾高气昂起来，“嘿嘿，正好我没有神奇宝贝，那我就收服让你成为我的第一只神奇宝贝吧。”
说完阿红就顺势扔出一个宝贝球，不过这却激怒了尼多利诺，它用力把宝贝球顶飞，然后怒视着阿红。阿红毕竟才6岁，被尼多利诺这么一瞪，腿立刻发软，一屁股坐在地上。
“神奇宝贝，可不是像你那样扔出宝贝球就行了的哦。”小智一直在一边看着，终于找到机会登场了。
“你看好了，想要收服神奇宝贝是要战斗的，”小智说着丢出宝贝球，白光一闪，小白再次登场，“小白，使出变身！”
小白的身体开始扭曲变形，几秒钟红一只一模一样的尼多利诺出现在阿红等人的眼中。
“小白使用电光一闪加猛撞！”
变身成尼多利诺的小白四条腿一蹬，原地留下一个残影，而本体已经来到尼多利诺的身边。
这只野生的尼多利诺原本是使用角撞来抵挡的，因为没有经过训练，所以战斗都是靠着原始的本能。但是小白的速度实在太快了，它的角撞被轻松闪过，然后被狠狠地撞倒在地。
“尼多利诺，你没事吧！你为什么要这样做！”小平一见尼多利诺使出战斗能力昏迷，对小智怒吼道。
小智不去理会，扔出宝贝球，将这只已经受伤的尼多利诺收服。
“你还太嫩了，”小智来到阿红面前，直到现在他都还没力气站起来，“神奇宝贝并不是战斗的工具，它们是人类的伙伴。这只尼多利诺我把它交给你，我希望你能和它建立羁绊。如果以后我见到你做不到的话我会收回这只尼多利诺。那边的，你叫小平对吧，就由你来监督他。”
小智并不知道这样做对不对，只是他希望阿红能明白人类与神奇宝贝是不可分割的，并不是战斗就能实现神奇宝贝的价值。
原本以为自己会被教训一顿的阿红一听说有神奇宝贝白送，立刻激动地站起来，直接抢过小智手上的宝贝球。
“嗯，我一定会做到的！”像是为了保证，阿红用力地点点头。
将3人打发走，小智这才感觉清静。把小白叫了出来，让它变成枕头，小智趟在刚刚的树荫下睡去。
“真新镇真是不错呢！”
