二十一日（癸未），谕：『现在福康安前抵鹿仔港未及三月，即已屡破贼巢、擒获首逆，南、北两路全境荡平；所有官兵止系屯练及黔、楚官兵数千，何尝需用多兵。设如恒瑞所言，必须添兵六、七万，合之台湾原有之兵则至十余万矣；不独各省征发远近驿骚，且行走配渡需时，目下尚不能全数到彼。幸而朕洞烛几先，即令福康安、海兰察带同巴图鲁侍卫等前往；于恒瑞奏到时，又以其言不可信，谕令福康安坚持定见，速由鹿仔港前进。今得克期蒇功，设非朕令福康安、海兰察前往，即准其添调十余万大兵交常青、恒瑞二人统率，则伊等在彼守候、日事因循，仍前零星调拨，不特嘉义县城早为所陷，即郡城亦不可守，尚复成何事体！昨询据委解逆犯来京之都司张尔魁称：「贼匪攻围嘉义县城，势已危急；若福康安迟到三日，县城必不能守」。是该处城池得以无恙者，皆赖朕烛炳几先，命福康安等速往之效。前因柴大纪驻守嘉义将及半载，并据奏忍饥待援、不忍出城，朕嘉其忠义，逾格加恩，封以伯爵并赏银一万两。倘非福康安早到，嘉义县城已失，柴大纪为贼所害，既可以借口没于王事，罪状或不至于败露；岂不使贪纵营私、激成事端之人，非惟幸逃重戾，转得叨冒厚恩！兹幸福康安星往救应，嘉义县城得以无虞；而柴大纪之捏词守城、贪黩各劣迹，不旋踵而破露。可见朕恩不能滥受；骫法昧良之人亦必不为天理所容，终致败露。而恒瑞之从前妄请多兵，几至惑众误事者，不可不治其罪矣。福康安于袒护恒瑞一节，固有应得之咎；若非成此大功，亦岂能将伊宽恕。兹因其功大过小，是以录其功而宥其过。福康安嗣后惟当倍加儆省，益矢公慎，勉副朕教诲成全之意。至福康安此次前往督办剿捕事宜，遵照节次指示，调度有方、用心周密，真能不负任使，朕心深为嘉许！海兰察屡次督兵进剿，甚为奋勇可嘉；又将庄大田家属及逆犯庄大韭、林勇全数擒获，而筹办一切事宜均能井井有条。福康安、海兰察前已晋封公爵，赏给宝石帽顶、四围龙褂、四开气袍，着再各赏用紫缰。但福康安系将军，发纵指使皆其调度；福康安着加赏金黄腰带，并赏给福康安、海兰察金黄辫珊瑚朝珠各一盘，用示优异。和珅承旨书谕，于一切清、汉事件始终巨细无遗，勤劳懋着，前已晋封伯爵；着一体赏用紫缰，以昭嘉励』。
又谕曰：『山猪毛义民急公慕义，一载以来随同官兵剿杀贼匪，始终不懈，实属勇往可嘉！业经颁给御书扁额，特加旌异；并谕令将各义民等分别奖赏矣。所有管理义民之教授罗前荫，着加恩赏给同知职衔；曾中立业已赏给同知职衔，仍着赏戴花翎并加恩给予义勇巴图鲁名号：俱着送部引见。刘绳祖、黄衮、涂超秀、周敦纪着赏戴蓝翎，用示优奖。黄奠邦着赏给顺勇巴图鲁名号，一并送部引见。张元懃、王得禄并着加恩赏戴花翎。其曾中立、黄奠邦仍照加赏巴图鲁名号之例，各赏银一百两，以示奖劝』。
又谕：『此次台湾剿捕逆匪，调各省兵丁前往协剿，均属奋勉出力。现在逆首就擒，台湾全郡平定，因念该兵丁等远渡重洋，究为涉险；除福建本省及广东、浙江二省兵丁邻近海疆、渡洋素所经习，毋庸另行加恩外，其湖南、贵州、广西、四川屯练兵丁，俱应酌加恩赏。如该四省兵丁现已撤回，着李侍尧于该兵丁内渡时，每名各赏给银二两。如此旨到时，回兵已离闽境，各归原省；即着李侍尧咨各该督、抚按名赏给。又，广东兵一千名既暂行留驻台湾，且前次随征剿捕均极奋勉出力；并着福康安、徐嗣曾一体按名各赏给银二两』。
又谕：『此次押送逆首林爽文及贼眷、贼目之各员弁，沿途俱小心管押、行走迅速，且在台湾打仗杀贼均属奋勉。所有解员马龙、李芳园、张尔魁加恩以应升之缺升用，仍着各赏缎二匹；参领扎拉芬亦着赏缎二匹，护军校神奇保、守备丁世伟、邓应相、德恩及千总领催俱着各赏缎一匹。其护解兵丁，并着各该督、抚查明，各赏给一月钱粮，以示奖励』。
