二十四日（辛卯），谕议政王军机大臣等：『徐宗干奏「汀、漳等处贼氛肆扰，派兵防剿」一折，据称「龙岩州踞贼日众、漳郡城贼未退，焚杀惨虐，并南靖、和平相继失守，现在檄饬丁翼带勇五百赴大田交界地方防堵；委赵均带勇千余赴宁洋、催林文察由同安一路进兵，并拨队前赴宁洋扼扎。惟盼浙军及援江各军早抵闽境」等语。前据左宗棠奏称：「闽省军情紧急，业经派令黄少春、刘明珍赴邵武，刘典赴汀州，高连升赴福州」；现在汀、漳贼势狓猖，着左宗棠分檄派出各员，迅带所部克期入闽。该督抵衢后，仍着体察情形，入闽督剿，迅扫逆氛。前因鲍超请假，谕令左宗棠等着即饬宋国永、娄云庆分带鲍起所部赴闽剿贼；着曾国藩再行檄催该员等迅速前进，归左宗棠调遣，毋失机宜。江省兵勇可以抽拨入闽者，沈葆桢此时当已酌量派往；即着迅催起程，毋稍延缓。左宗棠前派援闽之兵已有一万八千，而由江援闽者尚有宋国永数起，兵力已厚；徐宗干当饬闽省兵勇并力协剿，务将此股贼匪聚而歼旃。省城防守事宜，随时与英桂妥筹布置，毋稍大意。漳郡绅民皆欲齐心杀贼，义勇可嘉；徐宗干须乘机鼓励，以辅兵力。曾玉明内渡已抵厦门，即着催令统领水师会同现派之陆军相机兜剿，毋得专待援军，致贼延蔓。广东自平远失守后，近日军情未据毛鸿宾、郭嵩焘驰奏；现在该县是否克复？李福泰出省已抵何处？贼势如何？均着毛鸿宾等详细具奏。前据沈葆桢奏：广东嘉应、大埔均已失守；毛鸿宾等何以并未奏报？即着将各该州、县失守情形确实查奏，毋稍粉饰。此股贼匪虽已趋重闽疆，而粤省边隘多与闽省毗连，随处皆可回窜；毛鸿宾等尤当力筹防剿，不可稍有疏虞。其王文瑞、赵焕联两军，着毛鸿宾等分咨江西、湖南催令迅速赴粤援剿。刘连捷一军，昨据官文奏：「该员坐守皖境，并未入楚」等语。此时鄂、皖贼势已蹙，亟须一鼓作气，迅速歼除。着曾国藩迅催刘连捷等军克日拔队前进，会合楚师前后夹击；或僧格林沁、或官文调遣，均须饬令遵调，不得专候曾国藩到楚始行前进，致误事机。徐宗干折内称「由六百里驰递」，而发报时又用「六里百加紧」，殊属不合；嗣后务归画一，以符体制。将此由六百里各谕令知之』。
——以上见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百十九。
十一月十三日（庚戌），署福建台湾镇总兵官曾元福奏：续获匪首廖谈等；规定期驰赴漳属搜捕余匪，并顺道巡阅营伍。得旨：『着即会同丁曰健设法将洪欉、陈鮄等首从各匪迅速捕斩净尽，毋令稽诛。全台营务废弛，并着该署镇认真校阅，实力整饬。镇、道均经出省，当严饬陈懋烈于郡城防守弹压事宜妥当办理，不可稍涉大意』。
——见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百二十一。
十二月戊辰朔，谕议政王军机大臣等：『左宗棠奏「督师入闽，行抵浦城，现筹剿办情形」一折，闽省漳州各城均为贼踞，署提督林文察仓卒进剿，致后路被贼抄袭，兵勇败溃，林文察中枪阵亡；贼氛狓猖，泉、厦危急。高连升一军已抵泉州，着左宗棠、徐宗干飞檄该署提督迅率所部急趋同安，务期到在贼前，扼要防剿，以保泉、厦门户；并饬调赴长泰之黄少春等军合力兜剿，稳慎进攻，毋令贼踪再行滋蔓。刘典前队已抵宁化；王德榜一军由江西取道入闽，计已驰抵汀界。