天皇归位后，女娲又多了一处可去之处，闲暇之际就会去火云宫看望兄长伏羲。此时地皇神农亦已归位，因伏羲与神农是结义的兄弟，二人在人间界时又承蒙女娲多方关照，因此女娲一方面是又多了两位兄长，另一方面却是又多了两位道友。
此时人间界正值人皇轩辕与九黎族长蚩尤打得不可开交之时。
说起那蚩尤，原是后土存的一片私心。她因见伏羲转世不独证得人皇道果，竟因此也给妖族带来一份气运，不免见样学样，遂让巫妖决战中身殒的大巫蚩尤，以大巫之身合巫族秘法转世重修。一般人经轮回之所转修，都会将其前世记忆抹得干干净净，方让其轮回转世，即便如伏羲转世亦不例外。她却利用手中便利让蚩尤带着记忆重生，因此这蚩尤一出世后即拥有其大巫的法力神通，后更利用其巫族秘法修得不死之身，遂在巫族之中一呼百应，一统九黎之族大大小小八十一个巫族部落。
伏羲转世让妖族气运大涨，却也引起另一位圣人的关心，此人正是五庄观镇元子。当年红云身殒，他证道后才得知真相不免一直耿耿于怀，只是碍于女娲的面子才一直未曾对妖族出手，后见伏羲转世，妖修纷纷入世辅佐，不免让他心中一动，遂遣门人下到洪荒相助人族下一任人皇即神农氏。
这镇元子却也爱捣鬼，其门下净找些巫族修真者收归门下，神农一出，即让其一心跟着神农与轩辕氏开战，只因那轩辕氏早被一大群妖族大神通者拥护。
神农一心只在编写《百草经》，为民尝百草，祛除病痛，对战争一事确实有心无力，并无心征伐，之后更传位轩辕。镇元子的徒孙们遂转而相助蚩尤，以至于一场人族之战，乃演变成一场巫妖之战。
那蚩尤大巫之身倒也罢了，其手上更是拥有一把利器名曰蚩尤刀，其上隐有十二祖巫之相，显然也是经过高人指点，或者打磨，如此一来，这一场战争于轩辕人族便极为不公平。
这也是女娲会上门与妖师纵论洪荒大势，势图说服鲲鹏解散北冥妖族组织，却独对妖族助人族一事听之任之的原因。形势如此妖族哪里还有退路，不拚个你死我活是没人肯放手的。
轩辕天命注定日后一统洪荒的人选，功证人皇之人，对付那蚩尤，人皇手上尚缺一件利器。三皇一体，人皇不归位，三圣无法同享那混元道果，伏羲与神农自然要为轩辕谋划，于是转而求助女娲。
伏羲因说起昔日帝俊所造的杀巫剑来，神农也表示对付蚩尤非此剑莫属。女娲想到此剑声名太大，传出去难免洪荒震动，遂将伏羲真身炼化的伏羲剑交与伏羲道：“此剑乃小妹以兄长先天神魔真身所炼，威力实不下那杀巫剑，兄长倒可以将此剑煅造一番授予轩辕，作为人皇剑，与人皇印一起镇压我人族气运。”
伏羲接过剑，神识一探，早已明白究竟。心说所幸女娲福缘深厚，不然只怕要为真的伏羲算计，要那样自己可真要后悔莫及了。终自己洪荒前世一生，其实也就是与那个隐形人一直斗智斗勇，虽没有刀光剑影，却处处险象环生。今日才知这个魔头竟落得如此下场，这倒也不失其最佳归宿了，何况不如此，又焉能有自己的今天。他接过剑向女娲施了一礼道：“多谢妹妹相助。”女娲抿嘴一笑，侧身一让，不受他的礼。
二人亿万载兄妹相处，女娲拿出伏羲剑，傅熙心里如何还能不明白。不管真的伏羲待他们怎样，三人到底也亿万载相处过，自己更是借助其真身修来今日这份道果，这份因果也还是要还的。伏羲若能藉着人皇剑去人间界历练一番，自少不了他的那一份功德，对他日后修行自也有其好处，彼时自己早已证混元道果，伏羲也翻不起什么浪来，各人自能相安无事，也算是皆大欢喜。
伏羲自去煅造伏羲剑，女娲拿起神农的《本草经》翻阅，一面与神农说话。却见神农言语间常常心神恍惚，似有隐忧，不由大感奇怪，遂问因由。
