取得橘子联盟的胜利后阿虎也踏上了回乡的路程……。
此时真新镇的大木博士研究所里，大木和正辉两位博士正在聚精会神的观察着研究所里的神奇宝贝们。正当两位博士认真记录着数据的时候，天空中传来了一只神奇宝贝的吼叫声，然后只见那只神奇宝贝径直朝两位博士俯冲下来。两位博士连忙躲闪起来。那只神奇宝贝落地后两位博士认出了这只神奇宝贝，是一只暴蝾螈，那么对于这只暴蝾螈的主人大木博士自然在熟悉不过了。接着阿虎从暴蝾螈背上跳了下来，然后他把他身上所带的神奇宝贝都给放了出来让他们去研究所里自由活动的了。
阿虎这时走到惊魂未定的大木博士身旁拿出了橘子联盟优胜的奖杯递给了大木博士，大木博士看着奖杯高兴极了，然后大木博士朝阿虎头上轻轻的拍了一下算是对于阿虎刚才恶作剧的惩罚吧！正辉博士也看见了优胜奖杯对阿虎也是一顿夸奖，弄得阿虎都不好意思了。再拿到阿虎橘子联盟优胜的奖杯后大木博士就把他放到了他研究室的书橱里，厨子的两个奖杯熠熠生辉(另一个奖杯是阿虎石英大会的那个)。
当天夜里大木博士请来了小智的妈妈让他当主厨给阿虎举办了一个欢迎晚宴以此来庆祝阿虎橘子联盟的优胜。阿虎在丰盛的食物面前完全放下了抵抗，不顾形象的大吃了起来，引的大家一阵大笑。第二天阿虎被一阵机器的轰鸣声给吵醒了，阿虎睁开朦胧的双眼透过窗户开始观察起外面的情况，阿虎一看顿时清醒了不少，阿虎只看见外面好几台挖掘机正在忙碌的工作着。旁边还停着几台阿虎不知道名字的机器还有人在不断的指挥着这些机器看到这一场面阿虎下意识的想到了强拆这两个字眼，想到这里，阿虎连忙跑了出去，刚到门口阿虎就在家大木博士和正辉博士正在高兴的看着这一切，这令阿虎十分的不解，阿虎连忙跑到大木博士面前问道：“爷爷，这是在干什么呀，怎么那么吵。”大木博士看到阿虎回答道：“阿虎呀，不好意思把你给吵醒了。联盟打算在我们研究所里建立一个私人的神奇宝贝中心里面将引进最新进的神奇宝贝治疗设备，并且还会派三位乔伊小姐过来协助我们治疗神奇宝贝，这下子我和正辉的压力减少了不少可以安心的搞研究了。”阿虎听到大木博士的话后暗幸自己没有冲动要不然可要闹笑话了。阿虎回到真新镇已经一个星期了，在这一个星期里阿虎一直和他的神奇宝贝在一起，阿虎还是在不停的训练着他的神奇宝贝，期间小茂也结束了锻炼回到了真新镇，回到镇子里后听到阿虎也在，小茂瞬间燃起了斗志，向阿虎发起了挑战，对于弟弟的挑战阿虎自然不会拒接，在大木博士的见证下阿虎和小茂两兄弟来了一场6V6的全员赛，最终阿虎以四胜两负的战绩取得了胜利。
小茂通过这场比赛认为他自己的修行还不够，他打算继续展开他的修行之路这次他打算挑战CD联盟，并且和阿虎约定在CD联盟上在一绝高下。阿虎欣然的接受了小茂的挑战。小茂在研究所里休整了一天后就开始了他的CD之旅。而阿虎却没有着急出发，还是一如既往的训练着他的神奇宝贝，同时也在挑选着他的CD联盟的神奇宝贝队伍。
在小茂走了两天后，阿虎从大木博士那里得知了小智也取得了橘子联盟的优胜后，阿虎也开始了属于他的CD之旅。阿虎这次CD之行阿虎只带由基拉和超梦，其余的神奇宝贝则被阿虎寄放在了研究所里，推给大木博士照顾。就这样迎着微风阿虎再次踏出了小镇开始了他新的征途。