着即照左宗棠所筹，飞饬刘典所部先将汀州、连城、宁洋一带踞匪肃清，进攻龙岩之北；王德榜所部由汀州南趋上杭，进攻龙岩之西：总期联络遏截，妥筹分布，将龙岩踞逆悉数聚歼，以免复行旁窜。左宗棠因中路空虚，先拨随行四营驯赴延平，即率亲兵续进；着俟抵延平后，居中策应，分筹遏剿。即将办理情形，迅速奏闻。漳、龙一带贼势鸱张，各军分路环攻，能将该踞逆在闽境就地聚歼，自属上策；惟恐该匪被剿穷蹙，铤而走险，则回窜江西、旁窥粤境或潜踪入海，以致滋蔓难图，均在意计之中。毛鸿宾、郭嵩焘所派粤军前已越境收复武平等城，着仍懔遵前旨，迅饬方耀等军跟踪追剿，会合江西、闽、浙之军进规漳郡，殄除窜匪。其闽、粤滨海地方，并着左宗棠、徐宗干、毛鸿宾、郭嵩焘拨兵严防；倘任令匪踪入海剽掠，必惟该督等是问。江西缓闽之娄云庆等军现在行抵何处？着沈葆桢迅催前进，并由左宗棠、徐宗干探明催提，以厚兵力。沈葆桢务当严饬江防诸军严扼要隘，以杜匪踪回窜，毋稍疏忽。本日已降旨将刘典开缺，仍以二品顶带帮办福建军务。闽、浙剿匪事宜，即着左宗棠随时与刘典筹商办理，迅将逆氛扫荡，疆圉肃清，以副委任。将此由六百里各谕令知之』。
初五日（壬申），谕〔内阁）：『宗干奏：「闽省军务繁兴，请饬提、镇实缺各员赴任」等语。福建水师提督吴全美统带江南撤勇回粤，陆路提督郭松林现在江苏军营，汀州镇总兵沈俊德前在湖北军营，业经官文饬令带兵赴闽；着毛鸿宾、李鸿章、官文分饬各该员等迅速赴任。其漳州镇总兵李成谋、金门镇总兵王东华、建宁镇总兵张得胜亦均在军营带兵，着各该督、抚一体饬令即速赴闽，以专责成，毋再延缓』。
谕〔议政王军机大臣等〕：『徐宗干奏「漳州踞贼仆营，官兵失利；并高连升等军陆续前进，贼匪各怀猜忌」各折片，漳州踞贼出城，由好景山等处包抄万松关瑞香亭官军营盘，林文察中伤阵殁；曾玉明现饬该署提督部将许忠标等管带兵勇一千三百余名扼守江东桥要隘，曾玉明仍在三〈氵义〉河驻守。现在高连升已由同安前赴漳境，黄少春亦由泉州进扎漳城外之万松关等处；着左宗棠、徐宗干严檄派山各军协力扫荡，迅殄逆氛，廓清疆圉。福建陆路提督，即着黄少春暂行署理，以资统率。贼党各怀猜忌，城内连日互斗，自相残杀，当此有机可乘，如能迅速进兵，尤为事半功倍，即着该督、抚相机办理。汀州、龙岩各路，康国器一军驻扎离龙岩州城四十里之雁石地方，张恒祥移扎长汀河田，关镇国扼守上杭、连城，刘典前队已入汀境。昨据左宗棠奏：「拟令刘典攻龙岩之北、王德榜攻龙岩之西；并以中路空虚，先拨随行四营驰赴延平」。此时刘典等计皆次第到防，着左宗棠、徐宗干督饬闽、浙官军妥筹剿办，将失陷各城力图规复，务将此股逆匪就地殄除；毋令再行回窜江西、广东或潜踪入海，复肆蔓延，又成不了之局。将此由六百里各谕令知之』。
予福建漳州阵亡署提督林文察祭葬、世职加等，谥「刚愍」；游击李世进、同知平懋儒等祭葬、世职。
——以上见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百二十三。
二十七日（甲午），福建台湾道丁曰健奏：『探闻内地漳郡不守，移商镇臣迅速折回，妥筹防范』。得旨：『着即饬在事文武将洪欉、陈鮄等逆巢穴迅速攻拔，歼除群丑。仍严防漳郡逆匪，毋令偷渡勾结；并移知曾元福暂行折回，妥筹防范，毋稍疏懈』。
——见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百二十五。
