鹿耳门：炮台二座（康熙五十六年奉文筑造，安炮十位。水师三营轮拨千总一员，带兵防守），墩台三座，望高楼一座。
柴头港海口：炮台一座（康熙五十六年奉文筑造，安炮三位。镇标左营拨兵防守）。
鲲身蛲港汛：炮台一座（康熙五十六年奉文筑造，安炮一位。水师中营拨兵防守），墩台一座，望高楼一座。
鲲身头汛：炮台一座（康熙五十六年奉文筑造，安炮一位。水师中营拨兵防守），墩台一座，望高楼一座。
澎湖炮台、墩台
新城一座（在妈祖宫西。伪时所筑，年久倒坏。康熙五十七年，闽浙总督觉罗蒲捐俸，委右营守备林亮重新建筑，安炮一十二位）。千把总一员（两营轮拨，带兵防守），步战守兵二十八名。
新城东港口：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。左营拨兵二十八名防守）。
挽门澳：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。左营拨兵二十八名防守），墩台一座。
水垵澳：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。左营拨兵二十八名防守），墩台一座。
将军澳：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。左营拨兵二十八名防守），墩台一座。
嵵里澳：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。左营拨兵一十五名防守），墩台一座。
风柜尾澳：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。左营拨兵一十名防守），墩台一座。
文良港澳：炮台一座（康熙五十六年修筑，安炮三位。左营拨兵一十名防守）。
新城西港口：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。右营拨兵二十八名防守）。
内堑澳：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。右营拨兵二十八名防守），墩台一座。
外堑澳：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。右营拨兵一十五名防守）。
小门澳：炮台一座（原有基址；康熙五十六年奉文重修，安炮三位。右营拨兵三十名防守）。
附澎湖各小澳屿：暗澳、小管港、东西卫、案山仔、洪蓝罩、网垵、金鸡澳、港尾、城前、中墩、后寮、镇海港、小赤嵌、崎头、吉贝屿（以上各澳屿俱有民居）、虎井屿、桶盘屿、鸡笼屿、四角仔、林投澳、香炉屿、阴屿、阳屿、椗齿屿、马鞍屿、铁砧屿、头巾屿、半平屿、碀仔屿、大屿、船帆屿、东吉、西吉、北崎屿、白沙仔屿、湾贝屿、目屿、空壳屿、姑婆屿、险礁屿、蓝笨仔屿、大烈屿、小烈屿、鸟屿、大仓仔屿、南白沙仔屿、花屿、猫屿（以上各澳屿俱无人居）。