谕军机大臣等：『前据琅玕奏：「查抄柴大纪家产，询据该犯家属供出柴大纪在台湾任内，前后所得出息共有五、六万金」。若仅止如郑名邦所供得受两外委赃贿不过番银二百余圆，为数无几，焉能如此之多。此外卖官鬻爵，婪得多赃，必更有大于此者；不可不彻底根究。现在应行提讯人证内，微末员弁即行照例咨革外，如续有查出骫法营私之文武各员，即一面解任严讯、一面具折参奏，毋任稍有隐饰。此案并着徐嗣曾会同审办；徐嗣曾系本省巡抚、又与柴大纪系属同乡，柴大纪种种贪劣款迹，更无难查访得实也。至台湾额兵，节据该提、镇等严缉详查；昨又有旨谕李侍尧、徐嗣曾各在内外逐一严查办理，为时已久，何以尚未查有头绪？如查各该兵丁等遗失后有从贼情节、今见贼匪平定始行逃回者，一经拏获，应遵照前旨立行正法；其子弟亦不准挑兵食粮，以示惩儆。或竟系该处营制废弛，柴大纪营私舞弊作为虚粮冒饷、辄以伤亡遗失为辞，希图掩饰；尤不可不切实根究，入案办理，以彰其罪。至台湾营制尚须酌量添增改设，前已有旨令将一半换防、一半酌募本地义民、社番充补；既可以鼓励义勇，而内地兵丁仍有一半在彼防戍、分班轮换，其家属皆在内地，又可以互相牵制，于事似属两有裨益，自应仍遵前旨办理。惟是内地兵丁渡洋防守，若无恒产，恐所得钱粮不敷资给，仍不免借端扰累、营私贸易等事。或将入官叛产酌量拨给，作为帮贴，遇换班时仍着前后交代，收取余息，以资贴补当差，似为妥协；并着福康安等一并详悉妥议。再，逆匪伙党陈泮、吴钦二犯俱系有名头目，前已有旨令福康安等严密查拏；是否业经拏获？又，现据林劝等供出林爽文之族长林石亦尚无下落；并着福康安严拏务获。至福康安奏，庄大田之次子庄天畏虽讯据获犯供称已被生番杀死，但所言恐不足凭信；仍应一体严拏，毋任漏网。又据福康安奏，查勘凤山县城地势低洼，既不足以资控制，自应察看形势，酌量移建。此外如嘉义、彰化、淡水等处旧设竹城，是否亦应酌量迁移或另应添建砖石城垣之处？俱应乘此番整顿之时逐加复勘，筹划万全；着福康安会同徐嗣曾悉心妥办。其余一切善后事宜，头绪纷繁；均须福康安在台湾一手经理。福康安总须逐一办理完竣，再行起程；即在彼多驻数月，亦属无妨：总期于事有益，一劳永逸，方为不负任使也』。
又谕：『台湾值逆匪滋扰之后，村庄被毁、小民失业，自应妥为赈恤。但被难民人全借口粮接济，如果该处存留米石不敷办赈，此时无论折给三两，即再加一倍折给六两，小民虽有银两、无米可买，亦将何以得食！且前据李侍尧奏：「台湾军务告竣，合计本省拨运之米除应行筹备应用外，尚多米四十二万石。其各省未经运到闽境米石，均已咨明截留」等语。据所奏情形而论，是各省协拨米石尽足敷闽省军粮民食之用，即台湾应需办赈口粮亦可由内地运往；何以徐嗣曾又称台湾存米所剩无多，办理赈务又须折给银两，殊不可解！且现据福康安奏：「沿途查阅南路一带被贼滋扰地方，田亩多有荒芜；其东港以南禾苗畅茂，粤庄亦已栽插，现在雨旸时若，可冀丰收」。是台湾地方，其已经播种之处正复不少。且该处地土膏腴，一岁两熟；现在贼匪早经平定，被难民人已陆续归庄，即未经垦种者亦已照常耕种，可望有收。此时办理赈务，即照向例二两折给，足敷籴买；又何必遽议加增。向来台湾官吏侵渔成习，遇事即思浮冒，以图肥橐。今经大加惩创之后，无可藉端，又欲借折赈为辞，多增价值，预为冒销地步。福康安等不可不严行查察，毋任官吏捏词浮冒，堕其术中。如有此种情弊，即行指名严参办理』。
是月，两广总督孙士毅、广东巡抚图萨布奏：『赴台剿匪之粤东满、汉兵丁共一万三千五百名，现在分起内渡，军械稍有损坏即须补给。除鸟鎗一项已准闽浙督臣知会，现敷拨用；此外排刀、腰刀等项，必须另制。查从前收缴民间鸟鎗、尚有未经改铸，又各命、盗案内凶器均系熟铁；不须煅炼费工，较为铦利。已饬通省各衙逐一查缴、照数改造，并饬知粤西一体照办』。得旨：『诸凡妥协，知道了』。
——以上见「大清高宗纯皇帝实录」卷一千三百一。
