对于秦崇太来说，担任中亚战区的中央全权军事代表团的团长，是其军事生涯的一个里程碑，也是对他一次重要的政治考验。
根据事先制定的方针，秦崇太与代表团成员在中亚战区会和后，并没有着急组织作战，而是让代表团搜集战区“天网”的实力情报，查找方面军连番作战不利的问题，他很快确认，中亚方面军的基层官兵大都信仰坚定、且具备牺牲精神，高级军官中也不乏战术素养较高之人，而中亚方面军作屡战不利的原因，一是武器装备的问题。中亚战区的军工和科技基础弱，装备本就很依赖外援，在泛欧战场陷入胶着、对中亚战区援助大幅减少的情况下，中亚方面军的军资不继，因而作战困难。二是战略战术和训练指挥方面的问题。与“终结者”作战、特别是攻击机器据点，少不了重武器的支援，但中亚的地理环境很不利于重武器的隐蔽和机动，大部分重武器仅用了一次、甚至还没来得及用上，就被“天网”侦获摧毁了，在这种情况下想拔除机器据点，本就是困难重重，但中亚方面军依然采用攻坚战来阻止机器的扩张，显然不明智。这第三点，就是协同——说白了就是团结的问题了。中亚战区以往的民族和国家矛盾仍在作祟，各部之间的行动脱节，执行力也不强，这个问题在援军方面也很突出。而连番失败又加剧了这一矛盾，一线官兵士气低落，部队上下相互指责推诿，各方援军也都观望不前，司令部的指令不能获得很好的响应。
秦崇太得出结论，在这第三点中，团结问题是关键，所以整顿部队、严肃军纪、统一指挥乃是当务之急。
秦崇太亲自走访视察了中亚方面军的各支部队，还马不停蹄地会见了各支援军的指挥官，包括印度方面军的拉利特·班诺特将军、东欧方面军的托尼·库科奇将军以及901集团军的西日阿洪上校，需要关注的是，秦崇太与西日阿洪的纠葛就是由此开始的，当时西日阿洪对秦崇太知之甚少，而秦崇太自然也不清楚西日阿洪的背景——西日阿洪就是毛人龙之子——毛阿洪。
在洞悉问题所在之后，秦崇太展现了性格中冷酷无情的一面，这也成为了他之后治军风格的一种表象。
在战区司令阿齐兹·亚辛等人的坚定支持下，秦崇太根据朴正阳等代表团成员的建议，即刻施展铁腕手段清除弊端，中亚军中素质低下、观念陈旧的的军政领导被逐一更换，取代他们的，是一批接受过教导团的培训，或是支持反抗军和联盟理念的中青年军官，这样的“换血”行为，使得中亚军队风气和执行力大为改观。同时秦崇太又挑选中亚军中的精锐部队，组建中亚第五军团，既日后著名的“阿克萨烈士军”，并令岳无忌协助训练指挥这支部队，又将带来的特战团暂时编入第五军，引导第五军在作战中学习成长，还将重要作战物资优先配给第五军，为中亚方面军迅速打造了一支“能战”的典范部队。
秦崇太对中亚援军的整治也毫不手软。
秦崇太看出，中亚各方援军的惨淡表现，表面上是因为中亚方面军自身作战和指挥不利，无法为援军作出表率，但实际上，主要还是援军自保的私心在作祟了，而这样的私心，在当时的东方战场上并不少见。
秦崇太决定以此为契机，杀杀这股歪风。
印度方面军的拉利特·班诺特部是各方援军的主力，秦崇太决心就拿这支部队开刀。
班诺特部的任务，本是协助中亚军去解巴基斯坦的白沙瓦方向之困，但因为印度与巴基斯坦战前的过节，班诺特对这个支援任务表现消极，他自恃在印度方面军中位重资深，无论是中亚司令部还是中央的命令都不放在眼里，数月之间没有任何进展，几乎是坐视中亚重镇白沙瓦的沦陷，秦崇太对此早有耳闻，在班诺特部视察时秦崇太又看到，班诺特作为十万援军的司令，竟然对中亚战区的现况一问三不知，整个司令部也看不到战斗的紧迫感，倒是他手下一个叫阿卜杜拉·拉赫曼的年轻参谋对形势看得很清楚，提出战术设想也切合实际，秦崇太当即就对班诺特将军提出了严厉批评，并一阵见血地指出，作为“人类反抗军”的军事领导人，坐视“天网”对人类为所欲为，就是“犯罪行为”。班诺特见一个初出茅庐的毛头小子，竟敢对自己说出如此“大不敬”的话，不禁勃然大怒，声称自己“只接受印度方面军司令部的直接指挥”，还下了逐客令，强行叫来警卫人员，把秦崇太一行人“赶”了出去，全然没把秦崇太这个“中央全权代表”放在眼里。
