洪武十七年（1384），徐达在北平留守之时不幸得了背疽，不久稍微好转。然而次年二月（1385），病情随即加重，便随后去世。
徐达死后，朱元璋亲至葬礼以示悲疡，把他列为开国第一功臣，追封为中山王，谥号武宁，赠三世皆王爵。赐葬钟山之阴，御制神道碑文。当时圣上曾经称赞他说：“令行禁止。不居功自傲，不贪图女色财宝，处理问题不偏不倚，没有过失。当世有此美德者只一徐达。”
几年过去了，到了洪武二十六年(1393)，朱元璋终于腾出手来拿蓝玉开刀。由而，圣上并借口凉国公蓝玉谋反，株连杀戮功臣宿将的重大政治案件。因蓝玉案被株连杀戮者，当时称之为“蓝党”。该案与胡惟庸案合称为“胡蓝之狱”。经两个案件的发生，明初元功宿将已屠戮殆尽。
蓝玉，凤阳府定远县(今属安徽)人氏，开平王常遇春内弟。初隶常遇春帐下，有胆有谋，作战英勇，屡立战功。从由军镇抚积升至大都督府佥事。洪武十四年封永昌侯。随之，二十年拜为大将军，屯蓟州。二十一年捕鱼儿海(今内蒙古东部贝尔湖)之战，杀北元太尉蛮子之等，并降其众，获马驼牛羊十五万余，焚其甲仗蓄积；又破哈剌章营，获人畜甚多。
朱元璋对其宠遇甚隆，比之为卫青、李靖，封为凉国公。但蓝玉居功自傲，日益骄横跋扈。他蓄庄奴假子达数千人之多；乘势暴横，并仗势侵占东昌(今山东聊城)民田。
当御史按问时，竟将御史鞭打而驱走。北征时，私占大量珍宝驼马无算。回师夜经喜峰关，因守关吏未及时开门，竟纵兵毁关而入。以上这些他所作所为，引起圣上非常不满。然而，蓝玉犹不收敛，擅定军中将校升降与军队进止，导致朱元璋数次责备。也就洪武二十六年，锦衣卫指挥使蒋氏告发蓝玉谋反，下狱鞫讯之后，狱词称同景川侯曹震、鹤寿侯张翼、舳舻侯朱寿、定远侯王弼、东筦伯何荣及吏部尚书詹徽、户部侍郎傅友文等谋反，拟乘朱元璋藉田时发动叛乱。于此之下，朱元璋便遂族诛蓝玉之等，并株连蔓引，自公侯伯以至文武官员，被杀者约两万人。最后，朱元璋亲自着手诏布告之天下，并条例爰书为《逆臣录》。列名《逆臣录》者，有一公、十三侯、二伯。
洪武二十二年（1389年），蓝玉再次受命督修四川城池。
洪武二十三年（1390年）施南、忠建二宣抚司南蛮反叛，蓝玉奉命前往讨平。接着，又平定都匀（今属贵州），安抚司散毛诸洞，被加禄五百石，奉诏还乡。
洪武二十四年（1391年），朝廷再命蓝玉统领兰州、庄浪等七卫兵，追讨逃寇祁者孙，于是攻取西番罕东之地，当地首领哈昝等逃遁。时逢建昌指挥使月鲁帖木儿反叛，蓝玉又奉命率军征讨，当蓝玉率军赶到时，都指挥瞿能等已大破其众，月鲁逃往柏兴州。蓝玉乃派百户毛海诱捕月鲁父子，送往京城处死，又尽降其众。因此请求增设屯卫，太祖下诏许可。紧接着，蓝玉又复请征当地百姓为兵，讨伐朵甘、百夷，唯有这次圣上不许，蓝玉这才班师回朝。
由于中山、开平二王死后，蓝玉多次统领大军，也多次立功，朱元璋对其优礼有加。由此，蓝玉便日渐恣意骄横，蓄养了许多庄奴、义子，乘势横行霸道。因而，蓝玉曾强占东昌民田，被御史查问，蓝玉大怒，一下将御史赶走。
蓝玉北征南返时，夜抵喜峰关，守关官吏没能及时开门接纳，蓝玉便纵兵毁关，破门而入，皇上闻知，很不高兴。
这时，又有人说他与元主的妃子有私，致使元妃羞愧自尽，皇上为此切责蓝玉。当初，圣上本欲封蓝玉为梁国公，因蓝玉有这些过失，便将梁字改为凉，并命人将这些过失刻在世袭的凭证之上。可蓝玉犹不改过，侍奉皇上酒宴时口出傲语，军中将校升降进退，大权操于他一人，圣上因此多次责备之他。就蓝玉西征返回之后，被封为太子太傅，然而蓝玉却不愿位居宋、颍两公之下。他便不满说：“我难道不能做太师吗！”
此后上奏言事，朱元璋大多不采纳他的建议，蓝玉越发怏怏不乐。
当太子朱标还健在时，蓝玉因为与朱标有亲戚关系，经常友好往来。有一次，蓝玉从蒙古班师回朝，面见朱标时，他告知太子说：“我观察燕王朱棣在他的封地，一举一动与皇上一模一样。燕王不是一般人，迟早是要造反的，我找过人望他的气，有天子气象，你一定要小心。！”
朱标回答蓝玉：“燕王对待我非常恭敬，绝不会有这种事情。”
蓝玉向朱标解释：“我受到太子您的优待，所以秘密告诉您这件事的厉害，希望我的话不会灵验，更不被我说中。”此时，朱标没再说什么。