同治四年（乙丑、一八六五）春正月十五日（辛亥），谕议政王军机大臣等：『曾元福奏「巨逆洪欉被炮震毙，全台肃清」一折，洪欉稔恶倡乱历有年所，现既被炮震毙，则其余漏网之徒不难歼灭净尽；着曾元福、丁曰健督饬在事员弁实力搜捕，务绝根株，毋留余孽。台湾地方虽经肃清，而漳州一带贼氛尚炽，难保不勾结台属匪类乘机煽惑。曾元福现已将抢斗各犯拿获惩办，以定人心；仍着会同丁曰健实力巡查，妥筹防范，毋令漳郡逆匪偷渡勾结。左宗棠、徐宗干务当督饬将弁兵勇迅将漳、龙等处踞逆迅速扫荡，俾免日久蔓延。台湾善后事宜，并着督率曾元福、丁曰健次第筹办；务令事事悉合机宜，以期一劳永逸。将此由五百里谕知左宗棠、徐宗干，并传谕曾元福、丁曰健知之』。
署福建台湾镇总兵官曾元福奏：舟师出洋巡缉，歼捦盗匪多名。得旨：『着仍饬派出之游绍芳等统带师船认真巡缉，务期搜捕净尽，毋令漳、台逸匪偷窜』。
以福建台湾府境肃清，予知县白鸾卿以同知直隶州知州用，与都司傅廷玉等均赏花翎，从九品李守谐蓝翎；余加衔、升叙有差。
——以上见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百二十七。
二月十四日（庚辰），补铸福建台湾镇总兵官印信；从总兵官曾元福请也。
——见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百三十。
二十三日（己丑），以记名按察使王德榜为福建按察使。
二十九日（乙未），谕〔议政王军机大臣等〕：『丁曰健奏「官军剿灭全股踞逆，并搜捕余匪妥办善后」一折，前据曾元福奏：「巨逆洪欉轰毙，全台肃清」；当经谕令曾元福、丁曰健督兵搜捕余匪，务绝根株。现在洪璠又被捦获，匪党洪戆古等均就歼戮，是台湾地万业已安定；着曾元福、丁曰健将善后一切事宜妥为筹办，并将逃散零匪悉数搜捦，以期除恶务尽，永奠民生。漳州贼氛虽挫，尚未就歼，深恐偷渡来台，勾结为患；着曾元福、丁曰健懔遵前旨，实力巡查，妥筹防范，毋稍疏虞。左宗棠、徐宗干务当督饬将弁乘屡胜之威，迅速攻复漳郡，剿灭匪众，俾免日久蔓延。将此由五百里谕知左宗棠、徐宗干，并传谕曾元福、丁曰健知之』。
以福建剿灭彰化内山踞逆，赏守备郑荣巴图鲁名号，知府叶宗元、都司张显贵等花翎，通判王修业等蓝翎；余升叙、开复有差。
——以上见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百三十一。
夏四月十一日（乙亥），谕〔议政王军机大臣等〕：『传谕署福建台湾镇总兵官曾元福、台湾道丁曰健：丁曰健奏「督军搜拏巨匪，并查办善后、妥筹防海及捦获嘉义逆首等犯正法」各折片，台湾彰化内山匪党，前经丁曰健督军剿办，将洪欉等股踞逆悉数歼除，台湾一律安定；现复严督各军分路搜剿，将著名股首庄明得、廖阿螺及洪欉之胞兄洪狗等捦获，其潜匿坪林山顶之悍贼洪花亦经官军用枪刺毙，其妻李氏身受铳伤，均枭取首级示众；复将草田庄等贼巢攻破，获匪多名，并捦获罗务等匪党，均先后讯明正法；嘉义匪首严办亦经曾元福派队歼毙，获党多名：剿办尚属认真。着曾元福、丁曰健查明所获要犯洪狗、洪花等是否的系正身？不得稍涉含混，致令漏网潜逃，复生他变。其在逃之要犯陈鮄及零散余匪，并着督饬地方文武员弁、团勇分路搜拏，以期尽绝根株，永弭后患。一切善后事宜，着一并妥为筹办。据丁曰健奏称「贼党四处逃匿，未便屯兵糜饷」；自应量为裁撤。即着斟酌情形，随时遣撤；仍酌留兵勇，将潜匿之匪实力搜捕，以期净尽。漳州贼匪未平，深恐勾结渡台为入海之计；着曾元福、丁曰健仍遵前旨，于海口要隘妥筹防范，毋令阑入台地。所有斩获嘉义股首严办等出力人员，着曾元福等查明保奏，毋许冒滥』。
