拿破仑回到法国，把他年幼的弟弟路易一起带到了法国，他们省吃俭用，拿破仑用微薄的薪金供养弟弟上学，虽然亚玟看说后赠予了拿破仑一些钱，但拿破仑最后还是拒绝了，亚玟被拒绝了也没有说什么，只是对拿破仑说有困难可以找他，拿破仑也没有拒绝亚玟提出的这个方式。
拿破仑带着弟弟在艰难度日的时候，似乎时来运转了，拿破仑被调到瓦朗斯城的另一个团任职，并被晋升为中尉。与此同时，法国当时有八十三个省，有六十多个省发生了起义，法国革命原则在不断的取得胜利，这使得拿破仑的革命热情不断高涨。
1791年9月，拿破仑以国民自卫军阿雅克修营副营长的身份再次回到了科西嘉，但这次，他与保利彻底决裂了，因为保利已经公开要使科西嘉脱离法国，愤怒的拿破仑命令士兵向支持保利的分离派主义者开枪，而保利也命人反击，岛上爆发了武装冲突，并且互相割据对战。
1792年5月，拿破仑去巴黎汇报在科西嘉的活动，但由于法国的大革命，奥地利的皇帝和普鲁士的国王已经向法国宣战，战前的贵族和将军们纷纷通敌倒戈，导致前线军事指挥人员极为缺乏，但拿破仑没有得到任命，这时他被生活所迫，他穿着破烂的衣服，设法做点赚钱的投机买卖，却没有成功。他在巴黎穷困潦倒，却不久后接到一份晋升他为上尉的命令，原来是因为贵族军官逃亡过多，使得军中缺额较多。拿破仑以为自己时来运转，暗自高兴，可他等了很久都没有任命。由于法国对奥战争节节败北，巴黎的人民愤怒的冲进王宫，迫使国王带上红色尖帽，站在窗口向民众道歉，拿破仑刚好看到这一幕，大为鄙夷的说道：“这种乱民，只要用大炮消灭几百人，他们自己就会自己溃散，只要他跨上他的战马，胜利本来属于他的，真是一个懦夫。”拿破仑对此深感失望，很快离开了巴黎，回科西嘉去了。
拿破仑回到科西嘉已经是10月，当他回到家时，他的家人递给了他一封亚玟寄来的信，上面写道：我的朋友，对于你在科西嘉岛上的事情我已经听闻，我十分支持你的做法，企图分裂国家的人都可以用叛国罪处理。我听说你已经去了巴黎，也不知道你回来没有，也不知道你是否知道，我国在9月20日，由迪穆里耶将军指挥的摩泽尔集团军和凯勒曼将军指挥的莱茵集团军在瓦尔密击溃了由布伦瑞克公爵领导的反法联军，虽然国王和子拿在的执政派是一群不可靠的家伙，但是国家、人民和军队是可靠的，我坚信这一点。不知你是否也是？亚玟于1792年9月22日。拿破仑看完信后，觉得亚玟说的对，纵使国王和执政派不可靠，但其他也是可靠的。拿破仑回到科西嘉后，很快便被任命为科西嘉国民自卫军的营长，而此刻由于在瓦尔密打败了奥地利，普鲁士领导的联军，法国转入反攻。
1793年2月，科西嘉的总督也接到任命，总督马纳接到命令后立刻召集了部下，向他们宣读这份命令，上写道：命科西嘉总督马纳·休金斯上校即日进攻撒丁，夺取马达莱纳群岛，作为进攻撒丁的跳板。此令，法国陆军军部。当大家听完后，总督马纳发话了：“诸位也听到来自军部的命令了吧，商讨一下作战方案吧。”在座的有轻骑兵连的连长德拉上尉，海军少校莫拉德少校，炮兵营营长普罗修斯少校以及自卫军营长拿破仑上尉，“总督，我的骑兵连不可能在海上漂泊后立刻下地作战的。所以这次作战我不参加。”骑兵连长德拉上尉说道，“嗯，这倒是，其他几位呢？”马纳总督听到德拉上尉的话后也点点头。“海军没有任何问题，随时可以作战。”莫德拉少校回答道，“嗯，很好。”“我的炮兵大多都是陆地作战，不适应坐船，不过我听闻拿破仑上尉在军校里学习的是炮兵，我可以抽调一部分炮兵给他指挥。”普罗修斯少校摊摊手说道，“好吧，拿破仑上尉，你呢？”“总督阁下，我没有任何问题。”拿破仑见总督问他。立刻回答道，“很好，这次作战由莫德拉少校和拿破仑上尉进行，普罗修斯少校抽调五门炮给拿破仑上尉指挥，去吧。”“是。”众人一敬礼，退了出去。
拿破仑离开总督府后，立刻来到军营，召集他的部下和士兵们集合，拿破仑见部队集合完毕，便站在高台上，大声说道：“士兵们，建功立业的时刻到了，总督已经下达命令，进攻马达莱纳群岛，让他们见识一下，我们科西嘉人的战斗力不比法国人差。准备好了吗？”“必胜，必胜。”士兵们气势高昂的喊道，“出发。”拿破仑手一挥，士兵们依着队列向停泊运输船的方向走去，拿破仑正准备跟上，一位军官突然来到他身边，对他说道：“拿破仑上尉，炮兵少尉阿诺德向您报到。““你好，”拿破仑对他说道，“嗯？炮呢？”“火炮已经运往了运输船，我来向您报道的。”阿诺德说道，“哦，出发吧。”“是。”
“拿破仑上尉，你知道我们海军不能登陆作战，所以我只能为你提供炮火支援。”莫拉德少校在船上对拿破仑说道，
“没问题。谢谢你的帮助。”拿破仑说道。两天后，“报告，我们临近斯帕吉岛。”瞭望手大声说道。听到瞭望手的话，少校对拿破仑说道：“我在这里吸引注意，你去进攻吧。”“是。”拿破仑说完后立刻离开了，他带着一部分部队继续前进。“轰，轰。”他听到炮声，他知道是少校在攻击斯帕吉，但他没有停留，继续向前行。
“怎么回事？哪里开炮？”斯帕吉的驻军长官对其部下说道，“是法国军舰，中尉。”他的副官说道，“什么？”他很惊讶，不明白法国怎么突然打来了，但他也知道，法国正在进攻，“立刻汇报我们这里的情况。”“是。”
撒丁的驻军怎么样，拿破仑并不知晓，临近破晓时他的部队已经靠近了圣斯特凡诺岛了，他立刻命令道：“命令，火炮准备。”船靠近后，他立刻说道：“开火。”炮兵听到指令，立刻点火，“砰砰”炮弹在点燃后，立刻飞出了炮膛，“持续炮击。”他下达了这个命令，立刻对步兵们说道：“冲锋。”他率先冲出，士兵们紧随其后，向圣斯特凡诺岛前进。岛上的士兵还不知道怎么会事便被打死，也有个别撒丁的士兵回击，但并没有什么用，因为拿破仑的部队比他们多，回击也软弱无力，整个岛上没放几枪便被拿破仑占领。
“圣斯特凡诺，我已经夺下，准备扩大战果。”拿破仑写下这句话，交个他的副官，让他的副官前去交给海军少校莫拉德，他抬头发现不远处有一艘小船正在靠近，他突然有种不祥的预感。
