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第27章 整体论的思考

以序列来耦合层次

Andallofthesetogethergiverisetocellulartissueandorganismmalfunctionorfunction。层次的不断集合最终在不同层次体现

integratedstudy整合研究

Somemighthaveasystematthelevelofcell。Orthelevelofatissueinanorganorthelevelofthewholeorganismorgoingbacktotheotherend,anditmaybesub-cellularlevels,likeIsaidbefore层次之间的偶联关系强度不同,可形成共振的相关系数更大

howcellsbecometissuesandorgans耦合方式

亚层的形成有助于层次形成,如细胞膜的通道蛋白

不同化学分子的组合作为层次,重要的是寻找规律,量化可用其浓度(隐马尔科夫)?还是回溯层次序列?这就符合微分方程的层次耦合?

organizethesedatainanappropriatemanner合理组织

avarietyofstatisticalandmathematicaltoolsgraphtheoryornetwork****ysis图论和网络分析provideadeepunderstanding

there'snoreallyrightorwrongway都是概率,不同环境有不同的概率空间即不同偏向

modelscantellusaboutsystemsbehavior

interactionbetweencomponentsleadtotheemergenceofsystemslevelproperties

相互作用即外在性质决定内在的个体存在

setsofcomponents集合,这是一种算术体系

moleculesinteractandcometogethertogiverisetosub-cellularmachinesthatformfunctionalunits分子作用及分子层次组成亚层,这最终可理解为基本单位,即我们的概念,可以解释功能

thetranscriptionalprograminhumanfibroblastscould,wouldrespondtoastimulus

howpropertiescouldemergefrominteractionbetweenbiologicalsignalingpathwaysandhowtheseproperties

cellswouldmaintainhomeostasis鲁棒性即还原性,这是一种倾向。细胞倾向稳态

Thesesubcellularmachinesinturngotoformcells。反作用力即楞次定律决定生命存在,所有都与相互作用相关

Physiologyhasalwaysprovideduswithquantitativedescriptionoffunctionsatthetissueandatthetissueandorganlevel不仅是生理学的指标变化可量化,其指标的变化所形成的群也是量化的一种,反正是寻找

多层次,还有时间维度。不同尺度适用不同法则

不同的行为如通道蛋白的开合也是一种序列,这启发我们将复杂事物01化,再组合成序列,最后不同层次耦合,如通道蛋白的开合也代表了一定的基因表达,即不同层次耦合

还原论是一种局部近似,对于更高层次就无能为力,倘若我们从低次项不断反向推导,可否最终还原成一定函数的幂运算?即反泰勒分解?

蛋白有其抗体来模糊计算,序列有其对应的反义序列对应。

接下来是相关性分析

分解代谢是0,合成代谢是1,生命活动是一系列的序列及其运算

代谢构成一个统一的整体,即1和0之间的转换,同时还有模式化的转化,即结构化的转换

不同过程也是一种耦合:吸收-代谢-排*****细的调节机制,调节代谢的强度、方向和速度即概率的不同指向

各种代谢物均具有各自共同的代谢池:基础或者节点

ATP是机体能量利用的共同形式,机制的共同形式是序列

各具特色:途径不同、功能各异

不同的组织的分布,功能是高层次的耦合

细胞水平-激素-整体:递增的层次,其中中间层次的出现似乎可以从演化来解释,整体层次就像我们现实中的高级管理人员,讲究管理的艺术,既有以下制下,也有使大家往一个方向发力;尺度越小,封闭性越大,这也有利于区域化,发挥边际效应

糖、脂类、蛋白质代谢间的联系:确定基本单位,构建关系,且其可在更大的维度耦合,就如数学的自洽,他们可映射为多维的过程,但最终是收敛的,这体现于相互转变关系。但完全的平移转换是不可以的,不然就可拓扑到一体,那就没有分别了

概率的转换是必要的,在特殊的情景会出现不可逆,这说明了一些转换的不可能

大脑是理解这些序列的绝佳模型,如大脑感知运动是通过各种不同强度和性质的信号集合的处理,并且在更大的维度能够选择性的读取信息及关注重点

任一供能物质的代谢占优势,常能抑制和节约其他物质的降解,因为其耦合于同一能量体系

代谢的相互联系是物质的高维,同样是波函数

这可有统计来模拟

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