敢对秦崇太“动手”！拉利特·班诺特显然是太嚣张了，他还不知道秦崇太的个性和手段。
秦崇太怒了！
“中央全权军事代表团的团长”对战区司令以下军官，可都有先斩后奏的权力。
秦崇太回去后，立即下达了“将拉利特·班诺特撤职查办，由阿卜杜拉·拉赫曼为部队代司令”的军令，并命张羽即刻带着这个军令、率一个特战排前去执行军令。张羽受命当天就空降“夜袭”班诺特的司令部，以双方0伤亡的代价，将班诺特从床上“抓”了起来，张羽又就地连夜召开高级军事会议，对印度援军宣布了“中央的命令”，两天后，张羽协助阿卜杜拉·拉赫曼指挥印度的援军，按照拉赫曼早先的战术设想，向着白沙瓦方向攻击前进。
翻看这段历史，我们可以发现一个值得注意的现象，就是当秦崇太在中亚战区大刀阔斧进行改革的时候，代表团里的“中央特派员”齐精忠却很少做声，但历史记录显示，齐精忠这一时期与中央的联系却不少，也就是说，中央默认了秦崇太的作为，可以现象，如果没有中央的暗中支持，秦崇太的改革一定会遇到相当大的阻力，由此可见中央对秦崇太的认可。当然，也有史学家认为，中央统帅部当时还无法完全控制战场各方力量，印度方面军就是其中之一，（注：相关原因见本书第一卷之《东方战场的成立过程》等章节。）中央这是有意借秦崇太的手，去“整一整不听话的人”。
但实际上，齐精忠在“武力抓捕”拉利特·班诺特将军的事情上，曾提出了反对意见。
齐精忠的反对不无道理，印度战区是南亚战区的重要支撑，印度战区司令还兼任东方战场副统帅一职，印度战区领导层在中央统帅部有很大的话语权，再怎么样，拉利特·班诺特也是印度战区领导层的实权人物，对他实施“武力抓捕”这样的极端行为，搞大了实在很难控制。
但秦崇太的观点与齐精忠正相反，他认为“这正是所有问题根源”，在这人类死生存亡的关头、在中亚战局严重不利的情况下，“更要以强硬的行为，严肃军纪、坚决处理任何破坏团结的人。”。
秦崇太有时做事的确是很“绝”。
在“抓捕”了班诺特将军之后，齐精忠又说服了代表团副团长岳无忌，让他对秦崇太提出了“适可而止”的忠告，建议秦崇太将班诺特体面地送回印度战区，让印度领导层对他做出处置，但秦崇太却认为这样的话，无法起到应有惩罚的作用，于是他将班诺特“关了禁闭”，并对中央提交了对班诺特“降职、降衔、记大过”的处理结果，而且直到处理结果被中央批复后，才将班诺特放了回去。
齐精忠见秦崇太如此强势，就提出自己要到西日阿洪的援军去做工作，接触901集团军的人，虽然也是齐精忠此行的一个任务，但他这个时候提出来，某种程度上也是以离开行为表达不满，秦崇太也就真没“挽留”他这个“中央特派员”，可以想象，在齐精忠给中央的内部报告中，对秦崇太的**是不会少的。
需要提到的是，秦崇太虽然作风犀利，但并非鲁莽之人，让阿卜杜拉·拉赫曼暂时取代班诺特将军，不像是一时冲动的决定，拉赫曼长秦崇太8岁，曾接受过教导团的培训，他思想开明、很有主见，在年轻军官中颇有声望，德克·海因里希作为分遣队长在印度工作时，（注：见本书第一卷之“独立师”章节。）就认识了拉赫曼，其军事才华和时代理想也得到了德克的肯定，这些德克与秦崇太肯定有过交流。而且拉赫曼的家族背景也不容忽视。（注：注：见本书第一卷之“挪威的森林”章节。）
印度领导层最终对“查办班诺特、以拉赫曼取代”等既成事实没有表达太多不满，也从侧面证实秦崇太的判断。
秦崇太携“骨刺”战役大胜之威，挥舞“中央的全权军事代表团长”的大旗，三下五除二在中亚战区进行了一番改革，锋芒毕露的同时也必然不会少得罪人，很多人都为他捏着一把汗——打胜仗才是硬道理，但中亚之敌风头正劲，秦崇太万一作战不利的话，这黑锅可非同寻常啊！
但秦崇太对作战充满自信，他在制定计划的时候就认为，比起对中亚战区的整顿改革，作战的问题反倒相对简单了，随后代表团成员被秦崇太派往各支部队协助指挥，朴正阳留在中亚司令部协助阿齐兹·亚辛司令，而关键的作战，秦崇太认为由自己和小林觉来指挥就足够了。