原来神农有一女，名叫女娃，七八岁时，突然无缘无故失踪。后经多方寻找，竟是天庭无、轮回无，人族更是找遍踪迹皆无，还一度为此兴师问罪轩辕，还以为是被轩辕绑架了，会在某一个关键时刻被其拿来做筹码，孰料直到他归位地皇，还是毫无着落，这才着了慌求救伏羲。伏羲一推算只说被东海龙君的三太子纵水而亡，如今在东海之滨化为一只精卫鸟。
以东海之大，寻找一只寻常小鸟，竟又数十年而不得。
女娲听后埋怨道：“兄长何不早说？”恰好伏羲提剑走了出来，听得女娲此话顿如醍醐灌顶“啊呀”清醒过来，说，“平日可见做的都是徒劳功，如何把你给忘了。”神农叹了一口气，回说平日里只知叫人寻找，原以为很快就找得着的，倒没想到妹妹身上。伏羲叹了口气，只说也是孽缘，所以要吃这许多苦头。
女娲因问伏羲：“剑成了？”伏羲点点头，抽出宝剑，女娲见上面隐隐有山川河岳、日月星辰之图又有五彩之光若隐若显，想是融入了混元河洛大阵另注入了功德之气在上面。因点点头，只说也只好如此了。
要知道伏羲那可是人妖之皇，这剑一经出世，实不亚于伏羲亲临，洪荒多少妖修正望眼欲穿，巴不得妖族之中也能有一位大妖横空出世，如巫族蚩尤那样率众驰骋洪荒、笑傲洪荒。故这剑哪怕是落到一个三岁小孩子身上，也一样要大放光芒，血流成河。
如不是蚩尤刀太过霸道，女娲、伏羲也不想将伏羲剑授予轩辕。
伏羲拨开云雾，将伏羲剑自三十三天外朝下界的轩辕投了下去。
果然伏羲剑出，顿时惊动不少隐匿于三山五岳的洪荒妖族，虽知剑身上伏羲的先天神魔气息，洪荒妖族谁人不识，于是纷纷收拾行装出山辅助轩辕，再不济也要遣个门人徒弟什么的下山去辅助人皇，最后更是连妖族昔日大帅英招、毕方、陆吾都投到了轩辕帐下。
人族更以为是上天相助，此战必胜，一个个喜得跪倒尘埃叩神谢恩，轩辕氏士气顿时大涨。
后逐鹿之战，蚩尤终死于轩辕剑下，从而奠定轩辕一统洪荒的霸主地位，巫族大巫更是经此一役全没，巫族自此彻底从洪荒除名，且不去说他。
“小妹就此告辞，女娃之事，就交给小妹处理罢。”知道神农忧心，此间事了，女娲不敢再耽搁，乃向二人告辞而去。
东海虽大，对于身为圣人的女娲，倒不是什么难事。默算片刻后心中已有了主意，叫来彩凤让其前往东海之滨发鸠山上走一趟。不过一日彩凤回来说是有了女娃的消息。
“师尊，你看！”彩凤指着海面上一只小鸟给女娲看。只见：
东海之滨，一只小鸟衔着一枝小树枝，愤怒地投到大海之中，小树枝转眼间就被海水咆哮着不知卷往何处，然而它却浑然无觉，“精卫精卫”地鸣叫着，又飞回衔起一枚小石子，投入大海之中、、、、、、如此往复，始终不知疲倦。那鸟的形状像乌鸦，头部有花纹，白色的嘴，红色的脚，叫声像在呼唤自己的名字。
“没错，正是她！”女娲说道。看着这只倔强的小鸟，虽说已有心里准备，可还是震惊得说不出话来：这孩子这是哪来这么大的仇恨呀？小小年纪这也太、、、、、这执念也太深了吧。
女娲升到半空，显出法象叫道：“精卫，还不归来！”
突然听到这一声母性的召唤，那只小鸟突然间灵台一阵澄明，前程往事俱在脑中一一略过，数十年来作茧自缚，无过去亦无未来，明明早已筋疲力尽却就是无法让自己停歇下来，虽说早已忘却了初衷所为何来，如今终于知道自己是谁了，终于可以停下来了。
精卫鸟落在女娲手中，一下就昏死过去了。
“真累呀、、、、、、”精卫说道。
女娲一探精卫气息，不由大吃一惊，这精卫身上好强的巫族气息呀。
兰花戒贴上精卫眉心，前尘往事俱在兰花戒上一一显现，女娲看罢心道：“原来如此。”