以福建台湾全境肃清，赏道员丁曰健布政使衔、总兵官曾元福提督衔。
——以上见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百三十六。
五月十二日（丙午），以江苏候补副将富勒浑泰为福州副都统。
十八日（壬子），以福建台湾剿匪出力，赏道员曾云峰、都司李准芳等花翎，千总徐毓恩等蓝翎；余加衔、升叙、开复有差。
予福建台湾阵亡游击叶得茂等三十一员祭葬、世职，绅民兵勇一千三百十九名赏恤如例，一并附祁道员孔昭慈专祠。
——以上见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百三十九。
六月初十日（癸卯），以太仆寺少卿丁绍周为福建乡试正考官、国子监祭酒丁培镒为副考官。
——见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百四十四。
秋七月初三日（乙丑），暂署两江总督李鸿章奏：「丁忧署福建陆路提督郭松林呈请开缺，回籍终制』。得旨：『郭松林带兵素能得力，在江、浙等省屡着战功。着毋庸开缺，赏假四个月回籍；一俟假满，即前赴江苏军营听候调遣』。
——见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百四十七。
二十二日（甲申），谕内阁：『左宗棠奏「特参年力就衰之司道，请旨革职」一折，福建布政使张铨庆年迈健忘，左宗棠派令周开锡、吴大廷会办通省厘税局务，该藩司于各务一意推诿，于军饷缓急从不过问；钱粮为藩司衙门专责，并不设法催征，较上届更短解四分之三。团总诬瓯宁县民叶尾婢为土匪，前署瓯宁县知县赵人同未经讯供，即批饬正法；赵人同于署延平府任内经左宗棠撤任查办，案尚未结，而张铨庆复委该员代理建宁府事。该藩司于闰五月因病禀请开缺，用八百里排递；左宗棠以其不知缓急，未即批示。旋于六月具禀起病，实属昏愦胡涂，意存恋栈。督粮道周揆源，年已七十有余，衰庸充位，于时事漫不经心；擅那前任兴泉永道任内厘项划抵南米，与张铨庆互相辩驳，尤属卑鄙。张铨庆、周揆源均着即行革职，以肃官常。张铨庆尚有经手未完事件，着左宗棠饬令赶紧清厘，再行回籍』。
闽浙总督左宗棠奏：『遵查台湾逆匪陈哑狗，实由总兵曾元福生捦正法；前署提督林文察相距较远，以致奏报歧异』，报闻。又奏：『猎射凹营盘失陷，实因子药、砖石俱尽，营官熊常富不能设法堵御，致勇丁死亡过半；应请革职拏问』。从之。
以福建按察使王德榜为布政使、兴泉永道邓柚为按察使。
——以上见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百四十九。
九月初八日（庚午），修福建台湾战船；从巡抚徐宗干之请也。
——见「大清穆宗毅皇帝实录」卷一百五十三。
冬十一月十一日（壬申），予福建洋面阵亡游击陈韶舞祭葬、世职。
