西元2001年凌波丽、明日香、已经碇真嗣出生
转眼间时间来到了西元2015年，在这十五年中蒙德斯小朋友只长高了60cm。如果以他出现在南极时的外貌为准的话他已经21岁了，但他却丝毫没有一名21岁男子应有的风采反而像一个萌正太。甚至他的身体异常的脆弱，也就是很容易生病，也很容易受伤。但就这样小看他的话会被他打击得体无完肤。作为一名21岁的男孩虽然体弱多病，但是他已经取得了机械学、生物学、神经学、物理学等十几个学科的博士学位。
2015年6月，蒙德斯因为EVA—00的暴走而被Seele派往了位于日本箱根的第三新东京都市。
而在他到达第三新东京都市的那天，第四号使徒来袭了。为了保护居民，第三新东京都市的所有居民都进入了位于地下的避难所。
在城市的某个地方葛城美里正开着她那新买的雷诺汽车，打算去载两个于今日抵达的人。
在第三新东京都市的一条街道上，一名少年正站在路边的电话亭边。他正试图通过电话联系叫他来此地的父亲。可惜由于全名避难的原因电话线被切断了。这名少年便是碇真嗣。
碇真嗣正打算先去避难所避难的时候，他突然感觉有人正在盯着他。回头望去一名女孩站在十字路口的正中间。碇真嗣的注意力被飞起的鸟儿吸引去了，等他把头转回来时，女孩已经消失不见。
在城市的外围许多架直升飞机正在对一名巨大的人型生命体进行攻击。同时无数的自走炮和导弹也在同时攻击着。这名巨大人型生命体就是此次来袭的第四使徒——萨基尔。
由于萨基尔拥有者A.T.field的原因所有常规武器都无法对它造成伤害。但萨基尔似乎被空中飞来飞去的直升飞机惹怒了。抬起手打出一发光之枪将一架直升飞机击落后，便跳了起来。
那架被击落的直升飞机掉到离碇真嗣不住十米的地方。而此时，萨基尔恰好从空中落下踩在了直升飞机上。如果没有意外的话碇真嗣的生命就会在这里被终结。
但是如果就是如果是无法变成现实。在直升飞机爆炸的时候一辆汽车挡在了他与直升飞机之间，将爆炸产生的冲击波全部阻挡了。车门被打开了，碇真嗣看到了坐在驾驶位上的葛城美里。
“抱歉，久等了。”这次葛城美里与碇真嗣见面后的第一句话。
美里果断的把碇真嗣拉上车后火速离开了萨基尔的身边。防止被萨基尔攻击以及被自卫队的攻击波及到。
在位于第三新东京都市地下的NERV总部中自卫队的三名指挥官正指挥着自己的部队进行了还无作用的攻击。
“发起总攻，把后方第四师团全部投入。”坐在左边指挥官抱怨道。
“不惜一切代价摧毁目标。”坐在右边的指挥官说道
自走炮、坦克、多管火箭炮、第二炮兵部队、导弹、飞机。自卫队投入所有在手的兵力试图将使徒杀死。可惜在攻击没法打破使徒的A.T.field之前他们无法伤到试图分毫。
“为啥？明明直接命中了。”坐在左边指挥官抱怨道。
“装甲部队全灭，制导武器和火炮都毫无效果吗？”坐在右边指挥官说道。
“不行！这种程度的活力根本就不够。”坐在左边指挥官抱怨道。
“果然是A.T.field么。”坐在三名指挥官后面的碇源渡说道。
“常规武器对使徒是无效的。”位于碇源渡后面的冬月回答道。
“嗯，我明白了。按照计划行事。”
真正认识到常规武器无法对使徒产生作用的自卫队指挥官觉得使用在人类至今最强大的武器N2地雷。
正往NERV总部赶的葛城美里发现了自卫队的直升飞机正在远离使徒，马上意识到自卫队打算使用N2地雷。她随即将碇真嗣压在身下用自己的身体保护他免收爆炸伤害。
“boom！···”随着一阵耀眼的光芒N2地雷爆炸了。其产生的蘑菇云一共有几百米高。
“成了！”坐在左边的指挥官激动的站起来。
坐在右边的指挥官回过头对碇源渡嘲讽的说道：“真遗憾，好像轮不到你们出场了。”由于太过激动，他没有发现冬月那嘲讽的微笑。
“没事吧？”从被N2地雷爆炸所产生的冲击波变成直立的雷诺爬出的美里向身旁的碇真嗣询问道。
“嗯，只是嘴里全是沙子。”
“那就好。那么，使劲了。”
两人合力将竖起的雷诺推回了正常的位置。可是美里悲哀的发现由于保护及时。这次的事故没有造成人员的损伤，但是她的雷诺在回去之后必须返厂重修了。（迷之音：真是令（xi）人（wen）悲（le）伤（jian）啊。）
此时NERV的内
“现在的目标呢？”一名指挥官提问道。
“那样的爆炸一定解决了。”坐在最左边的指挥官说道。
可惜真相是使徒的构成物质18%被溶解，过几分钟后萨基尔又会活蹦乱跳了。
发现N2地雷也无法对使徒造成致命伤害后自卫队的三名指挥官吃惊的站了起来。
“我们的王牌！”右边的指挥官无力的坐下。
“怎么会这样。”中间的指挥官也坐下了。
“该死的怪物。”左边的指挥官愤怒地锤了下桌子。
与此同时，美里正开着半残废的雷诺载着碇真嗣往NEVR总部赶。
对于还能开动的雷诺美里感叹的说道：“这雷诺还能动真是太好了。”（迷之声：我也觉的它能动实在是太奇迹了。）
在路上美里向碇真嗣问道：“什么都不问么，真锭君？”
“啊？”
“从刚才就是我一个人在说。”
“对不起。”
“倒也不用道歉，只是‘刚才那大个子是什么’、‘到底发生了什么’的，一般都会问下的吧。”
“不···只是···觉得就算问了也得不到任何回答。”
“意外的预想事情而私定结论，一点都不像小孩子哦。”
“没关系，只是按照老师说的做而已。”
“哦？算了。顺便提一下，刚才的那是被称为‘使徒’的谜样生物。”
“第四使徒，了不起的自我恢复能力啊。”冬月感叹道。
“作为完全形态的单体生物，这是必然的。”碇源渡平静地说道。
“吃过生命果实的家伙么？”
“嗯，为了毁灭吃过智慧果实的我们而存在的生物。”
费尽千辛万苦美里与碇真嗣终于到达了NERV总部的入口。