夏四月癸巳朔，谕军机大臣等：『据孙士毅奏称：「查办会匪一案，初次饶平、海阳等县盘获之许阿协、尤扬等犯，讯据供系闽省民人勾引入会，但将手指作势，可免沿途抢夺」等语。此等奸徒若不及早搜拏、尽法惩治，则日聚日多，不知儆畏，必致日后又复滋生事端。现在逆匪荡平、兵威丕振，正应趁此时竭力查拏，务尽根株，亦不虑人心惊疑；庶可期奸徒敛迹，地方永臻宁谧。着交李侍尧、孙士毅督饬所属迅速实力严拏，勿留余孽。至孙士毅所奏各口岸盘获闽省形迹可疑船只二十余起，此内保无逆犯伙党，即实系偷越海洋者；亦应按律治罪。并着孙士毅严查究办，勿致疏纵』。
初二日（甲午），谕曰：『孙士毅奏：「据南澳、碣石、海门各营汛及饶平、惠来等县禀报台湾凯旋官兵内渡，由闽省厦门、蚶江、海门收口，因风漂泊到境者，计粤东、乍浦两处驻防及福建官兵已有八、九起；即饬令地方官料理，分别出境归伍」等语。前因各省兵丁派往台湾剿捕逆匪，远渡重洋，究为涉险；曾降旨令将湖广、贵州、广西、四川四省兵丁于内渡时每名各赏给银二两，又留驻台湾之广东兵一千名亦经一体赏给。至广东、浙江，福建本省兵丁，因其邻近海疆、渡洋素所经习，是以未经另行加恩。今孙士毅所奏：凯旋官兵，多有漂入粤境。此项兵丁由闽省内渡，因遇风漂入他省境界，即素习海洋，究属遭险，亦堪怜悯！所有台湾内渡漂入粤境官兵，着孙士毅查明：无论何省官兵，如前降谕旨内未经赏给者，即着每名赏给银二两；如已离粤境各回原籍，即着孙士毅行知各该督、抚按名赏给。嗣后如有凯旋官兵因风漂入他省，查明未经得赏者，俱照此赏给，以示朕格外轸恤之意』。
初七日（己亥），谕曰：『李侍尧等奏「拏获海洋盗犯萧梅等五名审明正法」一折，已批交该部矣。前因台湾逆匪滋事不法，奸民等辄敢乘机纠伙在洋面行劫，不可不严加惩创，曾降旨将沿海省分洋面行劫盗案人犯，无论首从，俱按律正法；俟剿捕事竣，再照旧办理。后又将情有可原之犯、其事在降旨以前者，从宽改为斩监候；俟满三年后，再行发遣。今闽省海洋劫盗之案不一而足，民风奸悍，非一时所能悛改。现在大功虽已告竣，除其余沿海各省仍照旧声请外，所有福建省海洋盗案，未便遽照旧例办理。如有拏获洋盗，仍照新例：无论首从，俱按律正法。俟两、三年之后，如果盗风渐戢，再行奏明照旧例声请，以示惩儆而靖海疆』。
十二日（甲辰），谕：『前因浙江温州、黄岩、福建海坛、汀州各镇总兵缺出，曾经降旨令福康安于军营打仗出力副将人员，酌量奏请补放。今据福康安奏：「副将格绷额、谢廷选、丁朝雄随营打仗及收复海口、防守要隘均各出力，俱堪胜专阃之任。此外，军营副将内并无堪胜总兵之人」等语。谢廷选着补授浙江温州镇总兵、格绷额补授福建汀州镇总兵、丁朝雄补授福建海坛镇总兵，以示鼓励。其浙江黄岩镇总兵员缺，着王柄署理；俟服阕之日，再行实授』。
又谕：『据琅玕奏：副都统职衔、黑龙江总管特尔敦辙行抵桐庐县，染患伤寒病症，医治不效，在舟次病故等语。特尔敦辙派往台湾剿捕逆匪尚属出力，业经加恩赏给副都统职衔。今自闽回京，于途次病故，殊属可悯；着加恩赏银二百两，以示轸恤』。
十三日（乙巳），谕：『此次剿捕台湾逆匪，所有派出带兵之巴图鲁侍卫等打仗杀贼，甚为奋勉。虽止系内地奸民滋事，非从前平定准噶尔、回部、金川可比；但数旬之间，生擒南、北两路逆首，台湾全郡荡平，办理甚为迅速。除军营出力人员业经降旨加恩分别升用外，今特尔敦辙虽已赏给副都统职衔，但在途病故，殊堪悯惜！其巴图鲁侍卫等，着福康安详悉查明：如有似此实在出力、劳绩懋著者，据实具奏，候朕降旨交部查明伊等所得功牌，酌量议给世职，以示鼓励勤劳、有加无已至意』。
十四日（丙午），谕：『此次剿捕台湾逆匪，大功迅速完竣；其带兵出力之巴图鲁侍卫等，昨已降旨交福康安查明劳绩懋著者奏明交部查照功牌酌给世职。此内鄂辉、舒亮、普尔普三人俱系大员，奋勉出力，朕所素知；即着军机大臣会同该部查明鄂辉等三人节次打仗劳绩，查照应得功牌酌量议给世职，以示酬庸延赏至意』。
